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2008 年度 実績報告書

レグインスリン結合タンパク質のX線結晶構造解析

研究課題

研究課題/領域番号 19036025
研究機関横浜市立大学

研究代表者

橋本 博  横浜市立大学, 国際総合科学研究科, 助教 (40336590)

キーワードX線結晶構造解析 / 植物 / ダイズ / ニンジン / 防御応答 / 情報伝達
研究概要

レグインスリンはダイズの種子で存在が確認された37アミノ酸残基からなる生理活性ペプチドであり、その受容体タンパク質であるレグインスリン結合タンパク質(LBP)に特異的に結合する。ダイズLBPはチロシンをリン酸化する活性を有し、この活性はレグインスリンの結合によって促進される。また、レグインスリンによってニンジンカルスの成長が促進されることが報告されている。レグインスリン/LBP系の生理機能の詳細は解明されていないが、LBPは植物の原形質膜や細胞壁、細胞外に存在が確認されており、細胞内外の何らかの信号変換や病原菌に対する防御応答に関与すると考えられている。本研究では、ダイズおよびニンジン由来のLBPを研究対象とする。ダイズおよびニンジンLBPの立体構造をX線結晶構造解析によって明らかとし、細胞壁や原形質膜近傍におけるLBPのタンパク質間相互作用を構造生物学的に解明することを目指す。ダイズLBPはダイズ種子から精製し、ニンジンLBPはニンジン細胞の培養液から精製した。ニンジンおよびダイズLBPの結晶化に成功し、ニンジンLBPの結晶構造は重原子同型置換法を利用して決定することに成功した。重原子データの収集はPF-ARNW12Aで行った。ネイティブデータの収集はSPring8 BL41XUを利用し、最終的には0.95Åという超高分解能で構造精密化を行った。ダイズLBPとニンジンLBPのアミノ酸配列の相同性はおよそ30%である。ダイズLBPの結晶構造は、ニンジンLBPをモデル分子とした分子置換法を用いて1.9Å分解能で決定した。

  • 研究成果

    (22件)

すべて 2009 2008

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (17件)

  • [雑誌論文] Structural Basis for novel interactions between human translesion synthesis polymerases and proliferating cell nuclear antigen2009

    • 著者名/発表者名
      Asami Hishiki, Hiroshi Hashimoto, Tomo Hanafusa, Keijiro Kamei, Eiji Ohashi, Toshiyuki Shimizu, Haruo Ohmori, Mamoru Sato
    • 雑誌名

      J Biol Chem 284

      ページ: 10552-60

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of a novel REV1-interacting motif necessary for DNA polymerase kappa function2009

    • 著者名/発表者名
      Eiji Ohashi, Tomo Hanafusa, Keijiro Kamei, Ihnyoung Song, Junya Tomida, Hiroshi Hashimoto, Cyrus Vaziri, Haruo Ohmori
    • 雑誌名

      Genes Cells 14

      ページ: 101-11

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Initial crystallographic study of human PCNA in complex with a peptide containing the noncanonical PIP-box sequence of human DNA polymerase iota2008

    • 著者名/発表者名
      Asami Hishiki, Toshiyuki Shimizu, Tomo Hanafusa, Haruo Ohmori, Mamoru Sato, Hiroshi Hashimoto
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr Sect F 64

      ページ: 954-6

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallographic characterization of the N-terminal domain of a plant NADPH oxidase2008

    • 著者名/発表者名
      Takashi Oda, Hiroshi Hashimoto, Naoyuki Kuwabara, Kokoro Hayashi, Chojiro Kojima, Tsutomu Kawasaki, Ko Shimamoto, Mamoru Sato, Toshiyuki Shimizu
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr Sect F 64

      ページ: 867-9

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallographic study of G178S mutant of human proliferating cell nuclear antigen2008

    • 著者名/発表者名
      Asami Hishiki, Toshiyuki Shimizu, Aya Serizawa, Haruo Ohmori, Mamoru Sato, Hiroshi Hashimoto
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr Sect F 64

