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2009 年度 自己評価報告書

細胞システムにおける反応ゆらぎの計測とその特性・役割の理解

研究課題

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研究課題/領域番号 19207012
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物物理学
研究機関独立行政法人理化学研究所

研究代表者

佐甲 靖志  独立行政法人理化学研究所, 佐甲細胞情報研究室, 主任研究員 (20215700)

研究期間 (年度) 2007 – 2010
キーワード1分子計測 / 顕微計測 / ノイズ / 細胞内情報処理 / 細胞分化 / 細胞増殖
研究概要

細胞増殖・分化・細胞死などの細胞運命決定に関与する細胞内情報伝達回路であるEGF-Ras-MAPKシステムの反応を題材として、蛋白質分子反応、細胞内分子システム、細胞応答の各階層において反応ゆらぎとその伝搬・加工を実測して、その性質と役割を明らかにする。細胞が外来性および内在性の反応ゆらぎ(ノイズ)を克服する仕組み、さらには、反応ゆらぎが細胞応答の柔軟性の発現などに積極的に利用されている可能性を探る。
(1)分子反応においてはEGF受容体とRas/Raf(MAPKKK)の反応に注目し、これらの情報蛋白質と相互作用相手分子の反応時系列解析を行って、分子レベルでの情報処理機構を探る。(2)分子システムレベルでは、EGF受容体-Rasの反応回路と、Rasの下流に位置するMAPKカスケードにおいて、入出力応答および反応ゆらぎの伝搬を計測する。(3)細胞レベルでは、EGFに対する細胞変形・運動、増殖応答のゆらぎ・分布を細胞内反応と関連づけて解釈することを目指す。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2009 2008 2007 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (1件) 図書 (1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] A RasGTP-induced conformational change in C-RAF is essential for accurate molecular recognition2009

    • 著者名/発表者名
      K. Hibino, T. Shibata, T. Yanagida, Y. Sako
    • 雑誌名

      Biophys.J. 97

      ページ: 1277-87

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Multiple-state reactions between the epidermal growth factor receptor and Grb2 as observed using single-molecule analysis2007

    • 著者名/発表者名
      M. Morimatsu, H.Takagi, K. Ota, K. Nishida, T. Yanagida, Y. Sako
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA 104

      ページ: 18013-18

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Rho small GTPase regulates the stability of individual focal adhesions : a FRET-based visualization of GDP/GTP exchange on small GTPases2007

    • 著者名/発表者名
      T. Miyauchi, T. Yanagida, Y. Sako
    • 雑誌名

      Biophyscs 3

      ページ: 63-73

    • 査読あり
  • [学会発表] Single-molecule kinetic analysis of cell signaling reactions2008

    • 著者名/発表者名
      Y. Sako
    • 学会等名
      Conference on Systems Biology of Mammalian Cells (SBMC2008)
    • 発表場所
      Dresden
    • 年月日
      20080500
  • [図書] Signal transduction across the plasma membrane. "Single Molecule Dyanmics in Life Science" (Yanagida, T., Ishii, Y. ed.)2009

    • 著者名/発表者名
      M. Ueda, T. Shibata, Y. Sako
    • 総ページ数
      99-116, 18
    • 出版者
      WILEY-VCH
  • [備考] ホームページ

    • URL

      http://www.riken.go.jp/cell-info

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公開日: 2011-06-18   更新日: 2016-04-21  

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