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2008 年度 実績報告書

膜貫通型プロテアーゼの細胞骨格への連結の構造的基礎

研究課題

研究課題/領域番号 19036014
研究機関奈良先端科学技術大学院大学

研究代表者

箱嶋 敏雄  奈良先端科学技術大学院大学, 情報科学研究科, 教授 (00164773)

研究分担者 平野 良憲  奈良先端科学技術大学院大学, 情報科学研究科, 助教 (50452529)
キーワードNEP / ERM / 膜タンパク質 / アダプタータンパク質 / シグナル伝達
研究概要

精製した組み替え型radixinのFERMドメイン(残基1-310)と一回膜貫通型I型膜タンパク質プロテアーゼMT1-MMP(membrane-typel 1 matrix metalloproteinase)の細胞質テールの合成ペプチド(20残基)との複合体を, 結晶化ロボット(HYDRA-II)を用いることで, 結晶化に成功した(a=b=122.7, c=128.3Å, P6_122、非対称単位に1複合体).SPring-8での放射光実験により, 2.4ÅのX線強度データを収集した. その後, 通常のMR法により位相決定して, 最終的にR_<work>=0.252/R_<free>=0.292までCNSとREFMACを用いて構造の精密化を行った.
得られたFERM-MT1-MMP複合体結晶中では, ペプチドの両親媒性領域は、FERMドメインのサブドメインAのβ2A-鎖と反平行β-β相互作用をしており, 疎水性残基がサブドメインAのくぼみにはまり込んでいた. この相互作用は, サブドメインCに結合する従来のICAM-2やCD44などの膜タンパク質と全く異なるものであった. この新事実は, ERMタンパク質が, FERMドメインを介して, MT1-MMPに結合するとともに, その基質である接着分子CD44とも結合できることを示唆している.
上記の研究結果を踏まえ, 現在, 論文を作成中であり, 学術雑誌に投稿予定である.

  • 研究成果

    (15件)

すべて 2009 2008

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 6件) 学会発表 (7件)

  • [雑誌論文] ジベレリン受容体の構造と機能の解明 : 植物ホルモン識別と標的タンパク質認識の機構2009

    • 著者名/発表者名
      箱嶋敏雄
    • 雑誌名

      細胞工学 28

      ページ: 162-163

  • [雑誌論文] 構造解析に基づくRhoキナーゼ阻害剤の開発2009

    • 著者名/発表者名
      合田圭吾
    • 雑誌名

      実験医学2009年3月増刊号「分子標的薬開発への挑戦」 27

      ページ: 172-178

  • [雑誌論文] A molecular mechanism of P-loop pliability of Rho-kinase investigated by molecular dynamic simulation2008

    • 著者名/発表者名
      Gohda, K.
    • 雑誌名

      J. Comput. Aided Mol. Des. 22

      ページ: 789-797

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis of the cytoplasmic tail of adhesion molecule CD43 and its binding to ERM proteins2008

    • 著者名/発表者名
      Takai, Y.
    • 雑誌名

      J. Mol. Biol. 381

      ページ: 634-644

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis for CD44 recognition by ERM proteins2008

    • 著者名/発表者名
      Mori, T
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem. 283

      ページ: 29602-29612

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallographic characterization of the radixin FERM domain bound to the cytoplasmic tail of membrane-type 1 matrix metalloproteinase (MT1-MMP)2008

    • 著者名/発表者名
      Terawaki, S
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr. F 64

      ページ: 911-913

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Gibberellin-induced DELLA recognition by the gibberellin receptot GID12008

    • 著者名/発表者名
      Murase, K.
    • 雑誌名

      Nature 456

      ページ: 459-464

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallographic characterization of the membrane-targeting domain ofRac-specific guanine nucleotide exchange factors Tiaml and 22008

    • 著者名/発表者名
      Terawaki, S.
    • 雑誌名

      Acta. Crystallogr. F 64

      ページ: 1039-1042

    • 査読あり
  • [学会発表] 植物核内受容体の作用機構2009

    • 著者名/発表者名
      村瀬浩司
    • 学会等名
      日本農芸化学会2009年度大会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2009-03-28
  • [学会発表] ジベレリンとその受容体、およびDELLAタンパク質複合体の結晶構造2009

    • 著者名/発表者名
      村瀬浩司
    • 学会等名
      第50回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2009-03-22
  • [学会発表] Structure of a novel membrane-targeting domain found in Rac GEF Tiam1/22009

    • 著者名/発表者名
      Toshio Hakoshima
    • 学会等名
      International Symposium on Molecular Soft Interactions in Biological Systems
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2009-01-23
  • [学会発表] Structural basis for CD44 recognition by ERM proteins2008

    • 著者名/発表者名
      Tomoyuld Mori
    • 学会等名
      The XXI Congress and Assembly of the International Union of Crystallography (IUCr2008)
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      20080824-25
  • [学会発表] ジベレリン受容体GID1による植物ホルモソおよびDELLAタンパク質認識の構造的基礎2008

    • 著者名/発表者名
      平野良憲
    • 学会等名
      BMB2008(第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会)
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2008-12-12
  • [学会発表] RacGEF Tiam1/2の新規なタンパク質標的認識ドメインの構造2008

    • 著者名/発表者名
      箱嶋敏雄
    • 学会等名
      BMB2008(第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会)シンポジウム「シグナル伝達タンパク質の分子認識研究の新展開」
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2008-12-11
  • [学会発表] 酵母Irelpによって部位特異的な切断を受けるRNAのNMR構造解析2008

    • 著者名/発表者名
      河原郁美
    • 学会等名
      第47回NMR討論会
    • 発表場所
      つくば
    • 年月日
      2008-11-14

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公開日: 2010-06-11   更新日: 2016-04-21  

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