包括的トランスクリプトーム解析による新たなゲノム医学,創薬研究

2010 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 19109001
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 辻本 豪三 京都大学, 薬学研究科, 教授 (80172013)
• 研究分担者: 平澤 明 京都大学, 薬学研究科, 准教授 (70242633) ; 木村 郁夫 京都大学, 薬学研究科, 助教 (80433689)
• キーワード: 包括的トランスクリプトーム解析 / マイクロRNA / ネットワーク解析 / 超高感度DNAチップ / 発現プロファイル / 食道がん / 乳がん / バイオマーカー

研究概要

研究対象(各種がん株化細胞)に対する包括的トランスクリプトーム解析による疾患・治療関連のcRNA/ncRNA群の抽出、それらのネットワーク解析に基づく機能予測、細胞レベルにおける遺伝子発現調節の検証と生物機能学的効果の同定、更にこれらを統合する新たな生命制御機構の発見を目的とする。平成22年度は(1)cRNA/ncRNA包括的トランスクリプトーム解析:昨年度までに構造決定した約2,000種のncRNAに関して、通常のマイクロアレイDNAチップでは検出感度の問題から、低発現量のcRNA/ncRNA群に関してはその量的変化が正確にモニター出来ない可能性があることから、企業と共同研究開発した超高感度DNAチップをプラットフォームに用いて、主としてncRNA,それらの機能対象候補cRNAの量的変化をモニターする新たなチップ解析用ツール開発技術を用いてオリゴDNA合成により相補的プローブを合成してDNAチップに固相化し、miRNAを含む包括的トランスクリプトーム解析チップを作製した。このチップと従来型のチップの機能に関しての比較検証を行った。(2)解析の対象:対象としては、疾患関連cRNA/ncRNA群の解析実験には、各種患者検体より株化された食道がん細胞や乳がん細胞を用い、細胞増殖と各種抗がん剤による作用の経時変化と同時に採取された組織から抽出されるRNAの包括的トランスクリプトーム解析用DNAチップによる発現プロファイル解析を行い、更に各種薬物治療によりこれらの遺伝子群がどのような発現変動を行うかを経時的にモニターし、個体における発現型変動(生理、生化学パラメーター)との相関を一部解析した。食道がんよりバイオマーカー候補を同定し、知財化した。

