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2008 年度 実績報告書

機能性精神疾患の全ゲノム関連解析データに基づく基底分子カスケードの探索

研究課題

研究課題/領域番号 19209040
研究機関独立行政法人理化学研究所

研究代表者

吉川 武男  独立行政法人理化学研究所, 分子精神科学研究チーム, チームリーダー (30249958)

研究分担者 山田 和男  独立行政法人理化学研究所, 分子精神科学研究チーム, 副チームリーダー (10322695)
服部 栄治  独立行政法人理化学研究所, 分子精神科学研究チーム, 研究員 (80399443)
豊田 倫子  独立行政法人理化学研究所, 分子精神科学研究チーム, 研究員 (20392045)
岩山 佳美  独立行政法人理化学研究所, 分子精神科学研究チーム, リサーチアソシエイト (60399441)
キーワードゲノムワイド関連解析 / 統合失調症 / 躁うつ病 / Affymetrix 100K SNP チップ / 階層化 / Principal Component Analysis
研究概要

1.統合失調症に関しては昨年度までに、第1次ゲノムスキャンで有意であった1,159 SNPs(P<0.01)につき、500例以上のケース・同数の対照群サンプルパネル(日本人)を用いて第2次スクリーニングを行い、さらに人種を越えた普遍性を検討するためにNIMH主導でリクルートされた1,163名の統合失調症家系サンプルパネル(中国人)を用いて第3次スクリーニングまで行った。第3次スクリーニングパネルは同じアジア民族なので、遺伝的近縁性から結果が注目される。今年度は、第3次スクリーニングまで残った遺伝子のうち、最も有意であった遺伝子につき、チップではカバーされていない高密度のSNPsを拾い、遺伝子のどの部分に疾患関連性があるか絞り込みを行ったのと、日本人と中国人でallelic heterogeneityがないかどうか検討を行った。前者に関しては、当初の計画を変更しコスト・パーフォーマンスを考えて、Illumina BeadsArrayやCustom SNPChipでなく、TaqManシステムで行った。ほぼデータがまとまってきたので論文作成作業を始めている。
2.気分障害に関しては昨年度までに、第1次ゲノムスキャンで有意であった1,576 SNPsにつき、第2次スクリーニングパネルとして約500例の双極性障害、約500例のコントロール(日本人)を用いて第2次スクリーニングまで行った。そして、これらのデータを論文化し、論文には書けなかったすべてのデータを当研究室のサーバーを用いて全盛会に公開した。結果は、ゲノムワイドの補正をかけて有意が残ったSNPはなかったが、今後正解中から同種の研究結果が報告されるであろうから、我々の結果はそれらと合わせてメタ解析に使用できる。

  • 研究成果

    (3件)

すべて 2008 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Preliminary Genome-wide Association Study of Bipolar Disorder in the Japanese Population

    • 著者名/発表者名
      Hattori E
    • 雑誌名

      Neuropsychiatric Genetics (印刷中)

    • 査読あり
  • [学会発表] Genetics of Bipolar disorder2008

    • 著者名/発表者名
      服部栄治
    • 学会等名
      2^<nd> WFSBP Asia-Pacific Congress and 30^<th> Annual Meeting of JSBP
    • 発表場所
      富山国際会議場
    • 年月日
      2008-09-11
  • [備考]

    • URL

      http://molpsych.brain.riken.jp/data.html

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公開日: 2010-06-11   更新日: 2016-04-21  

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