RNA修飾が関与する遺伝子発現調節機構と高次生命現象

2009 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 19207013
• 研究種目: 基盤研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 分子生物学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 鈴木 勉 東京大学, 大学院・工学系研究科, 教授 (20292782)
• 研究期間 (年度): 2007 – 2009
• キーワード: RNA修飾 / RNAエディティング / イノシン / メチル化 / piRNA

研究概要

本研究課題ではRNAの転写後修飾に着目し、RNAが関与する遺伝子発現調節機構と高次生命現象の探索と解明を目標とした。特に、マウス精巣に発現するpiRNAの末端が2'Oメチル化修飾されていることを見出し、そのメチル化酵素の機能解析を行った。mRNAの修飾に関しては、ヒトの脳において大量に存在することが知られているイノシン化修飾に着目した。イノシン特異的な化学修飾と逆転写PCRを組み合わせた手法(Inosine Chemical Erasing法)を開発し、成人ヒト脳由来RNAに含まれる新規イノシン化部位を16,000箇所以上同定した。さらにICE法とdeep sequencingを組み合わせた新規手法ICE-Seqを考案し、ゲノムワイドにイノシン化部位の探索を開始した。

研究成果

• [雑誌論文] Discovery and characterization of tRNAIle lysidine synthetase (Ti1S) (2010)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, T., Miyauchi, K.
  • 雑誌名: FEBS Lett. 584 ページ: 272-277
• [雑誌論文] Fine-tuning of the ribosomal decoding center by conserved methyl-modifications in the Escherichia coli 16S rRNA (2010)
  • 著者名/発表者名: Kimura, S., Suzuki, T.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 38 ページ: 1341-1352
• [雑誌論文] The TDRD9-MIWI2 complex is essential for piRNA-mediated retrotransposon silencing in the mouse male germline Germline (2009)
  • 著者名/発表者名: Shoji, M., Tanaka, T., Hosokawa, M., Reuter, M., Stark, A., Kato, Y., Kondoh, G., Okawa, K., Chujo, T., Suzuki, T., Hata, K., Martin, S. L., Noce, T., Kuramochi-Miyagawa, S., Nakano, T., Sasaki, H., Pillai, R. S., Nakatsuji, N. Chuma, S.
  • 雑誌名: Dev Cell 17 ページ: 775-787
• [雑誌論文] Structural basis for translational fidelity ensured by tRNA lysidine synthetase (2009)
  • 著者名/発表者名: Nakanishi, K., Bonnefond, L., Kimura, S., Suzuki, T., Ishitani, R., Nureki, O.
  • 雑誌名: Nature 461 ページ: 1144-1148
• [雑誌論文] 3D-structure of mammalian mitochondrial tRNAAsp revealed by solution probing and phylogeny (2009)
  • 著者名/発表者名: Messmer, M., Putz, J., Suzuki, T., Suzuki T., Sauter, C., Sissler, M., Florentz, C.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 37 ページ: 6881-6895
• [雑誌論文] Structural basis of AdoMet-dependent aminocarboxypropyl transfer reaction catalyzed by tRNA-wybutosine synthesizing enzyme, TYW2 (2009)
  • 著者名/発表者名: Umitsu, M., Nishimasu, H., Noma, A., Suzuki, T., Ishitani, R., Nureki, O.
  • 雑誌名: Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 106 ページ: 15616-15621
• [雑誌論文] Biogenesis of glutaminyl-tRNAGIn in human mitochondria (2009)
  • 著者名/発表者名: Nagao, A., Suzuki, T., Katoh, T., Sakaguchi, Y., Suzuki T.
  • 雑誌名: Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 106 ページ: 16209-16214
• [雑誌論文] The R336Q mutation in human mitochondrial EFTu prevents the formation of an active mt-EETu・GTP・aa-tRNA ternary complex (2009)
  • 著者名/発表者名: Valente, L., Shigi, N., Suzuki, T., Zeviani, M.
