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2019 年度 実施状況報告書

ピロリ菌の病原性と薬剤耐性を考慮したテーラーメード治療の確立に関する国際共同研究

研究課題

研究課題/領域番号 18KK0266
研究機関大分大学

研究代表者

山岡 吉生  大分大学, 医学部, 教授 (00544248)

研究分担者 松本 昂  大分大学, 医学部, 助教 (50609667)
矢原 耕史  国立感染症研究所, 薬剤耐性研究センター, 室長 (70542356)
研究期間 (年度) 2018-10-09 – 2022-03-31
キーワードヘリコバクター・ピロリ / 国際共同研究 / 薬剤耐性 / 病原性 / テーラーメイド
研究実績の概要

発展途上国では、ピロリ菌感染者すべてに除菌療法を行う経済力もなければ十分な内視鏡設備や内視鏡医も存在しない。ピロリ菌培養ができる施設も稀で、効果的な除菌療法も存在しない。そこで本事業では、アジアの発展途上国で胃癌多発国であるモンゴル、ブータン、ベトナムに焦点を当て、現地共同研究者と共同で、除菌を行うべき人および除菌法の選択に有用な未知の病原因子および薬剤耐性関連遺伝子の変異・多型の検索を、次世代シーケンサーを用いた菌側のゲノムワイド関連解析(GWAS)によって行う。最終的には、携帯型で安価な新規遺伝子解読技術(ナノポア:MinION)による、従来の内視鏡検査および細菌培養を必要としない迅速かつ非侵襲な病原因子および薬剤耐性関連遺伝子検出方法の開発に取り組む。2019年度は、ブータン、ベトナムに出向き、得られたピロリ菌を用いて、実際にナノポアによる解析を行った。さらに、すでに得られているモンゴルのピロリ菌を用いたナノポアによる解析を行った。その結果、ナノポアのデータと次世代シーケンサー(MiSeq)のデータを組み合わせることにより、PacBio次々世代シーケンサーで得られたデータと完全に一致することに成功、すなわちピロリ菌の全長ゲノムを得ることに成功した。また、周辺諸国との関連性を見ることも重要であり、南アジアに位置するインドに出向き、内視鏡検査を施行して、検体を採取した(税関通過の関係で、まだ検体はインドに保管してある)。さらに、タイ・カンボジア国境の街でも内視鏡検査を行い、検体を得ることができた。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

今年度は、ブータン、ベトナムの他、インド、タイ・カンボジア国境の街にも出向き、共同研究を充実することができた。さらに、ベトナム、モンゴルからの留学生がそれぞれ1名ずつ、大学院生として環境・予防医学講座で研究を続けており、さらに昨年卒業して博士学位をえたベトナム、モンゴルからの留学生もそれぞれ1名ずつおり、彼らと共同研究を続け、彼らは我々との研究の橋渡しを行っている。また、ブータンの共同研究者は、一昨年前に、ブータン国首相に選出され、政府を巻き込んだ共同研究。体制も確立しつつある。想定していた3カ国のみならず、比較対象としても近隣国との共同研究も進んでおり、今後、より研究が進むと考えられる。すでに業績の項にあるように多くの実績を上げている。特に、次世代シーケンサーを用いた薬剤耐性遺伝子変異検索で新しい遺伝子変異を発見、その成果は、ベトナムからの留学生が韓国で開催された国際学会で発表してYoung Awardを得ることができた。

今後の研究の推進方策

今年度は、薬剤耐性や病原因子にかかわる遺伝子変異を測定できる系を確立し、特にGWASを用いた解析を進めていく。また、モンゴル、ブータン、ベトナム実地での共同疫学研究も継続して、データの蓄積を目指したい。ブータンでは具体的な村(ダワカ村)を設定して、その村におけるピロリ菌感染率などを調査したところであるが、さらに、陽性者には内視鏡検査を行い、検体の採取、薬剤耐性の測定などを進める計画を立てているところである。さらに、前年度に引き続き、近隣諸国でのデータ収集も行いたいと考えている。

次年度使用額が生じた理由

ナノポアにおける解析については、ナノポア機器システムは、他研究費で購入していたために、新たな予算を用いる必要がなく、また今までに次世代シーケンスで得たデータの解析が中心となり、新たな予算を用いる必要がなかった。しかし、2020年度からは、実際に現地での共同研究が本格化することから、前年度からの繰り越し予算および新たな今年度の予算を合わせた資金での運用が必要である。

  • 研究成果

    (40件)

すべて 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (6件) 雑誌論文 (21件) (うち国際共著 13件、 査読あり 21件、 オープンアクセス 12件) 学会発表 (10件) (うち国際学会 5件、 招待講演 7件) 図書 (1件) 備考 (2件)

  • [国際共同研究] ブータン王立医科大学(ブータン)

