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2007 年度 実績報告書

湿度制御X線回折実験による蛋白質内部運動と水和構造変化の相関に関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 19204042
研究機関慶應義塾大学

研究代表者

中迫 雅由  慶應義塾大学, 理工学部, 教授 (30227764)

キーワード生物物理 / ナノマシン / 表面・界面物性 / 放射線・X線・粒子線 / 生体分子
研究概要

蛋白質結晶の湿度制御装置の開発と散漫散乱回折パターンの収集
今年度の交付金額では、申請書に記したリガク社Free Mounting Systemを購入することが不可能なため、結晶の湿度制御が可能となる装置群を自作し、X線回折湿度制御下の蛋白質の溶媒チャンネル体積の可逆的増減についての基本技術を確立することとなった。装置の自作においては、湿度制御装置を購入し、試料周辺ハウジングの製作、結晶観察のための装置を製作した。また、これまでの結晶急速凍結技術とは異なる結晶ハンドリング技術の確立が不可欠となるため、関連技術の調査を行った。また、グルタミン酸脱水素酵素、アリールマロン酸脱炭酸酵素、フォトトロピンなどの蛋白質を精製・結晶化し、湿度制御下に置いて期待される散漫散乱回折強度パターンを大型放射光実験施設において収集した。この散漫散乱パターン解析のための計算コードを開発中である。
蛋白質の水和構造解析
結晶化してもなお、一部のフラグメントやドメインが大きな揺らぎを有する蛋白質のグルタミン酸脱水素酵素、アリールマロン酸脱炭酸酵素の結晶構造解析を実施し、蛋白質のダイナミクスと水和構造の相関に関する結晶学的研究を行った。

  • 研究成果

    (12件)

すべて 2008 2007

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (7件)

  • [雑誌論文] タンパク質の水和構造を探る2008

    • 著者名/発表者名
      中迫 雅由
    • 雑誌名

      Molecular Science Journal 2

      ページ: A0022

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 非弾性散乱の生物への応用について2008

    • 著者名/発表者名
      城地 保昌、中迫 雅由、難波 啓一
    • 雑誌名

      日本結晶学会誌 50

      ページ: 78-82

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray diffraction experiments of arylmalonate decarboxylase from Alcaligenes bronchisepticus2008

    • 著者名/発表者名
      Masayoshi Nakasako, Rika Obata, Ryosuke Okubo, Shyuichi Nakayama, Kenji Miyamoto and Hiromichi Ohta
    • 雑誌名

      Acta Crystallographica Section F (掲載確定)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis of LOV1-dimerization of phototropin 1 and 2 from Arabidopsis thaliana2008

    • 著者名/発表者名
      Masayoshi Nakasako, Kazunori Zikihara, Daisuke Matsuoka, Hitomi Katsura and Satoru Tokutomi
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Biology (掲載確定)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal Structures of Blasticidin S Deaminase(BSD):Implications for Dynamic Properties of Catalytic Zinc2007

    • 著者名/発表者名
      Takashi Kumasaka, Masaki Yamamoto, Makio Furuichi, Masayoshi Nakasako, Aik-Hong Teh, Makoto Kimura, Isamu Yamaguchi, Tatzuo Ueki
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry 228

      ページ: 37103-37111

    • 査読あり
  • [学会発表] Simulation on the X-ray speckle patterns of a hydrated protein molecule with conformational variations2007

    • 著者名/発表者名
      Sakamoto Keita, Ikeguchi Mitsunori, Nakasako Masayoshi
    • 学会等名
      日本生物物理学会第45回年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-23
  • [学会発表] Search fbr determinants regulating the quatemary structures of Fv ffagments of antibodies through a database analysis2007

    • 著者名/発表者名
      Miyazawa Masashi and Nakasako Masayoshi
    • 学会等名
      日本生物物理学会第45回年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-23
  • [学会発表] Prediction of Hydration Structures around polar protein atoms through a data-base analysis2007

    • 著者名/発表者名
      Matsuoka Daisuke and Nakasako Masayoshi
    • 学会等名
      日本生物物理学会第45回年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-23
  • [学会発表] Clystal structures of LOV1 domains in Arabidopsis phototropin 1 and 22007

    • 著者名/発表者名
      Masayoshi Nakasako, Daisuke, Matsuoka, Kazunori Zikihara, Hitomi Katsura and Satoru Tokutomi
    • 学会等名
      日本生物物理学会第45回年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-23
  • [学会発表] Observation of the surface of glutamate dehydrogenase crystals by atomic fbrce microscopy2007

    • 著者名/発表者名
      Sato Tsunero and Nakasako Masayoshi
    • 学会等名
      日本生物物理学会第45回年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-23
  • [学会発表] X線溶液散乱で何が分かるのか?なぜ放射光なのか?2007

    • 著者名/発表者名
      中迫 雅由
    • 学会等名
      第2回X線溶液散乱研究会-SPring-8における放射光X線溶液散乱-
    • 発表場所
      理化学研究所播磨研究所
    • 年月日
      2007-10-11
  • [学会発表] 蛋白質表面に吸着した水分子と蛋白質運動の相関について2007

    • 著者名/発表者名
      中迫 雅由
    • 学会等名
      日本物理学会第62回年次大会
    • 発表場所
      北海道大学
    • 年月日
      2007-09-23

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公開日: 2010-02-04   更新日: 2016-04-21  

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