  • 雑誌名: Biochim Biophys Acta. 1792 ページ: 791-795
• [雑誌論文] Aquifex aeolicus tRNA (N2, N2-guanine)-dimethyltransferase (Trml) catalyzes transfer of methyl groups not only to guanine 26 but also to guanine 27 in tRNA (2009)
  • 著者名/発表者名: Awai, T., Kimura, S., Tomikawa, C., Ochi, A., Ihsanawati, Bessho, Y., Yokoyama, S., Ohno, S., Nishikawa, K., Yokogawa, T., Suzuki T., Hori, H.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 284 ページ: 20467-20478
• [雑誌論文] The ordered transcription of RNA domains is not essential for ribosome biogenesis (2009)
  • 著者名/発表者名: Kitahara, K., Suzuki, T.
  • 雑誌名: Mol Cell. 34 ページ: 760-766
• [雑誌論文] Structural basis of tRNA modification with CO2 fixation and methylation by wybutosine synthesizing enzyme TYW4 (2009)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, Y., Noma, A., Suzuki, T., Ishitani, R., Nureki, O.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 37 ページ: 2910-2925
• [雑誌論文] RNA helicase module in an acetyltransferase that modifies a specific tRNA anticodon (2009)
  • 著者名/発表者名: Chimnaronk, S., Suzuki, T., Manita, T., Ikeuchi, Y., Yao, M., Suzuki, T., Tanaka, I.
  • 雑誌名: EMBO J. 28 ページ: 1362-1373
• [雑誌論文] Chemical synthesis and properties of 5-taurinomethyluridine and 5-taurinomethyl-2-thiouridine (2009)
  • 著者名/発表者名: Ogata, T., Shimazaki, T., Umemoto, T., Kurata, S., Ohtsuki, T., Suzuki, T., Wada, T.
  • 雑誌名: J.Org.Chem. 74 ページ: 2585-2588
• [雑誌論文] Selective stabilization of mammalian microRNAs by 3'-adenylation mediated by the cytoplasmic poly(A) polymerase GLD-2 (2009)
  • 著者名/発表者名: Katoh, T., Sakaguchi, Y., Miyauchi, K., Suzuki, T., Kashiwabara, S., Baba, T., Suzuki, T.
  • 雑誌名: Genes Dev. 23 ページ: 433-438
• [雑誌論文] Biogenesis and functions of thio-compounds in transfer RNA : comparison of bacterial and eukaryotic thiolation machineries (2009)
  • 著者名/発表者名: Noma, A., Shigi, N., Suzuki, T.
  • 雑誌名: DNA and RNA modification enzymes
• [雑誌論文] Mechanistic characterization of the sulfur-relay system for eukaryotic 2-thiouridine biogenesis at tRNA wobble positions (2009)
  • 著者名/発表者名: Noma, A., Sakaguchi, Y., Suzuki, T.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 37 ページ: 1335-1352
• [雑誌論文] Precise analysis of modification status at various stage of tRNA maturation in Saccharomyces cerevisiae (2009)
  • 著者名/発表者名: Ohira, T., Miyauchi, K., Sakaguchi, Y., Suzuki, T., Suzuki, T.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Symp Ser (Oxf) 53 ページ: 301-302
• [雑誌論文] Common Sulfur Transfer System for the Biosyntheses of Sulfur-containing tRNA and Cofactors (2008)
  • 著者名/発表者名: Shigi, N., Sakaguchi, Y., Asai, S., Suzuki, T., Watanabe, K.
  • 雑誌名: EMBO J. 27 ページ: 3267-3278
• [雑誌論文] The RNA acetyltransferase driven by ATP hydrolysis synthesizes N4-acetylcytidine of tRNA anticodon (2008)
  • 著者名/発表者名: Ikeuchi, Y., Kitahara, K., Suzuki, T.
  • 雑誌名: EMBO J. 27 ページ: 2194-2203
• [雑誌論文] Measuring mRNA decay in human mitochondria (2008)
  • 著者名/発表者名: Nagao, A., Shigi-Hino, N., Suzuki, T.
  • 雑誌名: Methods in Enzymol. 447 ページ: 489-499
• [雑誌論文] Ribosomal RNAs are tolerant toward genetic insertions : Evolutionary origin of the expansion segments (2008)
  • 著者名/発表者名: Yokoyama, T., Suzuki, T.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 36 ページ: 3539-3551
• [雑誌論文] Modified uridines with C5-methylene substituents at the first position of the tRNA anticodon stabilize U・G wobble pairing during decoding (2008)
  • 著者名/発表者名: Kurata, S., Weixlbaumer, A., Ohtsuki, T., Shimazaki, T., Wada, T., Kirino, Y., Takai, K., Watanabe, K. Ramakrishnan, V., Suzuki, T.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 283 ページ: 18801-18811
• [雑誌論文] Polyadenylation in mammalian mitochondria : Insights from recent studies (2008)
  • 著者名/発表者名: Nagaike, T., Suzuki, T., Ueda, T.