    • 国名
      ブータン
    • 外国機関名
      ブータン王立医科大学
  • [国際共同研究] 108病院/チョーライ病院/ハノイ医科大学(ベトナム)

    • 国名
      ベトナム
    • 外国機関名
      108病院/チョーライ病院/ハノイ医科大学
    • 他の機関数
      3
  • [国際共同研究] モンゴル国立医科学大学/ウランバートル第3病院/モンゴル国立がん研究所(モンゴル)

    • 国名
      モンゴル
    • 外国機関名
      モンゴル国立医科学大学/ウランバートル第3病院/モンゴル国立がん研究所
    • 他の機関数
      5
  • [国際共同研究] ベイラー医科大学/テキサス大学ガルベストン 校(米国)

    • 国名
      米国
    • 外国機関名
      ベイラー医科大学/テキサス大学ガルベストン 校
  • [国際共同研究] ワルダ大学(インド)

    • 国名
      インド
    • 外国機関名
      ワルダ大学
  • [国際共同研究]

    • 他の国数
      14
  • [雑誌論文] E-test versus agar dilution for antibiotic susceptibility testing of Helicobacter pylori: a comparison study2020

    • 著者名/発表者名
      Miftahussurur Muhammad、Fauzia Kartika Afrida、Nusi Iswan Abbas、Setiawan Poernomo Boedi、Syam Ari Fahrial、Waskito Langgeng Agung、Doohan Dalla、Ratnasari Neneng、Khomsan Ali、Adnyana I. Ketut、Akada Junko、Yamaoka Yoshio
    • 雑誌名

      BMC Research Notes

      巻: 13 ページ: 22-1~22-6

    • DOI

      10.1186/s13104-019-4877-9

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Characterization of a novel Helicobacter pylori East Asian-type CagA ELISA for detecting patients infected with various cagA genotypes2020

    • 著者名/発表者名
      Dalla Doohan, Muhammad Miftahussurur, Yuichi Matsuo, et al., Yoshio Yamaoka
    • 雑誌名

      Medical Microbiology and Immunology

      巻: 209 ページ: 29-40

    • DOI

      10.1007/s00430-019-00634-5

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] H.pylori遺伝子解析による人類の起源について2020

    • 著者名/発表者名
      山岡吉生
    • 雑誌名

      The GI forefront

      巻: 15(2) ページ: 102-104

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Importance of Toll-like Receptors in Pro-inflammatory and Anti-inflammatory Responses by Helicobacter pylori Infection2019

    • 著者名/発表者名
      Nagashima Hiroyuki、Yamaoka Yoshio
    • 雑誌名

      Curr Top Microbiol Immunol

      巻: 421 ページ: 139~158

    • DOI

      10.1007/978-3-030-15138-6_6

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Role of Vonoprazan in Helicobacter pylori Eradication Therapy in Japan2019

    • 著者名/発表者名
      Sugimoto Mitsushige、Yamaoka Yoshio
    • 雑誌名

      Frontiers in Pharmacology

      巻: 9 ページ: 1560-1~1560-15

    • DOI

      10.3389/fphar.2018.01560

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Gastric Microbiota in Helicobacter pylori-Negative and -Positive Gastritis Among High Incidence of Gastric Cancer Area2019

    • 著者名/発表者名
      Gantuya Boldbaatar、El-Serag Hashem B.、Matsumoto Takashi、Ajami Nadim J.、Oyuntsetseg Khasag、Azzaya Dashdorj、Uchida Tomohisa、Yamaoka Yoshio
    • 雑誌名

      Cancers

      巻: 11 ページ: 504-1~504-12

    • DOI

      10.3390/cancers11040504

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Initial Trials With Susceptibility-Based and Empiric Anti-H. pylori Therapies in Mongolia2019

    • 著者名/発表者名
      Byambajav Tsogt-Ochir、Bira Namdag、Choijamts Gotov、Davaadorj Duger、Gantuya Boldbaatar、Sarantuya Tserenchimed、Sarantuya Gidaagaya、Enkhtsetseg Altangerel、Erdenetsogt Dungubat、Battulga Adiyasuren、Tserentogtokh Tegshee、Matsuhisa Takeshi、Yamaoka Yoshio、Oyuntsetseg Khasag
    • 雑誌名

      Frontiers in Pharmacology

      巻: 10 ページ: 394-1~394-9

    • DOI

      10.3389/fphar.2019.00394

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] CYP2C19 Genotype, CagA Genotype and Antibiotic Resistant Strain of Helicobacter pylori Infection2019

    • 著者名/発表者名
      Jeerayuth Auttajaroon, Peranart Chotivitayatarakorn, Yoshio Yamaoka, Ratha-Korn Vilaichone
    • 雑誌名

      Asian Pac J Cancer Prev.

