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2008 年度 実績報告書

イオン輸送体の構造生物学

研究課題

研究課題/領域番号 19002013
研究機関東京大学

研究代表者

豊島 近  東京大学, 分子細胞生物学研究所, 教授 (70172210)

研究分担者 小川 治夫  東京大学, 分子細胞生物学研究所, 准教授 (40292726)
津田 岳夫  東京大学, 分子細胞生物学研究所, 助教 (10345233)
石北 央  東京大学, 分子細胞生物学研究所, 助教 (00508111)
キーワードイオンポンプ / 膜蛋白質 / 結晶解析
研究概要

本年度の成果のうち最大のものはNa^+, K^+-ATPaseの結晶構造解析である。これはE2・2K^+・Pi状態の類似体の構造であり、一昨年にデンマークグループにより報告されたものと同一の状態であるが、分解能を2.4Aまで向上できた。その結果、βサブユニットとFXYD蛋白質のモデリングにも初めて成功し、FXYDモチーフの構造的意味が明らかになった。また、ほとんど同じ残基が関与するにもかかわらず、Ca^<2+>-ATPaseではH^+しか対抗輸送できないのにNa^+, K^+-ATPaseでは一価の陽イオンなら何でもよいことの理由も明らかになり、βサブユニットの寄与が本質的であること、コレステロールが関与することも明らかになった。この結果はNature誌上に発表される。また、強心配糖体として有名なウアバインの結合部位を明らかにすることにも成功した。これまでの多くの予想に反して、ウアバインは膜内に深く挿入されており、膜貫通ヘリックスの一部分をほどくことも判明した。
Ca^<2+>-ATPaseに関しては、米国グループから提供された、阻害剤BHQの派生物との共結晶を作製し、結合時の構造を決定した。また、結晶中の脂質二重膜の可視化のための技術開発をほぼ完成させ、4つの状態に関し脂質二重膜の構造を得たところ、膜貫通ヘリックスの運動と共に脂質二重膜も運動することが判明した。即ち、脂質二重膜は決して平坦な静的なものでは無いことが示された。
さらに、植物液胞膜由来のH^+ポンプであるPPaseの結晶化に成功した。植物のエネルギー代謝には非常に重要なものであり全く新規の構造である。現在結晶性の改良を行っている。

  • 研究成果

    (12件)

すべて 2008 その他

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 7件) 学会発表 (5件)

  • [雑誌論文] Structural aspects of ion pumping by Ca^<2+>-ATPase of sarcoplasmic reticulum2008

    • 著者名/発表者名
      C. Toyoshima
    • 雑誌名

      Arch. Biochem. Biophys 476

      ページ: 3-11

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Interaction sites among phospholamban, sarcolipin, and the sarco(endo) plasmic reticulum Ca^<2+>-ATPase2008

    • 著者名/発表者名
      T. Morita
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Comm. 369

      ページ: 188-194

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Intermediate phosphorylation reactions in the mechanism of ATP utilization by the copper ATPase (CopA) of Thermotoga maritima2008

    • 著者名/発表者名
      Y. Hatori
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem. 283

      ページ: 22541-22549

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Critical role of Val-304 in conformational transitions that allow Ca^<2+> occlusion and phosphoenzyme turnover in the Ca^<2+> transport ATPase2008

    • 著者名/発表者名
      C Xu
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem. 283

      ページ: 3297-3304

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Conformational fluctuations of the Ca^<2+>-ATPase in the native membrane environment-Effects of pH, temperature, catalytic substrates, and thapsigargin2008

    • 著者名/発表者名
      G. Inesi
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem 283

      ページ: 1189-1196

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of the sodium-potassium pump at 2.4 A resolution

    • 著者名/発表者名
      T. Shinoda
    • 雑誌名

      Nature (掲載確定)(in press)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] How Ca^<2+>-ATPase pumps ions across the sarcoplasmic reticulum membrane

    • 著者名/発表者名
      C. Tovoshima
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Acta (掲載確定)(in press)

    • 査読あり
  • [学会発表] A Molecular Machine at Works : The Case of the Calcium Pump Protein2008

    • 著者名/発表者名
      C. Toyoshima
    • 学会等名
      Maestro Lectures on Structure and Function of Membrane Proteins
    • 発表場所
      台湾・台北市
    • 年月日
      2008-11-20
  • [学会発表] How Ca^<2+> ATPase pumps ions across the salcoplasmic reticulum membrane2008

    • 著者名/発表者名
      C. Toyoshima
    • 学会等名
      第10回欧州カルシウム学会シンポジウム
    • 発表場所
      ベルギー・レーベン
    • 年月日
      2008-09-17
  • [学会発表] Crystallization of the calcium pump of skeletal muscle sarcoplasmic reticulum2008

    • 著者名/発表者名
      C. Toyoshima
    • 学会等名
      第21回国際結晶学連合会議
    • 発表場所
      大阪市
    • 年月日
      2008-08-29
  • [学会発表] A Molecular Machine at Works : The case of the calcium pump protein2008

    • 著者名/発表者名
      C. Toyoshima
    • 学会等名
      The Charles M. and Martha HITCHCOCK LECTURES
    • 発表場所
      アメリカ・バークレー
    • 年月日
      2008-05-01
  • [学会発表] How Ca^<2+>-ATPase Pump ion across the membrane2008

    • 著者名/発表者名
      C. Toyoshima
    • 学会等名
      SPring-8 GPCR Symposium
    • 発表場所
      兵庫県・佐用郡
    • 年月日
      2008-02-26

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公開日: 2010-06-11   更新日: 2016-04-21  

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