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2021 年度 実施状況報告書

ウイルスを摂動とする病態発現原理のマルチオミクス解析とその包括的理解

研究課題

研究課題/領域番号 18KK0447
研究機関東京大学

研究代表者

佐藤 佳  東京大学, 医科学研究所, 准教授 (10593684)

研究期間 (年度) 2019 – 2022
キーワードウイルス学
研究実績の概要

本年度では、生体内におけるHIV-1感染細胞の性状の多角的な解析に取り組んだ。HIV-1感染ヒト化マウスとマルチオミクス解析を実施し、生体内における 「真の」HIV-1感染細胞の特徴を多角的に描き出すことに成功した。本研究で用いた研究手法は、きわめて汎用的であり、さまざまなウイルス研究への応用が可能であ る。つまり本研究は、ウイルスと宿主の新たな関係性の一端を明らかにした研究であり、また、ウイルスと宿主の相互作用のさらなる解明や、エイズの制圧法の 開発に向けた基礎学術基盤の形成に直結する研究であると言える。以上の研究成果を、学術論文にまとめ、Cell Reports誌にcorresponding authorとして発表した。
さらに、本研究を通して構築した解析方法を駆使し、新型コロナウイルスに関する研究も実施し、複数の学術論文をcorresponding authorとして発表した。 具体的には、出現が続く新型コロナウイルスの変異株(デルタ株、ラムダ株、ミュー株、オミクロン株)のウイルス学的性状を包括的に解析し、それらを世界に先駆けて解明した。これらの研究成果は、NatureやNew England Journal of Medicine、Cell姉妹誌などに、corresponding authorとして発表した。
しかし、当課題で予定していた渡航と研究打ち合わせは、新型コロナウイルスのパンデミックにより実行できなかったため、オンライン会議を実施することで代替した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

新型コロナウイルスのパンデミックにより、予定していた海外研究機関への渡航が実行できなかったため。研究が停滞しないよう、オンライン会議を定期的に実施し、代替した。当課題は1年繰り越し、予定していた研究は今年度に完遂することを目標とする。

今後の研究の推進方策

新型コロナウイルスのパンデミックにより、予定していた海外研究機関への渡航が実行できなかったため。研究が停滞しないよう、オンライン会議を定期的に実施し、代替した。当課題は1年繰り越し、予定していた研究は今年度に完遂することを目標とする。

  • 研究成果

    (16件)

すべて 2022 2021

すべて 雑誌論文 (16件) (うち国際共著 13件、 査読あり 16件、 オープンアクセス 15件)

  • [雑誌論文] The SARS-CoV-2 Lambda variant exhibits enhanced infectivity and immune resistance2022

    • 著者名/発表者名
      Kimura Izumi et al.
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 38 ページ: 110218~110218

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2021.110218

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Altered TMPRSS2 usage by SARS-CoV-2 Omicron impacts infectivity and fusogenicity2022

    • 著者名/発表者名
      Meng Bo et al.
    • 雑誌名

      Nature

      巻: 603 ページ: 706~714

    • DOI

      10.1038/s41586-022-04474-x

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Attenuated fusogenicity and pathogenicity of SARS-CoV-2 Omicron variant2022

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Rigel et al.
    • 雑誌名

      Nature

      巻: 603 ページ: 700~705

    • DOI

      10.1038/s41586-022-04462-1

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Characterization of the Immune Resistance of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Mu Variant and the Robust Immunity Induced by Mu Infection2022

    • 著者名/発表者名
      Uriu Keiya et al.
    • 雑誌名

      The Journal of Infectious Diseases

      巻: 0 ページ: 0

    • DOI

      10.1093/infdis/jiac053

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Sarbecovirus ORF6 proteins hamper induction of interferon signaling2021

    • 著者名/発表者名
      Kimura Izumi、Konno Yoriyuki、Uriu Keiya、Hopfensperger Kristina、Sauter Daniel、Nakagawa So、Sato Kei
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 34 ページ: 108916~108916

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2021.108916

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Comprehensive Investigation on the Interplay between Feline APOBEC3Z3 Proteins and Feline Immunodeficiency Virus Vif Proteins2021