  • 雑誌名: Biochim Biophys Acta 1779 ページ: 266-269
• [雑誌論文] Mechanism of mRNA deadenylation : evidence for a molecular interplay between translation termination factor eRF3 and mRNA deadenylases (2007)
  • 著者名/発表者名: Funakoshi, Y., Doi, Y., Hosoda, N., Uchida, N., Osawa, M., Shimada, I., Tsujimoto, M., Suzuki, T., Katada, T., Hoshino, S.
  • 雑誌名: Genes Dev. 21 ページ: 3135-3148
• [雑誌論文] Wobble inosine tRNA modification is essential for cell cycle progression in G1/S and G2/M transitions in fission yeast (2007)
  • 著者名/発表者名: Tsutsumi, S., Sugiura, R., Ma, Y., Tokuoka, H., Ohta, K., Ohte, R., Noma, A., Suzuki, T., Kuno, T.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 282 ページ: 33459-33465
• [雑誌論文] Crystal structure of the radical SAM enzyme catalyzing tricyclic modified base formation in tRNA (2007)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, Y., Noma, A., Suzuki, T., Senda, M., Senda, T., Ishitani, R., Nureki, O
  • 雑誌名: J.Mol.Biol. 372 ページ: 1204-1214
• [雑誌論文] Pimet, the Drosophila homolog of HEN1, mediates 2'-O-methylation of Piwi-interacting RNAs at their 3' ends (2007)
  • 著者名/発表者名: Saito, K., Sakaguchi, Y., Suzuki, T., Suzuki, T., Siomi, H., Siomi, M. C.
  • 雑誌名: Genes Dev. 21 ページ: 1603-1608
• [雑誌論文] Functional genetic selection of Helix 66 in Escherichia coli 23S rRNA identified the eukaryotic class of binding sequences for ribosomal protein L2 (2007)
  • 著者名/発表者名: Kitahara, K., Kajiura, A., Sato, N. S., Suzuki, T.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 35 ページ: 4018-4029
• [雑誌論文] Mass spectrometric analysis of 3'-terminal nucleosides in non-coding RNAs (2007)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, T., Sakaguchi, Y., Suzuki, T.
  • 雑誌名: Nat Protoc. 185 ページ: DOI : 10.1038/nprot.2007
• [雑誌論文] Structures of tRNAs with an expanded anticodon loop in the decoding center of the 30S Ribosomal Subunit (2007)
  • 著者名/発表者名: Dunham, C. M., Selmer, M., Phelps, S. S., Suzuki, T., Joseph, S., Ramakrishnan, V.
  • 雑誌名: RNA 13 ページ: 817-823
• [雑誌論文] The 3'-termini of mouse piwi-interacting RNAs are 2'-O-methylated (2007)
  • 著者名/発表者名: Ohara, T., Sakaguchi, Y., Suzuki, T., Ueda, H., Miyauchi, K., Suzuki T.
  • 雑誌名: Nat Struct Mol Biol. 14 ページ: 349-350
• [雑誌論文] Thio modification of yeast cytosolic tRNA is an iron-sulfur protein-dependent pathway (2007)
  • 著者名/発表者名: Nakai, Y., Nakai, M., Lill, R., Suzuki, T., Hayashi, H.
  • 雑誌名: Mol Cell Biol. 27 ページ: 2841-2847
• [雑誌論文] Chaplet column chromatography : isolation of a large set of individual RNAs in a single step. (2007)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, T., Suzuki, T.
  • 雑誌名: Methods in Enzymol. 425 ページ: 231-239
• [雑誌論文] Mass spectrometric identification and characterization of RNA-modifying enzymes (2007)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, T., Ikeuchi, Y., Noma, A., Suzuki, T., Sakaguchi, Y.
