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2010 年度 研究成果報告書

魚類多様性の進化ダイナミクス:網羅的大規模分子系統樹からのアプローチ

研究課題

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研究課題/領域番号 19207007
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物多様性・分類
研究機関東京大学

研究代表者

西田 睦  東京大学, 大気海洋研究所, 教授 (90136896)

研究分担者 馬渕 浩司  東京大学, 大気海洋研究所, 助教 (50401295)
宮 正樹  千葉県立中央博物館, 動物研究科, 上席研究員 (30250137)
研究期間 (年度) 2007 – 2010
キーワード進化 / 魚類 / ミトコンドリアDNA / 多様性 / 分子系統 / ウナギ / メダカ / トゲウオ
研究概要

脊椎動物最大の種数(約27,000種)を擁する魚類が地球上でどのように多様化してきたのかを解明することを目指し、さまざまな魚類のミトコンドリアゲノム全長配列を決定した。その配列データに基づいて重要な多くの魚類グループの分子系統解析を大規模に行った結果、魚類の多様化について多くの斬新な知見を得ることができた。

  • 研究成果

    (30件)

すべて 2011 2010 2009 2008 2007 その他

すべて 雑誌論文 (23件) (うち査読あり 23件) 学会発表 (4件) 図書 (1件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Multiple invasions into freshwater by pufferfishes (Teleostei : Tetraodontidae) : a mitogenomic perspective2011

    • 著者名/発表者名
      Yamanoue Y., 他
    • 雑誌名

      PLoS ONE 6

      ページ: e17410

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Remarkable morphological stasis in an extant vertebrate despite tens of millions of years of divergence2011

    • 著者名/発表者名
      Lavou S., 他
    • 雑誌名

      Proc.Roy.Soc.B 278

      ページ: 1003-1008

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Transfer RNA gene arrangement and codon usage in vertebrate mitochondrial genomes : a new insight into gene order conservation2010

    • 著者名/発表者名
      Satoh T.P., 他
    • 雑誌名

      BMC Genomics 11

      ページ: 479

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Deep-ocean origin of the freshwater eels2010

    • 著者名/発表者名
      Inoue J.G., 他
    • 雑誌名

      Biol.Lett. 6

      ページ: 363-366

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mitochondrial phylogenomics of anchovies (family Engraulidae) and recurrent origins of pronounced miniaturization in the order Clupeiformes2010

    • 著者名/発表者名
      Lavoue S., M.Miya, M.Nishida
    • 雑誌名

      Mol.Phylogen. Evol. 56

      ページ: 480-486

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Evolutionary history of anglerfishes (Teleostei : Lophiiformes) : a mitogenomic perspective2010

    • 著者名/発表者名
      Miya M., 他
    • 雑誌名

      BMC Evol.Biol. 10

      ページ: 58

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Higher and lower-level relationships of the deep-sea fish order Alepocephaliformes (Teleostei : Otocephala) inferred from whole mitogenome sequences2009

    • 著者名/発表者名
      Poulsen J.Y., 他
    • 雑誌名

      Biol.J.Linn.Soc. 98

      ページ: 923-936

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Divergence time of the two regional medaka populations in Japan as a new time scale for comparative genomics of vertebrates2009

    • 著者名/発表者名
      Setiamarga D.H.E., 他
    • 雑誌名

      Biol.Lett. 5

      ページ: 812-816

    • 査読あり
  • [雑誌論文] The historical biogeography of the freshwater knifefishes using mitogenomic approaches : A Mesozoic origin of the Asian notopterids (Actinopterygii : Osteoglossomorpha)2009

    • 著者名/発表者名
      Inoue J.G., Y.Kumazawa, M.Miya, M.Nishida
    • 雑誌名

      Mol.Phylogen.Evol. 51

      ページ: 486-499

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Reconstructing the phylogenetic relationships of the earth's most diverse clade of freshwater fishes-Order Cypriniformes (Actinopterygii : Ostariophysi) : A case ctudy using multiple nuclear loci and the mitochondrial genome2009

    • 著者名/発表者名
      Mayden R.L., 他
    • 雑誌名

      Mol.Phylogen.Evol. 51

      ページ: 500-514

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Explosive speciation of Takifugu : another use of fugu as a model system for evolutionary biology2009

    • 著者名/発表者名
      Yamanoue Y., 他
    • 雑誌名

      Mol.Biol.Evol. 26

      ページ: 623-629

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Unique patterns of pelvic fin evolution : a case study of balistoid fishes (Pisces : Tetraodontiformes) based on whole mitochondrial genome sequences2009

    • 著者名/発表者名
      Yamanoue Y., 他
    • 雑誌名

      Mol.Phylogen.Evol. 50

      ページ: 179-189

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Stickleback phylogenies resolved : Evidence from mitochondrial genomes and 11 nuclear genes2009