研究成果

• [雑誌論文] MicroRNA-210 regulates cancer cell proliferation through targeting fibroblast growth factor receptor-like 1 (FGFRL1). (2011)
  • 著者名/発表者名: Tsuchiya S, Fujiwara T, Sato F, Shimada Y, Tanaka E, Sakai Y, Shimizu K, Tsujimoto G.
  • 雑誌名: The Journal of Biological Chemistry 巻: 286 ページ: 420-428
  • 査読あり
• [雑誌論文] MicroRNA-34a inhibits cell proliferation by repressing mitogen-activated protein kinase 1 during megakaryocytic differentiation of K562 cells. (2010)
  • 著者名/発表者名: Ichimura A, Ruike Y, Terasawa K, Shimizu K, Tsujimoto G.
  • 雑誌名: Molecular Pharmacology 巻: 77 ページ: 1016-1024
  • 査読あり
• [雑誌論文] Expression profiling of cumulus cells reveals functional changes during ovulation and central roles of prostaglandin EP2 receptor in cAMP signaling (2010)
  • 著者名/発表者名: Tamba S, Yodoi R, Morimoto K, Inazumi T, Sukeno M, Segi-Nishida E, Okuno Y, Tsujimoto G, Narumiya S, Sugimoto Y.
  • 雑誌名: Biochimie 巻: 92 ページ: 665-675
  • 査読あり
• [雑誌論文] New frontiers in gut nutrient sensor research : free fatty acid sensing in the gastrointestinal tract. (2010)
  • 著者名/発表者名: Miyauchi S, Hirasawa A, Ichimura A, Hara T, Tsujimoto G.
  • 雑誌名: Journal of Pharmacological Sciences 巻: 112 ページ: 19-24
  • 査読あり
• [雑誌論文] Salt-sensitive hypertension in circadian clock-deficient Cry-null mice involves dysregulated adrenal Hsd3b6. (2010)
  • 著者名/発表者名: Doi M, Takahashi Y, Komatsu R, Yamazaki F, Yamada H, Haraguchi S, Emoto N, Okuno Y, Tsujimoto G, Kanematsu A, Ogawa O, Todo T, Tsutsui K, van der Horst GT, Okamura H.
  • 雑誌名: Nature Medicine 巻: 16 ページ: 67-74
  • 査読あり
• [雑誌論文] Inhibition of heat shock protein 90 attenuates adenylate cyclase sensitization after chronic morphine treatment. (2010)
  • 著者名/発表者名: Koshimizu TA, Tsuchiya H, Tsuda H, Fujiwara Y, Shibata K, Hirasawa A, Tsujimoto G, Fujimura A.
  • 雑誌名: Biochemical and Biophysical Research Communications 巻: 392 ページ: 603-607
  • 査読あり
• [雑誌論文] Neuferricin, a novel extracellular heme-binding protein, promotes neurogenesis. (2010)
  • 著者名/発表者名: Kimura I, Nakayama Y, Konishi M, Kobayashi T, Mori M, Ito M, Hirasawa A, Tsujimoto G, Ohta M, Itoh N, Fujimoto M.
  • 雑誌名: Journal of Neurochemistry 巻: 112 ページ: 1156-1167
  • 査読あり
• [雑誌論文] The silkworm Green b locus encodes a quercetin 5-O-glucosyltransferase that produces green cocoons with UV shielding properties. (2010)
  • 著者名/発表者名: Daimon T, Hirayama C, Kanai M, Ruike Y, Meng Y, Kosegawa E, Nakamura M, Tsujimoto G, Katsuma S, Shimada T.
  • 雑誌名: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 巻: 107 ページ: 11471-11476
  • 査読あり
• [雑誌論文] Decreased susceptibility to salt-induced hypertension in subtotally nephrectomized mice lacking the vasopressin V1a receptor. (2010)
  • 著者名/発表者名: Oikawa R, Hosoda C, Nasa Y, Daicho T, Tanoue A, Tsujimoto G, Takagi N, Tanonaka K, Takeo S.
  • 雑誌名: Cardiovascular Research 巻: 87 ページ: 187-194
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structure-activity relationships of GPR120 agonists based on a docking simulation. (2010)
