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2021 年度 実績報告書

国際共同研究によるメカノバイオロジーを応用した細胞外小胞診断のための基盤構築

研究課題

研究課題/領域番号 18KK0251
研究機関大阪大学

研究代表者

石井 秀始  大阪大学, 医学系研究科, 特任教授(常勤) (10280736)

研究分担者 今野 雅允  東京理科大学, 研究推進機構 生命医科学研究所, 助教 (80618207)
浅井 歩  大阪大学, 産業科学研究所, 特任助教(常勤) (40783262)
出口 真次  大阪大学, 基礎工学研究科, 教授 (30379713) [辞退]
江口 英利  大阪大学, 医学系研究科, 教授 (90542118)
研究期間 (年度) 2018-10-09 – 2022-03-31
キーワード国際共同研究 / 細胞外小胞 / メカノバイオロジー / RNA / バイオマーカー
研究実績の概要

本プロジェクトの最終年度にあたり、国際協力の各メンバーとも、新型コロナ感染症のパンデミックにも関わらず、積極的に学術の交流と研究の推進に大きく貢献することができた。本研究においては、細胞外小胞 [EV]は患者の体液から採取可能であり、深部の病態や臓器間ネットワークを低侵襲に明らかにすることができる。リキッドバイオプシー技術としてさらに高精度化が求められている。多様性なEVの網羅的な解明を加速化するために、日本『RNA計測技術』を中心とした2つの国際共同研究、(1)日・シンガポール『EVの変形態(deformability)のメカノバイオロジー』と、(2)日欧『RNA情報科学』を強化し、国際的ネットワークの構築と若手人材育成を推進する。単粒子レベルのEVの表面性状と内部のRNA代謝の網羅的な情報から病態を分類する基本技術を完成させ、Precision Medicineに適した技術基盤を構築することを目的とする。①変形能(deformability)に基づいて1013/mlのEV粒子から大容量情報を収集する:シンガポール国立大学のLim, C.T.教授らの現地の微小流路の装置を利用してEVを分離して、私たちの技術でRNAのメチル化を計測し、高精度のプロファイリング情報を取得する。②医療応用に向けた情報基盤の構築:EU・ローマ大学のVecchione A. 教授らの現地のチームと協働し、EVとRNAの計測データの機械学習により、新規バイオマーカーを開発する。本年度はEV外形の性状として形、大きさ、電荷を計測し、またEV内部のmiRNAの配列と修飾は計測を行った。R3年度には新型コロナウイルス感染症のパンデミックにより国際間の移動は制限されていたが、オンラインでの学術情報が活発化した。

  • 研究成果

    (14件)

すべて 2022 2021

すべて 雑誌論文 (9件) (うち国際共著 5件、 査読あり 9件、 オープンアクセス 8件) 学会発表 (5件)

  • [雑誌論文] Cancer metabolism challenges genomic instability and clonal evolution as therapeutic targets2022

    • 著者名/発表者名
      Takeda Yu、Chijimatsu Ryota、Ofusa Ken、Kobayashi Shogo、Doki Yuichiro、Eguchi Hidetoshi、Ishii Hideshi
    • 雑誌名

      Cancer Science

      巻: 113 ページ: 1097~1104

    • DOI

      10.1111/cas.15279

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Nematode-applied technology for human tumor microenvironment research and development2022

    • 著者名/発表者名
      Luccio Eric、Kaifuchi Satoru、 Kondo Nobuaki、Chijimatsu Ryota、 Vecchione Andrea、 Hirotsu Takaaki、 Ishii Hideshi
    • 雑誌名

      Current Issues in Molecular Biology

      巻: ― ページ: ―

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Clinicopathological significance of MYL9 expression in pancreatic ductal adenocarcinoma2021

    • 著者名/発表者名
      Matsushita Katsunori、Kobayashi Shogo、Akita Hirofumi、Konno Masamitsu、Asai Ayumu、Noda Takehiro、Iwagami Yoshifumi、Asaoka Tadafumi、Gotoh Kunihito、Mori Masaki、Doki Yuichiro、Eguchi Hidetoshi、Ishii Hideshi
    • 雑誌名