  • 雑誌名: Methods in Enzymol. 425 ページ: 211-229
• [雑誌論文] Automated parallel isolation of multiple species of non-coding RNAs by the reciprocal circulating chromatography method (2007)
  • 著者名/発表者名: Miyauchi, K., Ohara, T., Suzuki, T.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 35 ページ: e24
• [雑誌論文] Specific residues at every third position of siRNA shape its efficient RNAi activity (2007)
  • 著者名/発表者名: Katoh, T., Suzuki, T.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 35 ページ: e27
• [雑誌論文] Ligand-induced translation by the allosteric ribosome bearing an aptamer-fused rRNA (2007)
  • 著者名/発表者名: Yokoyama, T., Suzuki, T.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Symp Ser (Oxf) 51 ページ: 383-384
• [雑誌論文] Aminoacyl-tRNA surveillance by EF-Tu in mammalian mitochondria (2007)
  • 著者名/発表者名: Nagao, A., Suzuki, T., Suzuki, T.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Symp Ser (Oxf) 51 ページ: 41-42
• [雑誌論文] Animated Crystallography of Genetic Code Translation. (2007)
  • 著者名/発表者名: Tomita, K., Numata, T., Fukai, T., Suzuki, T., Ishitani, R., Nureki, O.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Symp Ser (Oxf) 51 ページ: 101-102
• [学会発表] Biogenesis of Gin-mt tRNAG1n in human mitochondria (2010)
  • 著者名/発表者名: Asuteka Nagao, Takeo Suzuki, Takayuki Katoh, Yuriko Sakaguchi, Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: The 23rd tRNA workshop
  • 発表場所: Aveiro
  • 年月日: 20100128-20100202
• [学会発表] Novel wobble modification in tRNAIle responsible for decoding AUA codon in archaeal species ; convergent evolution of the decoding system across domains of life (2010)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Kimura, Yoshiho Ikeuchi, Tomoyuki Numata, Daigo Nakamura, Takashi Yokogawa, Kazuya Nishikawa, Takeshi Wada, Takeo Suzuki, Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: The 23rd tRNA workshop
  • 発表場所: Aveiro
  • 年月日: 20100128-20100202
• [学会発表] A landscape of tRNA modifications : complete chemical structures of total 48 species of Escherichia coli tRNAs determined by mass spectrometry (2010)
  • 著者名/発表者名: Kenjyo Miyauchi, Yuriko Sakaguchi, Takeo Suzuki, Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: The 23rd tRNA workshop
  • 発表場所: Aveiro
  • 年月日: 20100128-20100202
• [学会発表] Requirements for in vitro formation of 5-carboxymethylaminometyluridine at the wobble position in Escherichia coli tRNAs (2010)
  • 著者名/発表者名: Takeo Suzuki, Tomoyuki Numata, Takuo Osawa, Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: The 23rd tRNA workshop
  • 発表場所: Aveiro
  • 年月日: 20100128-20100202
• [学会発表] RNAの直接解析で見えてきたもの～microRNAが有する質的な情報と選択的安定化機構～ (2010)
  • 著者名/発表者名: 鈴木勉
  • 学会等名: 臨床応用を目指した最前線セミナー～microRNAを標的とした診断・治療の開発に向けて～
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2010-02-15
• [学会発表] A landscape of A-to-I RNA editing in human transcriptome : a hidden layer of gene expression produced by qualitative information embedded in RNA molecules (2009)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Suzuki, Hiroki Ueda, Takanori Yano, Shunpei Okada, Hideki Terajima, Totai Mitsuyama, Atsushi Toyoda, Asao Fujiyama, Hitomi Kawabata, Masayuki Sakurai