  • 著者名/発表者名: Sun Q, Hirasawa A, Hara T, Kimura I, Adachi T, Awaji T, Ishiguro M, Suzuki T, Miyata N, Tsujimoto G.
  • 雑誌名: Molecular Pharmacology 巻: 78 ページ: 804-810
  • 査読あり
• [学会発表] 糸球体腎炎におけるCK2α特異的阻害効果の検討 (2011)
  • 著者名/発表者名: 安江美里, 劉寧, 武井義則, 侯増力, 鈴木大和, 大野浩章, 仲西功, 木下誉富, 村田克美, 北浦和夫, 平澤明, 辻本豪三
  • 学会等名: 日本薬学会 第131年会
  • 発表場所: ツインメッセ静岡(静岡市)
  • 年月日: 2011-03-30
• [学会発表] 乳癌におけるmiR-200b/a/429 clusterのEpigenetics発現調節と上皮間葉形質転換への関与 (2011)
  • 著者名/発表者名: 伊藤考晃, 佐藤史顕, 清水一治, 辻本豪三
  • 学会等名: 日本薬学会 第131年会
  • 発表場所: ツインメッセ静岡(静岡市)
  • 年月日: 2011-03-30
• [学会発表] ドッキングシミュレーションに基づくGPR40アゴニストの構造活性相関 (2011)
  • 著者名/発表者名: 竹内理人, Qi Sun, 原貴史, 平澤明, 石黒正路, 鈴木孝禎, 宮田直樹, 辻本豪三
  • 学会等名: 第84回日本薬理学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜市)
  • 年月日: 2011-03-23
• [学会発表] 脂肪酸受容体GPR120機能不全は食餌誘発性の肥満及び脂肪肝を惹起する (2011)
  • 著者名/発表者名: 市村敦彦, 平澤明, 宮内諭, 木村郁夫, 鮎川公美子, 竹内理人, 辻本豪三
  • 学会等名: 第40回心脈管作動物質学会
  • 発表場所: かがわ国際会議場(高松市)
  • 年月日: 2011-02-05
• [学会発表] 代謝・循環ホットトピック (2011)
  • 著者名/発表者名: 辻本豪三, 田中利男
  • 学会等名: 第40回心脈管作動物質学会
  • 発表場所: かがわ国際会議場(高松市)(招待講演)
  • 年月日: 2011-02-05
• [学会発表] トランスポゾンを用いたランダム変異・プローブ導入によるGタンパク質共役受容体の機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 平澤明, 寺西文恵, 平井絢子, 伊津野彩子, 石田未弥, 淡路健雄, 辻本豪三
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸国際展示場(神戸市)
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] ゲノム科学からの創薬:新規脂肪酸受容体ファミリーの機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 辻本豪三
  • 学会等名: 第31回日本臨床薬理学会年会
  • 発表場所: 国立京都国際会館(京都市)(招待講演)
  • 年月日: 2010-12-03
• [学会発表] 薬理ゲノミクスの為のバイオマーカー探索 (2010)
  • 著者名/発表者名: 辻本豪三
  • 学会等名: 第31回日本臨床薬理学会年会
  • 発表場所: 国立京都国際会館(京都市)(招待講演)
  • 年月日: 2010-12-03
• [学会発表] 脂肪酸受容体GPR120の新規リガンド探索と構造活性相関 (2010)
  • 著者名/発表者名: 原貴史, Sun Qi, 平澤明, 木村邦夫, 足達哲也, 淡路健夫, 石黒正路, 鈴木孝禎, 宮田直樹, 辻本豪三
  • 学会等名: 第38回薬物活性シンポジウム・第20回日本循環薬理学会
  • 発表場所: 札幌市教育文化会館(札幌市)
  • 年月日: 2010-11-12
• [学会発表] ゲノム創薬を促進する個別化医療・PGx (2010)
  • 著者名/発表者名: 辻本豪三
  • 学会等名: 第123回日本薬理学会関東部会
  • 発表場所: 自治医科大学地域医療情報研修センター(栃木県下野市)(招待講演)
  • 年月日: 2010-10-23
• [学会発表] Extracellular kinase treatment induces regeneration of the mammalian central nervous system (2010)
  • 著者名/発表者名: 末廣健司, 武井義則, 辻本豪三
  • 学会等名: 第33回日本神経科学大会
  • 発表場所: 神戸コンベンションセンター(神戸市)
  • 年月日: 2010-09-03
• [学会発表] GPR120 mediates high-fat diet-induced adipocyte hypertrophy and obesity (2010)
  • 著者名/発表者名: 市村敦彦, 平澤明, 宮内諭, 辻本豪三
  • 学会等名: 16th World Congress of Basic and Clinical Pharmacology
  • 発表場所: Bella Center (Copenhagen, Denmark)
  • 年月日: 2010-07-21
• [学会発表] Free fatty acid receptors and drug discovery (2010)
  • 著者名/発表者名: 辻本豪三, 平澤明
  • 学会等名: 第42回日本動脈硬化学会学術集会
  • 発表場所: 長良川国際会議場(岐阜市)(招待講演)
  • 年月日: 2010-07-15
• [学会発表] 脂肪酸受容体ファミリーの機能と創薬 (2010)
  • 著者名/発表者名: 辻本豪三
  • 学会等名: 第1回北陸インクレチン研究会
  • 発表場所: ANA CROWNE PLAZAHOTEL金沢(金沢市)(招待講演)
  • 年月日: 2010-07-09
• [備考]
  • URL: http://gdds.pharm.kyoto-u.ac.jp/
• [産業財産権] 癌治療剤及び癌の予後判定方法 (2011)
  • 発明者名: 土屋創健, 辻本豪三, 清水一治, 嶋田裕, 塚田一博
  • 権利者名: 国立大学法人京都大学
  • 産業財産権番号: 特許、特願2010-083157
  • 出願年月日: 2011-03-31