      巻: 20 ページ: 1243-1247

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Analysis of risks of gastric cancer by gastric mucosa among Indonesian ethnic groups2019

    • 著者名/発表者名
      Miftahussurur Muhammad、Waskito Langgeng Agung、Syam Ari Fahrial、et al.、Yamaoka Yoshio
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 14 ページ: e0216670~70

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0216670

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Western-Type Helicobacter pylori CagA are the Most Frequent Type in Mongolian Patients2019

    • 著者名/発表者名
      Tserentogtokh Tegshee、Gantuya Boldbaatar、Subsomwong Phawinee、Oyuntsetseg Khasag、Bolor Dashdorj、Erdene-Ochir Yansan、Azzaya Dashdorj、Davaadorj Duger、Uchida Tomohisa、Matsuhisa Takeshi、Yamaoka Yoshio
    • 雑誌名

      Cancers

      巻: 11 ページ: 725-1~725-10

    • DOI

      10.3390/cancers11050725

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Changes of tight junction and interleukin‐8 expression using a human gastroid monolayer model of Helicobacter pylori infection2019

    • 著者名/発表者名
      Uotani Takahiro、Murakami Kosuke、Uchida Tomohisa、Tanaka Shingo、Nagashima Hiroyuki、Zeng Xi‐Lei、Akada Junko、Estes Mary K.、Graham David Y.、Yamaoka Yoshio
    • 雑誌名

      Helicobacter

      巻: 24 ページ: e12583~e12583

    • DOI

      10.1111/hel.12583

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] A Next-Generation Sequencing-Based Approach to Identify Genetic Determinants of Antibiotic Resistance in Cambodian Helicobacter pylori Clinical Isolates2019

    • 著者名/発表者名
      Tuan Vo Phuoc、Narith Dou、Tshibangu-Kabamba Evariste、Dung Ho Dang Quy、Viet Pham Thanh、Sokomoth Sin、Binh Tran Thanh、Sokhem Sok、Tri Tran Dinh、Ngov Seng、Tung Pham Huu、Thuan Ngo Phuong Minh、Truc Tran Cong、Phuc Bui Hoang、Matsumoto Takashi、Fauzia Kartika Afrida、Akada Junko、Trang Tran Thi Huyen、Yamaoka Yoshio
    • 雑誌名

      Journal of Clinical Medicine

      巻: 8 ページ: 858-1~858-15

    • DOI

      10.3390/jcm8060858

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Management of Antibiotic-Resistant Helicobacter pylori Infection: Perspectives from Vietnam2019

    • 著者名/発表者名
      Khien Vu Van、Thang Duong Minh、Hai Tran Manh、Duat Nguyen Quang、Khanh Pham Hong、Ha Dang Thuy、Binh Tran Thanh、Dung Ho Dang Quy、Trang Tran Thi Huyen、Yamaoka Yoshio
    • 雑誌名

      Gut and Liver

      巻: 13 ページ: 483~497

    • DOI

      10.5009/gnl18137

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Genome-wide mutation analysis of Helicobacter pylori after inoculation to Mongolian gerbils2019

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Rumiko、Satou Kazuhito、Shiroma Akino、Shimoji Makiko、Teruya Kuniko、Matsumoto Takashi、Akada Junko、Hirano Takashi、Yamaoka Yoshio
    • 雑誌名

      Gut Pathogens

      巻: 11 ページ: 45-1~45-6

    • DOI

      10.1186/s13099-019-0326-5

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Comparative study between Helicobacter pylori and host human genetics in the Dominican Republic2019

    • 著者名/発表者名
      Ono Takaaki、Cruz Modesto、Jimenez Abreu Jose A.、Nagashima Hiroyuki、Subsomwong Phawinee、Hosking Celso、Shiota Seiji、Suzuki Rumiko、Yamaoka Yoshio
    • 雑誌名

      BMC Evolutionary Biology

      巻: 19 ページ: 197-1~197-12

    • DOI

      10.1186/s12862-019-1526-9

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Helicobacter pylori Virulence Factors Exploiting Gastric Colonization and its Pathogenicity2019

    • 著者名/発表者名
      Ansari Shamshul、Yamaoka Yoshio
    • 雑誌名

      Toxins

      巻: 11 ページ: 677-1~677-26

    • DOI

      10.3390/toxins11110677

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Epitope peptides of Helicobacter pylori CagA antibodies from sera by whole-peptide mapping2019

    • 著者名/発表者名
      Ansari Shamshul、Akada Junko、Matsuo Yuichi、Shiota Seiji、Kudo Yoko、Okimoto Tadayoshi、Murakami Kazunari、Yamaoka Yoshio
    • 雑誌名