      ページ: 819-21

    • 査読あり
  • [学会発表] ニンジンレグインスリン結合タンパク質の結晶構造2009

    • 著者名/発表者名
      吉澤拓也、橋本博、平野久、清水敏之、佐藤衛
    • 学会等名
      第26回PFシンポジウム
    • 発表場所
      つくば
    • 年月日
      20090324-25
  • [学会発表] 植物NADPH oxidaseのN-末端ドメインのX線結晶構造解析2009

    • 著者名/発表者名
      小田隆、橋本博、桑原直之、明石知子、林こころ、児嶋長次郎、Wong Hann Ling、川崎努、島本功、佐藤衛、清水敏之
    • 学会等名
      第26回PFシンポジウム
    • 発表場所
      つくば
    • 年月日
      20090324-25
  • [学会発表] モンシロチョウ由来Pierisin-1のX線結晶構造解析2009

    • 著者名/発表者名
      平賀聖, 中野毅, 松本恭子, 山本真史, 杉村隆, 若林敬二, 橋本博, 清水敏之, 佐藤衛
    • 学会等名
      第26回PFシンポジウム
    • 発表場所
      つくば
    • 年月日
      20090324-25
  • [学会発表] ヒトREV7及びMAD2タンパク質の結合モチーフ配列の部分的オーバーラッピング2008

    • 著者名/発表者名
      花房朋, 村雲芳樹, 土生敏行, 原幸大, 橋本博, 大橋英治, 大森治夫
    • 学会等名
      BMB2008
    • 発表場所
      Kobe, Japan
    • 年月日
      20081209-12
  • [学会発表] Structural studies of G178S mutant of human PCNA2008

    • 著者名/発表者名
      Asami HISHIKI, Hiroshi HASHIMOTO, Yuji MASUDA, Aya SERIZAWA, Kenji KAMIYA, Haruo OHMORI, Toshiyuki SHIMIZU, Mamoru SATO
    • 学会等名
      第46回生物物理学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      20081203-05
  • [学会発表] Solution structure of Schizosaccharomyces pombe Swi5 studied by small-angle X-ray scattering and molecular dynamics simulations2008

    • 著者名/発表者名
      Yuichi Kokabu, Tomotaka Oroguchi, Tsutomu Yamane, Hiroshi Hashimoto, Toshiyuki Shimizu, Hiroshi Iwasaki, Mitsunori Ikeguchi
    • 学会等名
      第46回生物物理学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      20081203-05
  • [学会発表] Conformational change of F1-ATPase E subunit upon ATP binding studied by molecular dynamics simulations and X-ray scattering2008

    • 著者名/発表者名
      Tomotaka Oroguchi, Yasuyuki Kato-Yamada, Hiroshi Hashimoto, Satoru Unzai, Mitsunori Ikeguchi
    • 学会等名
      第46回生物物理学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      20081203-05
  • [学会発表] Analysis of tetrameric structure of TDH2008

    • 著者名/発表者名
      Itaru Yanagihara, Kumiko Nakahira, Hiroshi Hashimoto, Kiyohisa Ohnishi, Akihiro Morita, Takeshi Honda
    • 学会等名
      43th US-Japan Cholera and Other Bacterial Enteric Infections Joint Panel Meeting
    • 発表場所
      Fukuoka, Japan
    • 年月日
      20081117-19
  • [学会発表] Structural basis for novel interactions between human TLS polymerases and PCNA2008

    • 著者名/発表者名
      Asami HISHIKI, Hiroshi HASHI MOTO, Keijiro KAMEI, Tomo HANAFUSA, Eiji OHASHI, Toshiyuki SHIMIZU, Haruo OHMORI, Mamoru SATO
    • 学会等名
      6th 3R symposium
    • 発表場所
      Kakegawa, Shizuoka, Japan
    • 年月日
      20081017-30
  • [学会発表] Overlapping of human REV7-and MAD2-binding motif sequences2008