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 20091209-20091212
• [学会発表] マススペクトロメトリーによるmiRNAの直接プロファイリングとmiRNAの特異的安定化機構の発見 (2009)
  • 著者名/発表者名: 坂口裕理子, 加藤敬行, 上田宏生, 宮内健常, 柏原真一, 馬場忠, 姜秉一, 栗原靖之, 鈴木健夫, 鈴木勉
  • 学会等名: 第82回日本生化学会年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 20091021-20091024
• [学会発表] Precise analysis of modification status at various stage of tRNA maturation in Saccharomyces cerevisiae (2009)
  • 著者名/発表者名: Takayuki Ohira, Kenjyo Miyauchi, Yuriko Sakaguchi, Takeo Suzuki, Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: 国際核酸化学シンポジウム
  • 発表場所: 富山
  • 年月日: 20090927-20091001
• [学会発表] 出芽酵母tRNA前駆体の細胞質から核への逆行性の輸送が塩基修飾の形成に関わる (2009)
  • 著者名/発表者名: 大平高之, 鈴木勉
  • 学会等名: 第11回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 新潟
  • 年月日: 20090727-20090729
• [学会発表] RNAドメインの序列的な転写はリボソームの生合成に必須ではない (2009)
  • 著者名/発表者名: 北原圭, 鈴木勉
  • 学会等名: 第11回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 新潟
  • 年月日: 20090727-20090729
• [学会発表] イントロン領域におけるA-to-I RNAエディティングの機能解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 矢野孝紀, 櫻井雅之, 上日宏生, 岡日俊平, 川畑瞳, 鈴木勉
  • 学会等名: 第11回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 新潟
  • 年月日: 20090727-20090729
• [学会発表] 大腸菌RlmKLは23S rRNA中における2種類の異なるメチル化塩基の生合成を触媒する新しいタイプのRNA修飾酵素である (2009)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Kimura, Yoshiho Ikeuchi, Takeo Suzuki, Kei Kitahara, Yuriko Sakaguchi, Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: 第11回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 新潟
  • 年月日: 20090727-20090729
• [学会発表] 往復循環クロマトグラフィーを用いた微量RNAの全自動単離精製と修飾解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 宮内健常, 坂口裕理子, 鈴木健夫, 鈴木勉
  • 学会等名: 第11回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 新潟
  • 年月日: 20090727-20090729
• [学会発表] A-to-I RNA editing によるmiRNA依存的翻訳制御の調節 (2009)
  • 著者名/発表者名: 矢野孝紀, 櫻井雅之, 上田宏生, 岡田俊平, 川畑瞳, 鈴木勉
  • 学会等名: 第11回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 新潟
  • 年月日: 20090727-20090729
• [学会発表] ICE法と次世代シーケンサーを組み合わせたヒト成人脳由来RNA中に含まれるイノシン化部位の網羅的探索 (2009)
  • 著者名/発表者名: 上田宏生, 櫻井雅之, 川畑瞳, 光山統泰, 矢野孝紀, 岡田俊平, 豊田敦, 藤山秋佐夫, 鈴木勉
  • 学会等名: 第11回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 新潟
  • 年月日: 20090727-20090729
• [学会発表] ヒト転写産物におけるRNAエディティング部位探索と機能解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 櫻井雅之, 川畑瞳, 矢野孝紀, 岡田俊平, 光山統泰, 豊田敦, 藤山秋佐夫, 上田宏生, 鈴木勉
  • 学会等名: 第11回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 新潟
  • 年月日: 20090727-20090729
• [学会発表] Large scale identification of A-to-I editing sites in the human brain transcriptome by the ICE method ; implication for modulatory effect of A-to-I editing on translational repression mediated by miRNAs (2009)
  • 著者名/発表者名: Masayuki Sakurai, Takanori Yano, Shunpei Okada, Hitomi Kawabata, Totai Mitsuyama, Hiroki Ueda, Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: Gordon Reseach Conference for RNA editing
  • 発表場所: Galveston
  • 年月日: 20090112-20090116