    • 著者名/発表者名
      Kosugi Yusuke、Uriu Keiya、Suzuki Narumi、Yamamoto Keisuke、Nagaoka Shumpei、Kimura Izumi、Konno Yoriyuki、Aso Hirofumi、Willett Brian J.、Kobayashi Tomoko、Koyanagi Yoshio、Ueda Mahoko Takahashi、Ito Jumpei、Sato Kei
    • 雑誌名

      Journal of Virology

      巻: 95 ページ: 0

    • DOI

      10.1128/JVI.00178-21

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Elucidation of the Complicated Scenario of Primate APOBEC3 Gene Evolution2021

    • 著者名/発表者名
      Uriu Keiya、Kosugi Yusuke、Suzuki Narumi、Ito Jumpei、Sato Kei
    • 雑誌名

      Journal of Virology

      巻: 95 ページ: 0

    • DOI

      10.1128/JVI.00144-21

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] SARS-CoV-2 spike L452R variant evades cellular immunity and increases infectivity2021

    • 著者名/発表者名
      Motozono Chihiro et al.
    • 雑誌名

      Cell Host & Microbe

      巻: 29 ページ: 1124~1136.e11

    • DOI

      10.1016/j.chom.2021.06.006

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] SARS-CoV-2 B.1.617 Mutations L452R and E484Q Are Not Synergistic for Antibody Evasion2021

    • 著者名/発表者名
      Ferreira Isabella A T M et al.
    • 雑誌名

      The Journal of Infectious Diseases

      巻: 224 ページ: 989~994

    • DOI

      10.1093/infdis/jiab368

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] IFITM proteins promote SARS-CoV-2 infection and are targets for virus inhibition in vitro2021

    • 著者名/発表者名
      Prelli Bozzo Caterina et al.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 12 ページ: 0

    • DOI

      10.1038/s41467-021-24817-y

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] SARS-CoV-2 B.1.617.2 Delta variant replication and immune evasion2021

    • 著者名/発表者名
      Mlcochova Petra et al.
    • 雑誌名

      Nature

      巻: 599 ページ: 114~119

    • DOI

      10.1038/s41586-021-03944-y

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] An additional NF-κB site allows HIV-1 subtype C to evade restriction by nuclear PYHIN proteins2021

    • 著者名/発表者名
      Bosso Matteo、Sturzel Christina M.、Kmiec Dorota、Badarinarayan Smitha Srinivasachar、Braun Elisabeth、Ito Jumpei、Sato Kei、Hahn Beatrice H.、Sparrer Konstantin M.J.、Sauter Daniel、Kirchhoff Frank
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 36 ページ: 109735~109735

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2021.109735

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Neutralization of the SARS-CoV-2 Mu Variant by Convalescent and Vaccine Serum2021

    • 著者名/発表者名
      Uriu Keiya、Kimura Izumi、Shirakawa Kotaro、Takaori-Kondo Akifumi、Nakada Taka-aki、Kaneda Atsushi、Nakagawa So、Sato Kei
    • 雑誌名

      New England Journal of Medicine

      巻: 385 ページ: 2397~2399

    • DOI

      10.1056/NEJMc2114706

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Enhanced fusogenicity and pathogenicity of SARS-CoV-2 Delta P681R mutation2021

    • 著者名/発表者名
      Saito Akatsuki et al.
    • 雑誌名

      Nature

      巻: 602 ページ: 300~306

    • DOI

      10.1038/s41586-021-04266-9

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Evolutionary plasticity of SH3 domain binding by Nef proteins of the HIV-1/SIVcpz lentiviral lineage2021

    • 著者名/発表者名
      Zhao Zhe、Fagerlund Riku、Tossavainen Helena、Hopfensperger Kristina、Lotke Rishikesh、Srinivasachar Badarinarayan Smitha、Kirchhoff Frank、Permi Perttu、Sato Kei、Sauter Daniel、Saksela Kalle
    • 雑誌名

      PLOS Pathogens

      巻: 17 ページ: 0

    • DOI

      10.1371/journal.ppat.1009728

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] The True Nature of Viruses Elucidated by Systems Virology2021

    • 著者名/発表者名
      Sato Kei
    • 雑誌名

      Frontiers in Virology

      巻: 1 ページ: 0

    • DOI

      10.3389/fviro.2021.808865

    • 査読あり / オープンアクセス

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公開日: 2022-12-28  

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