      Journal of Gastroenterology

      巻: 54 ページ: 1039~1051

    • DOI

      10.1007/s00535-019-01584-8

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] 海外Helicobacter pylori疫学調査―立案,調査からデータ解析に至るまで―第19回 アフリカでの疫学調査―その12019

    • 著者名/発表者名
      山岡吉生
    • 雑誌名

      Helicobacter Research

      巻: 23 ページ: 5-11

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 海外Helicobacter pylori疫学調査―立案,調査からデータ解析に至るまで―第19回 アフリカでの疫学調査―その2;コンゴ民主共和国2019

    • 著者名/発表者名
      山岡吉生
    • 雑誌名

      Helicobacter Research

      巻: 23 ページ: 169-177

    • 査読あり
  • [雑誌論文] H. pyloriが疾患を起こす機序および H. pyloriを用いた人類学的研究2019

    • 著者名/発表者名
      山岡吉生
    • 雑誌名

      日本ヘリコバクター学会誌

      巻: 21(1) ページ: 13-20

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Helicobacter pyloriの毒素VacAは多くの細胞に様々な影響を及ぼす2019

    • 著者名/発表者名
      永島裕之、山岡吉生
    • 雑誌名

      Helicobacter日本語抄訳版

      巻: 19 ページ: 4-8

    • 査読あり
  • [学会発表] The Japan-;Africa Collaborative Research on Helicobacter pylori Project2020

    • 著者名/発表者名
      Yoshio Yamaoka
    • 学会等名
      10th Kenya Medical Research Iinstitute Annual Scientific and Health Conference
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] ヘリコバクター・ピロリ; 病原性と人類との共移動2019

    • 著者名/発表者名
      山岡吉生
    • 学会等名
      第92回日本細菌学会総会
    • 招待講演
  • [学会発表] Performance of a novel Helicobacter pylori East Asian-type CagA ELISA for detecting patients infected with various cagA genotypes2019

    • 著者名/発表者名
      Doohan D, Miftahussurur M, Matsuo Y, Kido Y, Akada J, Waskito LA, Fauzia KA, Uchida T, Matsumoto T, Yamaoka Y
    • 学会等名
      第72回日本細菌学会九州支部総会・第56回日本ウイルス学会九州支部総会
  • [学会発表] ピロリ菌病原因子CagA血清抗体の主要抗原エピトープから考える免疫の作用点2019

    • 著者名/発表者名
      赤田順子, サムスルアンサリ, 塩田星児, 沖本忠義, 村上和成, 山岡吉生
    • 学会等名
      第10回癌・炎症と抗酸化研究会
  • [学会発表] 次世代の若手研究者をどう育てるか?~海外研究者育成の立場から~2019

    • 著者名/発表者名
      山岡吉生
    • 学会等名
      第10回癌・炎症と抗酸化研究会
    • 招待講演
  • [学会発表] ゲノムワイド関連解析を用いたピロリ菌病原因子の検索2019

    • 著者名/発表者名
      松本昂, 山岡吉生
    • 学会等名
      第51回九州微生物学研究会
    • 招待講演
  • [学会発表] The Japan-Africa collaborative research on Helicobacter pylori project2019

    • 著者名/発表者名
      Yoshio Yamaoka
    • 学会等名
      4th South Africa-Japan University Forum Conference
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Current knowledge of genomics for H. pylori from Far East2019

    • 著者名/発表者名
      Yoshio Yamaoka
    • 学会等名
      XXXII nd International Workshop on Helicobacter & Microbiota in Inflammation & Cancer
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Mechanistic insights of metronidazole resistance revealed by next-generation sequencing of Helicobacter pylori from Democratic Republic of Congo2019

    • 著者名/発表者名
      Tshibangu Evariste, Tuan VP, Patrick Ngoma, Pascal Tshiamala, Antoine Tshimpi, Matsumoto T, Akada J, Kido Y, Ahuka-Mundeke Steve, Mumba-Ngoyi Dieudonne, Dishashi Tumba, Yamaoka Y
    • 学会等名
      The 10th International Congress on Infectious Diseases
    • 国際学会
  • [学会発表] Evaluationg genomic susceptibility for gastric cancer2019

    • 著者名/発表者名
      Yoshio Yamaoka
    • 学会等名
      Asian Pacific Digestive Week
    • 国際学会 / 招待講演
  • [図書] 胃がんリスク層別化検診(ABC検診)2019

    • 著者名/発表者名
      三木 一正(編集) 山岡 吉生(分担)
    • 総ページ数
      234
    • 出版者
      南山堂
    • ISBN
      978-4-525-21281-0
  • [備考] 大分大学医学部環境・予防医学

    • URL

      http://www.med.oita-u.ac.jp/phealth2/index.html

  • [備考] 大分大学国際教育研究推進機構

    • URL

      http://in-gear.med.oita-u.ac.jp/

URL: 

公開日: 2021-01-27  

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