Dynamic evolution and different pathogenesis of HTLV-1 across multiple continents revealed by next generation sequencing technology

2020 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 18KK0230
• 研究機関: 熊本大学
• 研究代表者: 佐藤 賢文 熊本大学, ヒトレトロウイルス学共同研究センター, 教授 (70402807)
• 研究分担者: 上野 貴将 熊本大学, ヒトレトロウイルス学共同研究センター, 教授 (10322314) ; 勝屋 弘雄 佐賀大学, 医学部, 助教 (80632041)
• 研究期間 (年度): 2018-10-09 – 2021-03-31
• キーワード: HTLV-1 / 国際共同研究

研究実績の概要

本年度は研究計画に従って、以下の研究を遂行した。
イギリスとの共同研究に関しては、HIV-1, HTLV-1二重感染者の経時的血液検体を用いて、感染細胞のクローン性解析、ウイルス組み込み部位解析を行った。解析の結果、HIV-1, HTLV-1二重感染者血液検体では単感染者に比べ、HIV-1, HTLV-1のいずれの感染クローンも、クローン性増殖が顕著であった。また、重感染者ではＨＩＶ－１のウイルス組み込み部位が、遺伝子間領域に頻度が高いことも判明した。HTLV-1との二重感染による免疫学的機序の結果と考察された。結果をThe Journal of Infectious diseasesに投稿しアクセプトとなった。今年度内にImperial 大学Charles Bangham教授の研究グループとzoomによる合同研究ミーティングを行う、研究進捗の確認と意見交換を行った。また、日英の国際ウェブシンポジウムを開催して日本側２名、イギリス型２名の研究成果発表の機会を設けることで、国際共同研究の加速化を行った。
次に、アフリカのHTLV-1感染状況を探索するために、分担研究者上野と共にMuhimbili大学： Lyamuya教授との共同研究にて同地域のHIV感染者検体約294例の血清サンプルを取得し解析した結果、陽性者が０名で同地域のHTLV感染割合は極めて少ないという結果が判明した。
南アメリカにおけるHTLV-1感染者症例解析に関しては、新型コロナウイルス感染拡大の影響を受けて、現在休止中である。インペリアル大学：Bangham教授研究室から日本に受け入れたJocelyn Turpin博士はイギリス帰国後しばらくしてから、R02年度中にフランスリヨン大学に教員ポストを取得して移動した。レトロウイルス研究を継続中であり、今後の共同研究についてメールにて打ち合わせを継続して行っている。