    • 著者名/発表者名
      Tomo Hanafusa, Yoshiki Murakumo Toshiyuki Habu, Kodai Hara, Hiroshi Hashimoto, Eiji Ohashim Haruo Ohmori
    • 学会等名
      6th 3R symposium
    • 発表場所
      Kakegawa, Shizuoka, Japan
    • 年月日
      20081017-30
  • [学会発表] Structural studies of human PCNA mutant, REV6-12008

    • 著者名/発表者名
      Asami Hishiki, Hiroshi Hashimoto, Yuji Masuda, Shinya Saijo, Aya Serizawa, Kenji Kamiya, Haruo Ohmori, Toshiyuki Shimizu, Mamoru Sato
    • 学会等名
      XXI Congress of the International Union of Cryst allography
    • 発表場所
      Osaka, Japan
    • 年月日
      20080823-31
  • [学会発表] Structural biology of a nuclear import of proteins by transportin 12008

    • 著者名/発表者名
      Mamoru Sato, Tsuyoshi Imasaki, Toshiyuki Shimizu, Hiroshi Hashimoto, Hanako Ishida, Daisuke Kamei, Michiyuki Yamada
    • 学会等名
      XXI Congress of the International Union of Cryst allography
    • 発表場所
      Osaka, Japan
    • 年月日
      20080823-31
  • [学会発表] The crystal structure of N-terminal domain of plant NADPH oxidase2008

    • 著者名/発表者名
      Takashi Oda, Hiroshi Hashimoto, Naoyuki Kuwabara, Kokoro Hayashi, Chojiro Kojima, Tsutomu Kawasaki, Ko Shimamoto, Mamoru Sato, Toshiyuki Shimizu
    • 学会等名
      XXI Congress of the International Union of Cryst allography
    • 発表場所
      Osaka, Japan
    • 年月日
      20080823-31
  • [学会発表] Crystallographic study of extracellular dermal glycoprotein of carrot2008

    • 著者名/発表者名
      Takuya Yoshizawa, Hiroshi Hashimoto, Toshiyuki Shimizu, Hisashi Hirano, Mamoru Sato
    • 学会等名
      XXI Congress of the International Union of Cryst allography
    • 発表場所
      Osaka, Japan
    • 年月日
      20080823-31
  • [学会発表] Crystallographic study of zinc finger domain of Ecol involved in sister chromatid cohesion2008

    • 著者名/発表者名
      Kodai Hara, Taro Kurosaki, Masakatsu Yagyu, Toshiyuki Shimizu, Itaru Yanagihara, Mamoru Sato, Hiroshi Hashimoto
    • 学会等名
      XXI Congress of the International Union of Cryst allography
    • 発表場所
      Osaka, Japan
    • 年月日
      20080823-31
  • [学会発表] Dynamics of Eco0109I studied by small-angle X-ray scattering and molecular dynamics simulation2008

    • 著者名/発表者名
      Tomotaka Oroguchi, Hiroshi Hashimoto, Toshiyuki Shimizu, Mamoru Sato, Mitsunori Ikeguchi
    • 学会等名
      XXI Congress of the International Union of Cryst alloeranhy
    • 発表場所
      Osaka, Japan
    • 年月日
      20080803-31
  • [学会発表] Structural basis for novel interactions between human translesion synthesis polymerases and PCNA2008

    • 著者名/発表者名
      Asami Hishiki, Hiroshi Hashimoto, Keijiro Kamei, Tomo Hanafusa, Eiji Ohashi, Toshiyuki Shimizu, Haruo Ohmori, Mamoru Sato
    • 学会等名
      The Joint 2nd Pacific Rim International Conference on Protein Science and 4th Asian-Oceania Human Proteome
    • 発表場所
      Cairns, Australia
    • 年月日
      20080622-26

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公開日: 2010-06-11   更新日: 2016-04-21  

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