• [学会発表] The acetylation of 18S rRNA is an essential modification to synthesize the small subunit of eukaryotic ribosome (2009)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Ito, Yu Akamatsu, Akiko Noma, Satoshi Kimura, Yoshiho Ikeuchi, Yoshikazu Tanaka, Kenjyo Miyauchi, Isao Tanaka, Takeo Suzuki, Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-10
• [学会発表] Direct analysis of small non-coding RNAs by mass spectrometry (2009)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: Joint Symposium of the 5th Annual Meeting of OTS and The 19th Antisense Symposium
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2009-11-06
• [学会発表] トップランナーズレクチャー RNAの直接解析で見えてきたもの (2009)
  • 著者名/発表者名: 鈴木勉
  • 学会等名: 第82回日本生化学会年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2009-10-23
• [学会発表] RNAの直接解析で見えてきたもの～microRNAが有する質的な情報と選択的安定化機構～ (2009)
  • 著者名/発表者名: 鈴木勉
  • 学会等名: KASTセミナー, 機能性RNAコース～機能性RNAの歴史と応用展開～
  • 発表場所: 神奈川
  • 年月日: 2009-09-16
• [学会発表] Circular permutants of the ribosomes in the cell (2009)
  • 著者名/発表者名: Kei Kitahara, Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: Experimental biology 2009
  • 発表場所: New Orleans
  • 年月日: 2009-04-18
• [学会発表] 13th annual meeting of the RNA society (RNA2008) (2008)
  • 著者名/発表者名: Takayuki Ohira, Yuki Takeuchi, Yuriko Sakaguchi, Hiroki Ueda, Takeo Suzuki, Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: Mass spectrometric identification of non-coding RNAs in ribonucleoprotein complexes in yeast
  • 発表場所: Berlin
  • 年月日: 20080728-20080803
• [学会発表] 酵母tRNAウォブル位のチオウリジン修飾はユビキチン様の反応機構を経由する (2008)
  • 著者名/発表者名: 野間章子, 鈴木勉
  • 学会等名: 第10回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 札幌
  • 年月日: 20080723-20080725
• [学会発表] 往復循環クロマトグラフィー法による non-coding RNAの全自動単離精製 (2008)
  • 著者名/発表者名: 宮内健常, 坂口裕理子, 鈴木健夫, 鈴木勉
  • 学会等名: 第10回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 札幌
  • 年月日: 20080723-20080725
• [学会発表] マイクロRNA前駆体に見出された Dicing 部位を規定する基質モチーフとmiRNAの3味端形成加藤敬行 (2008)
  • 著者名/発表者名: 坂口裕理子, 宮内健常, 鈴木健夫, 鈴木勉
  • 学会等名: 第10回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 札幌
  • 年月日: 20080723-20080725
• [学会発表] 大腸菌23S rRNAの円順列変異の取得とリボソーム構築原理の新知見 (2008)
  • 著者名/発表者名: 北原圭, 鈴木勉
  • 学会等名: 第10回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 札幌
  • 年月日: 20080723-20080725
• [学会発表] RNA mass spectrometry : a platform technology for non-coding RNA research (2008)
  • 著者名/発表者名: Yuriko Sakaguchi, Hiroki Ueda, Takeo Suzuki, Takayuki Katoh, Takeshi Seguchi, Kenjyo Miyauchi, Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: 56th ASMS Conference on Mass Spectrometry
  • 発表場所: Denver
  • 年月日: 20080601-20080605
• [学会発表] Mass spectrometric identification of non-coding RNAs in ribonucleoprotein complexes ; biochemical approach to RNA-protein interactome (2008)
  • 著者名/発表者名: 鈴木勉
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学大会合同大会 (BMB2008)
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-12-12
• [学会発表] RNA修飾の生合成と機能に関する研究 (Biogenesis and functions of RNA modifications) (2008)
  • 著者名/発表者名: 鈴木勉
  • 学会等名: 第6回 日本分子生物学会三菱化学奨励賞 受賞講演
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-12-10
• [学会発表] RNAマススペクトロメトリー ―機能性RNAの直接解析で見えてきたもの― (2008)