研究成果

• [国際共同研究] Imperial/Glasgow(英国)
  • 国名: 英国
  • 外国機関名: Imperial/Glasgow
• [国際共同研究] Muhimbili University(タンザニア)
  • 国名: タンザニア
  • 外国機関名: Muhimbili University
• [国際共同研究] Dr. Juan P. Garrahan Pediatric Hospital(アルゼンチン)
  • 国名: アルゼンチン
  • 外国機関名: Dr. Juan P. Garrahan Pediatric Hospital
• [国際共同研究] リヨン大学(フランス)
  • 国名: フランス
  • 外国機関名: リヨン大学
• [雑誌論文] Clonality of HIV-1 and HTLV-1 infected cells in naturally coinfected individuals (2021)
  • 著者名/発表者名: Katsuya H, Cook L, Rowan AG, Melamed A, Turpin J, Ito J, Islam S, Miyazato P, Tan B, Matsuo M, Miyakawa T, Nakata H, Matsushita S, Taylor GP, Bangham CRM, Kimura S, Satou Y.
  • 雑誌名: The Journal of Infectious Diseases 巻: 0 ページ: 0
  • DOI: 10.1093/infdis/jiab202
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] A target enrichment high throughput sequencing system for characterization of BLV whole genome sequence, integration sites, clonality and host SNP (2021)
  • 著者名/発表者名: Ohnuki N, Kobayashi T, Matsuo M, Nishikaku K, Kusama K, Torii Y, Inagaki Y, Hori M, Imakawa K, Satou Y
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 11 ページ: 4521
  • DOI: 10.1038/s41598- 021-83909-3, 2021
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Impact of Human Leukocyte Antigen-Associated Polymorphisms on Variability of HIV-1 Accessory and Regulatory Proteins (2021)
  • 著者名/発表者名: Kamori Doreen、Hasan Zafrul、Carlson Jonathan、Kawana-Tachikawa Ai、Gatanaga Hiroyuki、Oka Shinichi、Ueno Takamasa
  • 雑誌名: AIDS Research and Human Retroviruses 巻: - ページ: -
  • DOI: 10.1089/AID.2021.0055
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] T-cell dysregulation in COVID-19 (2020)
  • 著者名/発表者名: Kalfaoglu B, Almeida-Santos J, Tye CA, Satou Y, Ono M
  • 雑誌名: Biochemical and Biophysical Research Communications 巻: 538 ページ: 204-210
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2020.10.079, 2020
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Blood and lymphatic systems are segregated by the FLCN tumor suppressor (2020)
  • 著者名/発表者名: Tai-Nagara I, Hasumi Y, Kusumoto D, Hasumi H, Okabe K, Ando T, Matsuzaki F, Itoh F, Saya H, Liu C, Mukouyama Y, Linehan W, Liu X, Hirashima M, Suzuki Y, Funasaki S, Satou Y, Furuya M, Baba M, and Kubota Y
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 11 ページ: 6314
  • DOI: 10.1038/s41467-020-20156-6, 2020
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] T-Cell Hyperactivation and Paralysis in Severe COVID-19 Infection Revealed by Single-Cell Analysis (2020)
  • 著者名/発表者名: Kalfaoglu B, Almeida-Santos J, Tye A C, Satou Y, Ono M
  • 雑誌名: Frontiers in Immunology 巻: 11 ページ: 589380
  • DOI: 10.3389/fimmu.2020.589380. eCollection 2020, 2020.
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Multi-omics investigation revealing comprehensive characteristics of HIV-1-infected cells in vivo (2020)
  • 著者名/発表者名: Aso H, Nagaoka S, Kawakami E, Ito J, Misawa N, Islam S, Tan B, Nakaoka S, Ashizaki K, Shiroguchi K, Suzuki Y, Satou Y, Koyanagi Y, Sato K
  • 雑誌名: Cell Reports 巻: 32 ページ: 107887
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2020.107887, 2020.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] An HIV-1 Nef genotype that diminishes immune control mediated by protective human leucocyte antigen alleles (2020)
  • 著者名/発表者名: Mwimanzi Francis、Ngare Isaac、Toyoda Mako、Mori Masahiko、Mann Jaclyn、Ndung’u Thumbi、Goulder Phillip、Ueno Takamasa
  • 雑誌名: AIDS 巻: 34 ページ: 1325～1330
  • DOI: 10.1097/QAD.0000000000002559
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Circulating HIV-1 Integrase Genotypes in Tanzania: Implication on the Introduction of Integrase Inhibitors-Based Antiretroviral Therapy Regimen (2020)
  • 著者名/発表者名: Masoud Salim、Kamori Doreen、Barabona Godfrey、Mahiti Macdonald、Sunguya Bruno、Lyamuya Eligius、Ueno Takamasa
  • 雑誌名: AIDS Research and Human Retroviruses 巻: 36 ページ: 539～543
  • DOI: 10.1089/AID.2020.0021
  • 査読あり / 国際共著
• [学会発表] Elucidation of HTLV-1 pathogenesis by single cell approach (2021)
  • 著者名/発表者名: Satou Y
  • 学会等名: Virtual Mini Symposium on HTLV-1 Leukemogenesis
  • 招待講演
• [学会発表] HTLV-1 感染病態解明へ向けた感染者血液のシングルセルトランスクリプトーム解析 (2020)
  • 著者名/発表者名: 佐藤 賢文
  • 学会等名: 日本生体防御学会学術総会
  • 招待講演
• [学会発表] HTLV-1プロウイルス内に存在する新規エンハンサー領域の分子メカニズム解析 (2020)
  • 著者名/発表者名: 松尾美沙希、Benjy Tan Jek Yang、佐藤賢文
  • 学会等名: 第43回日本分子生物学会年会
• [学会発表] HTLV-1プロウイルスにおける新規エンハンサーの特定と分子メカニズム解析 (2020)
  • 著者名/発表者名: 松尾美沙希
  • 学会等名: ウイルス学若手研究集会2020
  • 招待講演
• [学会発表] Exploration of T-cell Landscape in HTLV-1 Infection by Massive Single Cell Transcriptomics (2020)
  • 著者名/発表者名: Tan BYJ, Sugata K, Reda O, Matsuo M, Uchiyama K, Ono M, Satou Y
  • 学会等名: Frontiers in Single Cell Genomics (Virtual), Cold Spring Harbor Asia
  • 国際学会
• [学会発表] Investigation of HIV-1 latency mechanisms in THP-1 cells harbouring intact HIV-1 provirus (2020)
  • 著者名/発表者名: Rahman A, Ninomiya N, Matsuo M, Takeuchi H, Sugata K, Satou Y
  • 学会等名: 21st Kumamoto AIDS Seminar
• [学会発表] Utilizing ‘Tocky’ system for elucidating HIV-1 provirus dynamics and transcriptional determinants (2020)
  • 著者名/発表者名: Reda O, Monde K, Sugata K, Rahman A, Tan BYJ, Matsuo M, Ono M, Takeuchi H, Satou Y
  • 学会等名: 21st Kumamoto AIDS Seminar