研究課題
基盤研究(B)
複数のタンパク質の立体構造データを入力し、表面形状相補性と静電相互作用に基づいて、各ペアがドッキングするか否かの判定を行うための手法を開発した。既存法ZDOCKとは異なり、実数のみで表面形状相補性を計算するrPSCモデルの着想を得て、精度を落とさず約4倍の高速化が達成できた。タンパク質の性質に応じて評価関数を動的に調整する手法も開発した。候補サイトの空間分布に注目した後処理により信頼度の向上が達成できた。
すべて 2010 2009 2008 その他
すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (10件) 備考 (1件)
情報処理学会論文誌(TOM) 3(3)
ページ: 91-106
Drug Metabolism and Disposition 28(8)
ページ: 1362-1370
TSUBAME e-Science Journal 2
ページ: 34-37
BioSupercomputing Newsletter 3
ページ: 8-8
Journal of Bioinformatics and Computational Biology 7(6)
ページ: 991-1012
Journal of Bioinformatics and Computational Biology 6(6)
ページ: 1133-1156
Informatics in press
ページ: 25
http://www.bi.cs.titech.ac.jp/