  • 著者名/発表者名: 鈴木勉
  • 学会等名: 2008質量分析計 ユーザーズフォーラム
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2008-10-22
• [学会発表] RNAマススペクトロメトリー ―機能性RNAの直接解析で見えてきたもの― (2008)
  • 著者名/発表者名: 鈴木勉
  • 学会等名: 発生工学・疾患モデル研究会「第70回定例会」
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2008-09-10
• [学会発表] 自分らしいRNA研究を追い求めてきて (2008)
  • 著者名/発表者名: 鈴木勉
  • 学会等名: RNAフロンティアミーティング2008
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2008-06-04
• [学会発表] 東工大生命理工GCOEシンポジウム「ようこそ先輩」 (2008)
  • 著者名/発表者名: 鈴木勉
  • 学会等名: RNAに魅せられて-企業での経験をアカデミックな研究に生かす
  • 発表場所: 長津田
  • 年月日: 2008-01-28
• [学会発表] Small non-coding RNAの直接解析で見えてきたもの (2007)
  • 著者名/発表者名: 鈴木勉
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学大会合同大会 (BMB2007)
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 20071211-20071215
• [学会発表] Aminoacyl-tRNA surveillance by EF-Tu in mammalian mitochondria (2007)
  • 著者名/発表者名: Asuteka Nagao, Takeo Suzuki, Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: 第5回国際核酸化学シンポジウム (NACS2007)
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 20071120-20071122
• [学会発表] Ligand-induced translation by the allosteric ribosome bearing an aptamer-fused rRNA (2007)
  • 著者名/発表者名: Takeshi Yokoyama, Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: 第5回国際核酸化学シンポジウム (NACS2007)
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 20071120-20071122
• [学会発表] Quality control of aminoacyl-tRNAs by kinetic competition of aminoacyltRNA synthetases and EF-Tu surveillance in mammalian mitochondria (2007)
  • 著者名/発表者名: Asuteka Nagao, Takeo Suzuki, Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: 22nd International tRNA Workshop
  • 発表場所: ウプサラ
  • 年月日: 20071101-20071106
• [学会発表] Genome-wide identification of genes responsible for 2-thiolation of 5-methoxycarbonylmethyl-2-thiouridine (mcm5s2U) at wobble position of yeast tRNAs (2007)
  • 著者名/発表者名: Akiko Noma, Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: 22nd International tRNA Workshop
  • 発表場所: ウプサラ
  • 年月日: 20071101-20071106
• [学会発表] TmcA catalyzes 4-acetylcytidine formation at wobble position of bacterial tRNAMet (2007)
  • 著者名/発表者名: Yoshiho Ikeuchi, Sarin Chimnaronk, Min Yao, Isao Tanaka, Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: 22nd International tRNA Workshop
  • 発表場所: ウプサラ
  • 年月日: 20071101-20071106
• [学会発表] Mass spectrometric characterization of small non-coding RNAs (2007)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: Yonsei University-The University of Tokyo Joint Symposium
  • 発表場所: ソウル
  • 年月日: 20070807-20070809
• [学会発表] 精子形成における哺乳類piRNAメチル化酵素の機能解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 長岡真, 大原智也, 中川真一, 加藤敬行, 五島直樹, 野村信夫, 鈴木健夫, 坂口裕理子, 鈴木勉
  • 学会等名: 第9回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 20070728-20070731
• [学会発表] RNA mass spectrometry : a platform technology for non-coding RNA research (2007)
  • 著者名/発表者名: 鈴木勉
  • 学会等名: 日本ヒトプロテオーム機構 (JHUPO) 第5回大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2007-07-31
• [学会発表] RNAマススペクトロメトリー (2007)
  • 著者名/発表者名: 鈴木勉
  • 学会等名: 日本プロテオーム機構 (JHUPO) 第5回大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2007-07-31