      Cancer Reports

      巻: ― ページ: e1582

    • DOI

      10.1002/cnr2.1582

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Computational healthcare: Present and future perspectives (Review)2021

    • 著者名/発表者名
      Asai Ayumu、Konno Masamitsu、Taniguchi Masateru、Vecchione Andrea、Ishii Hideshi
    • 雑誌名

      Experimental and Therapeutic Medicine

      巻: 22 ページ: 1351

    • DOI

      10.3892/etm.2021.10786

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Methylosystem for Cancer Sieging Strategy2021

    • 著者名/発表者名
      Tatekawa Shotaro、Ofusa Ken、Chijimatsu Ryota、Vecchione Andrea、Tamari Keisuke、Ogawa Kazuhiko、Ishii Hideshi
    • 雑誌名

      Cancers

      巻: 13 ページ: 5088~5088

    • DOI

      10.3390/cancers13205088

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Single-molecule RNA sequencing for simultaneous detection of m6A and 5mC2021

    • 著者名/発表者名
      Ohshiro Takahito、Konno Masamitsu、Asai Ayumu、Komoto Yuki、Yamagata Akira、Doki Yuichiro、Eguchi Hidetoshi、Ofusa Ken、Taniguchi Masateru、Ishii Hideshi
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 11 ページ: 19304

    • DOI

      10.1038/s41598-021-98805-z

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Epithelial Cell Transformation and Senescence as Indicators of Genome Aging: Current Advances and Unanswered Questions2021

    • 著者名/発表者名
      Kitakaze Masatoshi、Chijimatsu Ryota、Vecchione Andrea、Kitagawa Toru、Doki Yuichiro、Eguchi Hidetoshi、Ishii Hideshi
    • 雑誌名

      International Journal of Molecular Sciences

      巻: 22 ページ: 7544~7544

    • DOI

      10.3390/ijms22147544

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Scent test using Caenorhabditis elegans to screen for early-stage pancreatic cancer2021

    • 著者名/発表者名
      Asai Ayumu、Konno Masamitsu、Ozaki Miyuki、Kawamoto Koichi、Chijimatsu Ryota、Kondo Nobuaki、Hirotsu Takaaki、Ishii Hideshi
    • 雑誌名

      Oncotarget

      巻: 12 ページ: 1687~1696

    • DOI

      10.18632/oncotarget.28035

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Impact of One-Carbon Metabolism-Driving Epitranscriptome as a Therapeutic Target for Gastrointestinal Cancer2021

    • 著者名/発表者名
      Takeda Yu、Chijimatsu Ryota、Vecchione Andrea、Arai Takahiro、Kitagawa Toru、Ofusa Ken、Yabumoto Masami、Hirotsu Takaaki、Eguchi Hidetoshi、Doki Yuichiro、Ishii Hideshi
    • 雑誌名

      International Journal of Molecular Sciences

      巻: 22 ページ: 7278~7278

    • DOI

      10.3390/ijms22147278

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] 転移と微小環境2021

    • 著者名/発表者名
      八代 正和、石井 秀始
    • 学会等名
      第30回日本がん転移学会学術集会・総会
  • [学会発表] エピトランスクリプトームと腫瘍多様性2021

    • 著者名/発表者名
      石井 秀始、HaoJian Zhang
    • 学会等名
      第80回日本癌学会学術総会
  • [学会発表] 早期膵がんのバイオマーカーとしての RNA 修飾2021

    • 著者名/発表者名
      今野 雅允、石井 秀始
    • 学会等名
      第80回日本癌学会学術総会
  • [学会発表] One Carbon代謝に基づく消化器がんの精密なバイオマーカー研究の新展開2021

    • 著者名/発表者名
      石井 秀始、安井 隆雄、松﨑 潤太郎
    • 学会等名
      第41回日本分子腫瘍マーカー研究会
  • [学会発表] 早期膵がんのスクリーニングに向けた線虫テスト2021

    • 著者名/発表者名
      浅井 歩、荒尾 泰子、千々松 良太、石井 秀始
    • 学会等名
      第3回日本生物診断研究会

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公開日: 2022-12-28  

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