    • 著者名/発表者名
      Kawahara R., 他
    • 雑誌名

      Mol.Phylogen.Evol. 50

      ページ: 401-404

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Deep-sea mystery solved : astonishing larval transformations and extreme sexual dimorphism unite three fish families2009

    • 著者名/発表者名
      Johnson G.D., 他
    • 雑誌名

      Biol.Lett. 5

      ページ: 235-239

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Interrelationships of Atherinomorpha (medakas, flyingfishes, killifishes, silversides, and their relatives) : The first evidence based on whole mitogenome sequences2008

    • 著者名/発表者名
      Setiamarga D., H.E., 他
    • 雑誌名

      Mol.Phylogen.Evol. 49

      ページ: 598-605

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mitogenomic evaluation of the historical biogeography of cichlids toward reliable dating of teleostean divergences2008

    • 著者名/発表者名
      Azuma Y., 他
    • 雑誌名

      BMC Evol.Biol. 8

      ページ: 215

    • 査読あり
  • [雑誌論文] A new perspective on phylogeny and evolution of tetraodontiform fishes (Pisces : Acanthopterygii) based on whole mitochondrial genome sequences : Basal ecological diversification?2008

    • 著者名/発表者名
      Yamanoue Y., 他
    • 雑誌名

      BMC Evol.Biol. 8

      ページ: 212

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Monophyly, phylogenetic position and inter-familial relationships of the Alepocephaliformes (Teleostei) based on whole mitogenome sequences2008

    • 著者名/発表者名
      Lavoue S., 他
    • 雑誌名

      Mol.Phylogen.Evol. 47

      ページ: 1111-1121

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Interrelationships of the 11 gasterosteiform families (sticklebacks, pipefishes, and their relatives) : a new pespective based on whole mitogenome sequences from 75 higher teleosts2008

    • 著者名/発表者名
      Kawahara R., 他
    • 雑誌名

      Mol.Phylogen.Evol. 46

      ページ: 224-236

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mitochondrial genome and a nuclear gene indicate a novel phylogenetic position of deep-sea tube-eye fish (Stylephoridae). Ichthyol2007

    • 著者名/発表者名
      Miya M., 他
    • 雑誌名

      Res. 54

      ページ: 323-332

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Phylogenetic position of tetraodontiform fishes within the higher teleosts : Bayesian inferences based on 44 whole mitochondrial genome sequences2007

    • 著者名/発表者名
      Yamanoue Y., 他
    • 雑誌名

      Mol.Phylogen.Evol. 45

      ページ: 89-101

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Phylogenetic relationships among anchovies, sardines, herrings and their relatives (Clupeiformes), inferred from whole mitogenome sequences2007

    • 著者名/発表者名
      Lavoue S., 他
    • 雑誌名

      Mol.Phylogen.Evol. 43

      ページ: 1096-1105

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Independent evolution of the specialized pharyngeal jaw apparatus in cichlid and labrid fishes2007

    • 著者名/発表者名
      Mabuchi K., M.Miya, Y.Azuma, M.Nishida
    • 雑誌名

      BMC Evol.Biol. 7

      ページ: 10

    • 査読あり
  • [学会発表] 魚類の進化に関する分子系統学的研究2010

    • 著者名/発表者名
      西田睦
    • 学会等名
      日本進化学会
    • 発表場所
      東京工業大学大岡山キャンパス,東京.(日本進化学会賞受賞講演)
    • 年月日
      2010-08-04
  • [学会発表] Molecular phylogenetic approach to the diversity of fishes2010

    • 著者名/発表者名
      Nishida M.
    • 学会等名
      International symposium "Toward developing global genetic diversity assessments"
    • 発表場所
      Kushu University, Fukuoka. (Invited Lecture)
    • 年月日
      2010-02-06
  • [学会発表] 魚類の進化を探る:その多様性への多面的アプローチ2008

    • 著者名/発表者名
      西田睦
    • 学会等名
      本部企画シンポジウム「観察から研究へ」日本動物学会大会
    • 発表場所
      福岡大学,福岡.(招待講演)
    • 年月日
      2008-09-06
  • [学会発表] Molecular phylogeny-based approach to evolution of fishes2007

    • 著者名/発表者名
      Nishida M.
    • 学会等名
      Asia-Africa Evolution Meeting
    • 発表場所
      Seimeinomori Resort Nihon Aerobics Center, Chiba
    • 年月日
      20071204-20071207
  • [図書] 海洋の生命史-生命は海でどのように進化したか2009

    • 著者名/発表者名
      西田睦(編著)
    • 総ページ数
      420
    • 出版者
      東海大学出版会
  • [備考] ホームページ等

    • URL

      http://darwin.ori.u-tokyo.ac.jp/Nishidalab/

  • [備考] 大気海洋研究所 海洋生命科学部門 分子海洋生物学分野 西田睦研究室ホームページ

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公開日: 2012-01-26   更新日: 2016-04-21  

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