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2008 年度 実績報告書

ガス分子により駆動される新規なセンサータンパク質の機能発現機構

研究課題

研究課題/領域番号 19045031
研究機関大学共同利用機関法人自然科学研究機構(共通施設)

研究代表者

青野 重利  大学共同利用機関法人自然科学研究機構(岡崎共通研究施設), 岡崎統合バイオサイエンスセンター, 教授 (60183729)

キーワードセンサータンパク質 / 酸素センサータンパク質 / シグナル伝達 / ヘムタンパク質
研究概要

酸素センサータンパク質HemAT-Bsによる選択的酸素センシング機構を明らかとするため、野生型および各種変異型HemAT-Bsの共鳴ラマンスペクトルを詳細に検討した。その結果、HemAT-Bs中のヘムに酸素が結合した場合と、CO、NOが結合した場合には、ヘム近傍の耕造が異なることが明らかとなった。HemAT-Bs中のヘムに結合した酸素には、ヘム遠位ポケットに存在するThr95が水素結合していることが分かった。一方、COあるいはNOが結合した場合には、COあるいはNOとヘムポケットに存在するアミノ酸残基との間で水素結合は形成されない。また、Thr95と酸素との間の水素結合形成には、ヘムプロピオン酸残基とヘム周辺に存在するHis86との水素結合が重要な役割を果たしていることが明らかとなった。ヘムプロピオン酸残基とHis86との水素結合は、ヘムに酸素が結合した場合にのみ形成され、COやNOの場合にはこの水素結合は形成されないことが分かった。His86がヘムプロピオン酸と水素結合を形成することによりCEループ(His86が存在しているCヘリックスと、Thr95が存在しているEヘリックスを連結しているループ)部分のコンフォメーション変化が誘起され、これによりさらにEヘリックスのコンフォメーション変化が誘起されるものと考えられる。このように、酸素結合により誘起されるヘム周辺、およびヘムポケット内での水素結合ネットワークのダイナミックな組換えが、HemAT-Bsによる選択的酸素センシング、ならびに酸素に応答したシグナル伝達に重要な役割を果たしていることが明らかとなった。

  • 研究成果

    (17件)

すべて 2009 2008

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (15件)

  • [雑誌論文] Hydrogen bonding interaction on the heme-bound ligand in the hemebased O_2 sensor protein2008

    • 著者名/発表者名
      Muneto Nishimura
    • 雑誌名

      J. Porphyrins & Phthalocyanines 12

      ページ: 142-148

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Metal-containing sensor proteins sensing diatomic gas molecules2008

    • 著者名/発表者名
      Shigetoshi Aono
    • 雑誌名

      Dalton Trans. 24

      ページ: 3137-3146

    • 査読あり
  • [学会発表] 時間分解共鳴ラマン分光法によるガスセンサータンパク質HemATの酸素脱離に伴うダイナミクスの観測2009

    • 著者名/発表者名
      吉田 祐
    • 学会等名
      日本化学会第89春季年会
    • 発表場所
      舟橋
    • 年月日
      2009-03-29
  • [学会発表] Fe-Sクラスタを有するニトロゲナーゼ転写制御因子VnfAにおけるクラスタの役割2009

    • 著者名/発表者名
      中島 洋
    • 学会等名
      日本化学会第89春季年会
    • 発表場所
      舟橋
    • 年月日
      2009-03-27
  • [学会発表] ニトロゲナーゼ転写制御因子VnfA-in vivoアッセイによる環境因子の同定2009

    • 著者名/発表者名
      吉満匡平
    • 学会等名
      日本化学会第89春季年会
    • 発表場所
      舟橋
    • 年月日
      2009-03-27
  • [学会発表] Regulation of the enzymatic activity of diguanylate cyclase by a globin-coupled sensor domain2009

    • 著者名/発表者名
      Shigetoshi Aono
    • 学会等名
      Korea-Japan Seminars on Biomolecular Sciences-Experiments and Simulations
    • 発表場所
      Seoul, Korea
    • 年月日
      2009-02-28
  • [学会発表] Heme-based gas sensor proteins as a possible material for a bioinorganic device2008

    • 著者名/発表者名
      Shigetoshi Aono
    • 学会等名
      The IUMRS International Conference in Asia 2008
    • 発表場所
      Nagoya, Japan
    • 年月日
      2008-12-10
  • [学会発表] Functional analysis of a nitrogenase transcriptional activator, VnfA from Azotobacter vinelandii2008

    • 著者名/発表者名
      K. Yoshimitsu
    • 学会等名
      The IUMRS International Conference in Asia 2008
    • 発表場所
      Nagoya, Japan
    • 年月日
      2008-12-10
  • [学会発表] A novel globin-coupled oxygen sensor protein responsible for the synthesis of a bacterial second messenger, cyclic di-GMP2008

    • 著者名/発表者名
      Shigetoshi Aono
    • 学会等名
      4th Asian Biological Inorganic Chemistry Conference
    • 発表場所
      Jeju, Korea
    • 年月日
      2008-11-13
  • [学会発表] Functional analyses of Fe3S4 cluster involved in VnfA, vanadium nitrogenase regulation protein2008

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Nakajima
    • 学会等名
      4th Asian Biological Inorganic Chemistry Conference
    • 発表場所
      Jeju, Korea
    • 年月日
      2008-11-13
  • [学会発表] ヘム含有型センサータンパク質によるガス分子センシングとシグナル伝達2008

    • 著者名/発表者名
      青野重利
    • 学会等名
      バイオ分子センサー連会研究プロジェクト レクチャーコース
    • 発表場所
      岡崎
    • 年月日
      2008-10-07
  • [学会発表] 新規なヘム含有型アルドキシム脱水酵素の反応機構2008

    • 著者名/発表者名
      澤井仁美
    • 学会等名
      第3回バイオ関連化学合同シンポジウム
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2008-09-19
  • [学会発表] ニトロゲナーゼ転写調節因子VnfAに含まれる鉄イオウの役割2008

    • 著者名/発表者名
      中島 洋
    • 学会等名
      第3回バイオ関連化学合同シンポジウム
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2008-09-19
  • [学会発表] HemDGC, a novel globin-coupled O_2 sensor, regulates synthesis of a bacterial second messenger (c-di-GMP)2008

    • 著者名/発表者名
      Hitomi Sawai
    • 学会等名
      4th International Conference on Metals and Genetics
    • 発表場所
      Paris, France
    • 年月日
      2008-07-22
  • [学会発表] The molecular mechanism of functional regulation of the heme-based sensor proteins2008

    • 著者名/発表者名
      Shigetoshi Aono
    • 学会等名
      5th International Conference on Porphyrins and Phthalocyanines
    • 発表場所
      Moscow, Russia
    • 年月日
      2008-07-11
  • [学会発表] ニトロゲナーゼ転写活性化因子VnfAの転写調節機構の解明2008

    • 著者名/発表者名
      中島 洋
    • 学会等名
      第35回生体分子科学討論会
    • 発表場所
      兵庫
    • 年月日
      2008-06-26
  • [学会発表] Structure and function of a globin-coupled enzyme that catalyzes the formation of a bacterial second messenger, c-di-GMP2008

    • 著者名/発表者名
      青野重利
    • 学会等名
      第18回金属の関与する生体関連反応シンポジウム
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2008-06-05

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公開日: 2010-06-11   更新日: 2016-04-21  

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