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2009 年度 実績報告書

ホスト・ゲストモデルペプチドを用いたコラニゲンの構造安定化機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 19350059
研究機関大阪大学

研究代表者

奥山 健二  大阪大学, 大学院・理学研究科, 教授 (30038020)

研究分担者 金子 文俊  大阪大学, 大学院・理学研究科, 准教授 (70214468)
川口 辰也  大阪大学, 大学院・理学研究科, 助教 (10314353)
キーワードコラーゲン / 三重らせん構造 / 構造安定化機構 / モデルペプチド / 単結晶解析 / 高分解能解析
研究概要

我々は、天然コラーゲンの繊維構造解析と、モデルペプチド単結晶の高分解能解析の結果から、コラーゲンの分子構造はRich & Crickモデルではなく、我々が提案している7/2-helixであることを発表した。本研究では、これらの実績を基にして、コラーゲン三重らせん構造の安定化機構を構造の立場から解明する。以下、本年度の研究成果を記す。
1. PPG4-Hyp-Yaa-Gly-PPG4(Yaa=Hyp, Pro, Asp, Asn, Thr, Val, Ser)の高分解能解析を終了し、YaaがProでなければHyp(X)はup-puckering、Proの時だけdown-puckering構造をとることが明らかになった。プロリン環のpuckeringは隣接鎖間のstacking相互作用や、水酸基の向きを変えることから双極子相互作用にも影響しているので、コラーゲンらせんの安定化を考える上での重要な構造情報となった。
2. (Hyp-Pro-Gly)_<10>がtriple-helix構造をとらないことから、30年以上にわたってX位のHypは構造を不安定化させると思われてきた。ころが近年、Hyp-Hyp-GlyとHyp-Thr-Gly配列では、らせん構造を取り得ることが明らかになった。上記ペプチドのうち、Yaa=Hyp, Thr, Val,Serの構造を詳細に検討することにより、分子内における隣接鎖間のHyp (X) : Yaaのスタッキングペヤー間におけるvan der Waals接触面積の大小と双極子相互作用の有無により、ラセン構造の安定性を統一的に説明することに成功した。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2010 2009

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (1件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Two crystal modifications of (Pro-Pro-Gly)_4-Hyp-Hyp-Gly-(Pro-Pro-Gly)_4 reveal the puckering preference of Hyp(X) in the Hyp(X):Hyp(Y) and Hyp(X):Pro(Y)2010

    • 著者名/発表者名
      K.Okuyama
    • 雑誌名

      Acta Cryst. D66

      ページ: 88-96

    • 査読あり
  • [雑誌論文] High-resolution Structures of Collagen-like Peptides [(Pro-Pro-Gly)_4-Xaa-Yaa-Gly--(Pro-Pro-Gly)_4] : Implications for Triple-helix Hydration and Hyp(X) Puckering2009

    • 著者名/発表者名
      K.Okuyama
    • 雑誌名

      Biopolymers 91

      ページ: 361-372

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Comment on Microfibrillar structure of type 1 collagen in situ by Orgel et al. (2006), Proc. Natl Acad. Sci. USA, 103, 9001-90052009

    • 著者名/発表者名
      K.Okuyama
    • 雑誌名

      Acta Cryst. D65

      ページ: 1007-1008

    • 査読あり
  • [学会発表] Stabilization mechanism by Hyp-Thr-Gly sequence in collagen-helix2009

    • 著者名/発表者名
      K.Miyama
    • 学会等名
      AsCA'09 Joint Conference of the Asian Crystallographic Association and Chinese Crystallography Society
    • 発表場所
      中国北京
    • 年月日
      2009-10-24
  • [図書] コラーゲン開発の現状と展望2009

    • 著者名/発表者名
      奥山健二(分担執筆)
    • 総ページ数
      225
    • 出版者
      シーエムシー出版

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公開日: 2011-06-16   更新日: 2016-04-21  

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