• [学会発表] RNA修飾が関与する生命現象へのアプローチ (2007)
  • 著者名/発表者名: 鈴木勉
  • 学会等名: RNA分子のダイナミズム-生命現象の根幹をなす機能性RNA
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2007-07-28
• [学会発表] Ribosome 2007 : Form and Function Cape Cod, USA MECHANISTIC AND ARCHITECTURAL ANALYSIS OF E. COLI RIBOSOMAL RNAS USING THE COMPREHENSIVE GENETIC SELECTION (2007)
  • 著者名/発表者名: Neuza S. Sato, Kei Kitahara, Takeshi Yokoyama, Naomi Hirabayashi, Taeko Komoda, Steven S. Phelps, Simpson Joseph, Rajendra K. Agrawal, Ilana Agmon, Ada Yonath, Tsutomu Suzuki
  • 年月日: 2007-06-05
• [学会発表] Mass spectrometric characterization of small non-coding RNAs ; identification of 2'-O-methylation at the 3'-termini of mouse piwi-interacting RNAs (2007)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Suzuki, Tomoya Ohara, Takeo Suzuki, Hiroki Ueda, Takeshi Seguchi, Kenjyo Miyauchi, Yuriko Sakaguchi
  • 学会等名: RNA 2007 : 12th Annual Meeting of the RNA Society
  • 発表場所: Madison
  • 年月日: 2007-06-01
• [学会発表] RNA mass spectrometry reveals qualitative aspects of non-coding RNAs (2007)
  • 著者名/発表者名: 鈴木勉
  • 学会等名: 細胞生物学会/発生生物学会シンポジウム「Frontiers in RNA Biology」
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2007-05-30
• [学会発表] RNA修飾の多彩な機能と生命現象 (2007)
  • 著者名/発表者名: 鈴木勉
  • 学会等名: お茶の水がん学アカデミア第34回集会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2007-04-24
• [学会発表] 機能性RNAのマススペクトロメトリー～見過ごされているRNAの質的な情報と高次生命現象へのアプローチ～ (2007)
  • 著者名/発表者名: 鈴木勉
  • 学会等名: 化学とバイオの架け橋
  • 発表場所: 本郷
  • 年月日: 2007-04-07
• [図書] ミトコンドリア脳筋症とtRNAのタウリン修飾欠損, 細胞工学 (2010)
  • 著者名/発表者名: 鈴木勉, 鈴木健夫
  • 総ページ数: 137-143
• [図書] マススペクトロメトリーを用いたmiRNAの直接プロファイリング, 分子細胞治療 (2009)
  • 著者名/発表者名: 坂口裕理子, 鈴木勉
  • 総ページ数: 36-41
• [図書] 細胞質に局在するGLD-2による3'末端アデニル化とmiRNAの選択的安定化機構, 実験医学 (2009)
  • 著者名/発表者名: 加藤敬行, 鈴木勉
  • 総ページ数: 1746-1750
• [図書] mRNAの塩基修飾・編集と遺伝子発現制御機構 (2009)
  • 著者名/発表者名: 櫻井雅之, 矢野孝紀, 岡日俊平, 竹内祐樹, 鈴木勉
  • 総ページ数: 2086-2091
  • 出版者: 共立出版
• [図書] 核酸アナログとsiRNAの配列設計 (2009)
  • 著者名/発表者名: 加藤敬行, 宮内健常, 鈴木勉
  • 出版者: シーエムシー出版
• [図書] 転写後修飾によるRNA機能制御 (2009)
  • 著者名/発表者名: 櫻井雅之, 鈴木勉
  • 総ページ数: 149-155
  • 出版者: 秀潤社
• [図書] 大腸菌からのRNA抽出 (2008)
  • 著者名/発表者名: 宮内健常, 鈴木勉
  • 総ページ数: 17-20
  • 出版者: 羊土社
• [図書] 質量分析法を用いたRNA修飾ヌクレオシドの解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 鈴木健夫, 鈴木勉
  • 総ページ数: 177-181
  • 出版者: 羊土社
• [図書] 有効なsiRNAのデザインと細胞への導入 (2008)
  • 著者名/発表者名: 加藤敬行, 鈴木勉
  • 総ページ数: 99-102
  • 出版者: 羊土社
• [図書] 「RNAとゲノム (最近の話題)」-座談会 機能性RNA研究の展望-, ゲノム医学 (2007)
  • 著者名/発表者名: 渡辺公綱, 浅井潔, 鈴木勉, 廣瀬哲郎
  • 総ページ数: 79-84
• [備考] ホームページ等 siExplorer : effective siRNA design algorithm.
  • URL: http://rna.chem.t.u-tokyo.ac.jp/cgi/siexplorer.htm
• [産業財産権] イソロイシンtRNA(tRNAIle)のライシジン合成酵素(TilS)としてのmesJ遺伝子産物及びその相同性遺伝子 (COG0037) (2010)
  • 発明者名: 鈴木勉
  • 権利者名: 東京大学
  • 産業財産権番号: 特許 特願2003-329762
  • 取得年月日: 2010-04-09
• [産業財産権] RNA中のイノシン化部位の検出方法 (2005)
  • 発明者名: 鈴木勉, 櫻井雅之
  • 権利者名: 東京大学
  • 産業財産権番号: 特許 特願2005-229335, PCT/JP2006/315581
  • 出願年月日: 2005-08-08
• [産業財産権] 往復循環クロマトグラフィーを用いた生体高分子の単離方法 (2005)
  • 発明者名: 鈴木勉, 宮内健常
  • 権利者名: 東京大学
  • 産業財産権番号: 特許 特願2005-224992, PCT/JP2006/315271
  • 出願年月日: 2005-08-03