• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2007 年度 実績報告書

ファイトケミカルゲノミクス:植物化学的多様性のゲノム基盤

研究課題

研究課題/領域番号 19201043
研究機関千葉大学

研究代表者

斉藤 和季  千葉大学, 大学院・薬学研究院, 教授 (00146705)

研究分担者 山崎 真巳  千葉大学, 大学院・薬学研究院, 准教授 (70222370)
野路 征昭  千葉大学, 大学院・薬学研究院, 准教授 (80271534)
高山 廣光  千葉大学, 大学院・薬学研究院, 教授 (90171561)
金谷 重彦  奈良先端科学技術大学院大学, 情報科学研究科, 教授 (90224584)
草野 都  独立行政法人理化学研究所, 植物科学研究センター, 研究員 (60415148)
キーワードメタボロミクス / トランスクリプトミクス / フラボノイド / シロイヌナズナ / ゲノム機能科学
研究概要

モデル植物であるシロイヌナズナのメタボロミクス研究において網羅的な代謝産物の単離,構造決定は必須である。そこで,植物メタボロミクスに応用することを目的としてシロイヌナズナの代謝物の同定を行った。シロイヌナズナの全草(20kg)をMeOHによって抽出し,得られた抽出物をH20に懸濁後,さらにn-hexane,EtOAc,CHCl_3及びn-BuOHで順次分配した。得られた粗抽出物のうちn-BuOH画分をHP20,Sephadex LH 20カラム,分取HPLCによって精製し,単離した化合物について各種機器分析によるスペクトルデータの解析を行った。その結果,新規化合物フラボノイドを含む33種の化合物を同定及び構造決定した。
また,シロイヌナズナのフラボノイド生合成の包括的解明を目的として,メタボロミクス/トランスクリプトミクスに基づいたフラボノイド生合成遺伝子の網羅的同定を試みた。フラボノイドの多様性に寄与する配糖化酵素遺伝子をターゲットとした遺伝子共発現解析を行い,配糖化酵素遺伝子の絞り込みを行った。最も相関の高い遺伝子について,一次配列による候補遺伝子の機能推定,該当T-DNA挿入変異体のフラボノイドターゲット分析,組換え蛋白質を用いた生化学実験を行い,フラボノール7位配糖化酵素をコードしていることを明らかにした。さらに,より包括的な遺伝子機能同定を視野に入れ,シロイヌナズナに存在するフラボノイドの網羅的分析とノンターゲットでのフラボノイド代謝相関遺伝子の絞り込みを行っている。

  • 研究成果

    (9件)

すべて 2008 2007 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (4件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Physiological roles of the β-substituted alanine synthase gene famil family in Arabidopsis2008

    • 著者名/発表者名
      Mutsumi Watanabe, Miyako Kusano, Akira Oikawa, Atsushi Fukushima, Masaaki Noji, and Kazuki Saito
    • 雑誌名

      Plant Physiol 146

      ページ: 310-320

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of a flavonol 7-O-rhamnosyltransferase gene determining flavonoid pattern in Arabidopsis by transcriptome coexpression and reverse genetics2007

    • 著者名/発表者名
      Keiko Yonekura-Sakakibara, Takayuki Tohge, Rie Niida, and Kazuki Saito
    • 雑誌名

      J.Biol Chem 282

      ページ: 14932-14941

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Transport of camptothecin in hairy roots of Ophiorrhiza pumila2007

    • 著者名/発表者名
      Supaart Sirikantaramas, Hiroshi Sudo, Takashi Asano, Mami Yamazaki, and Kazuki Saito
    • 雑誌名

      Phytochemistry 68

      ページ: 2881-2886

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Convergent evolution in the BAHD family of acyl transferases;identification and characterisation of anthocyanin acyl transferases from Arabidopsis thaliana2007

    • 著者名/発表者名
      Jie Luo, Yasutaka Nishiyama, Christine Fuell, Goro Taguchi, Katherine Elliott, Lionel Hill, Yoshikazu Tanaka, Masahiko Kitayama, Mami Yamazaki, Paul Bailey, Adrian Parr, Anthony J. Michael, Kazuki Saito and Cathie Marthin
    • 雑誌名

      Plant J 50

      ページ: 678-695

    • 査読あり
  • [学会発表] Camptothecin biosynthetic system-Pathway elucidation, genediscovery and self-resistance.2007

    • 著者名/発表者名
      K. Saito
    • 学会等名
      PSE (Phytochemical Society of Europe)Congress.Plants for Human Health in the Post-Genome Era.
    • 発表場所
      Helsinki,Finland
    • 年月日
      20070826-29
  • [学会発表] Roles of gene families of O-acetylserine thiol-lyase and serine acetyltransferase in Arabidopsis:Just redundancy or hidden secret?2007

    • 著者名/発表者名
      M.Watanabe, M. Kusano, A. Oikawa, Atsushi Fukush ima, M. Noji, K. Saito
    • 学会等名
      10th International Congress on Amino Acids and Proteins.
    • 発表場所
      Chalkidiki,Greece
    • 年月日
      20070821-26
  • [学会発表] Phytochemical genomics in Arabidopsis thaliana and towards non-model plants2007

    • 著者名/発表者名
      K. Saito
    • 学会等名
      Integration of metabolomics and transcriptomics.2007 Phytochemical Society of North America Annual Meeting.
    • 発表場所
      St.Louis,Missouri,USA.
    • 年月日
      20070721-25
  • [学会発表] Integration of transcriptomics and metabolomics for finding regulatory networks in plant metabolism.2007

    • 著者名/発表者名
      K. Saito
    • 学会等名
      Gordon Research Conferences‘Plant Metabolic Engineering
    • 発表場所
      Tilton,New Hampshire,USA.
    • 年月日
      20070715-20
  • [備考]

    • URL

      http://www.p.chiba-u.ac.jp/lab/idenshi/index.html

URL: 

公開日: 2010-02-04   更新日: 2016-04-21  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi