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2008 年度 実績報告書

生命進化に伴うRNA修飾酵素の機能変化の構造基盤

研究課題

研究課題/領域番号 19350087
研究機関愛媛大学

研究代表者

堀 弘幸  愛媛大学, 理工学研究科, 教授 (20256960)

キーワード核酸 / 酵素 / 生体分子 / ゲノム / 進化
研究概要

平成20年度は、平成19年度計画を継続し、次のような課題を実施した。
(1)プロテインノット型RNAメチル化酵素について
TrmHのRNA認識機構と触媒機構を推定するため、デオキシリボヌクレオチドを含むキメラRNAを作成し、阻害実験、結合実験に着手するととともに、X線結晶構造解析をおこなった。その結果、TrmHが標的部位のグアニンヌクレオチドの2'-OH基を直接認識することがわかった。また、TrmDに関しては、超好熱菌由来酵素のジスルフィド結合形成に関する生化学データをまとめ、Genes to Cells誌に報告した。
(2)古典的ロスマンフォールド型RNAメチル化酵素について
TrmBに関して、触媒機構を推定するため、変異酵素の解析を進めた。その結果、グアニン塩基の7位の孤立電子対自身が活性中心ではないかという仮説を得た。現在、その可否について検討中である。また、本酵素については、遺伝子破壊株の解析を進め、m7Gの修飾が他の修飾酵素のキーになっているのではないかという結果も得ている。これらは、現在、投稿論文としてまとめつつある。さらに、超好熱菌由来酵素のTrm1が新規なRNA選択性をもつことを見出し、現在、論文を投稿中である。
(3)葉酸依存性RNA修飾酵素について
新規葉酸依存性RNA修飾酵素、TrmFOについて、連携研究者の濡木らと共同研究を進め、X線結晶構造解析に成功し、この研究成果をまとめた投稿論文は、Proc. Natl. Acad. Sci. USA誌に受理された。

  • 研究成果

    (26件)

すべて 2009 2008 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (22件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Atomic structure of a folate/FAD-dependent tRNA T54 methyltransferase2009

    • 著者名/発表者名
      H. Nishimasu, R. Ishitani, K. Yamashita, C. Iwashita, A. Hirata, H. Hori, O. Nureki
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA (In press)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Stabilization of tRNA (m^1G37) methyltransferase [TrmD] from Aquifex aeolicus by an intersubunit disulfide bond formation2008

    • 著者名/発表者名
      T. Toyooka, T. Awai, T. Kanai, T. Imanaka, H. Hori
    • 雑誌名

      Genes to Cells 13

      ページ: 807-816

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Broad substrate RNA specificity of Trml [tRNA (m^2G26) methyltransferase] from Aquifex aeolicus2008

    • 著者名/発表者名
      T. Awai, H. Hori
    • 雑誌名

      IEEE : Micro-NanoMechatronics and Human Science 2008 CEP07768-CDR

      ページ: 1-10

    • 査読あり
  • [学会発表] 始原菌 (古細菌) tRNAスプライシングエンドヌクレアーゼによる変則的イントロンの切断2009

    • 著者名/発表者名
      北嶋 翼, 平田 章, 岩下 知香子, 横堀 伸一, 渡邊 洋一堀 弘幸
    • 学会等名
      第7回科研費特定領域「バイオ操作」公開シンポジウム
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2009-03-06
  • [学会発表] tRNA (Gm18) methyItransferase [TrmH] TypeI型酵素とTypell型酵素の比較2008

    • 著者名/発表者名
      越智杏奈, 堀 弘幸
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会合同年会(BMB2008)
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2008-12-09
  • [学会発表] Thermus thermophilusにおけるtRNAシュードウリジン55合成酵素TruBの重要性2008

    • 著者名/発表者名
      石田 一雄, 冨川 千恵, 越智 杏奈, 横川 隆志, 岩下 知香子, 堀 弘幸
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会合同年会(BMB2008)
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2008-12-09
  • [学会発表] 葉酸依存性tRNA(U54)メチル化酵素[TrmFO]の試験管内アツセイ法の確立2008

    • 著者名/発表者名
      山下 光輝, 岩下 知香子, 西増 弘志, 濡木 理, 堀 弘幸
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会合同年会(BMB2008)
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2008-12-09
  • [学会発表] 超好熱性古細菌Aeropyrum pernixにおけるtRNA^<Thr>前駆体とRNA修飾の解析2008

    • 著者名/発表者名
      北嶋 翼, 岩下 知香子, 横堀 伸一, 堀 弘幸
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会合同年会(BMB2008)
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2008-12-09
  • [学会発表] 真正細菌Aquifex aeolicus由来 Trmi [tRNA (m^2_2 G26) methyltransferase] の構造と基質認識メカニズム2008

    • 著者名/発表者名
      粟井 貴子, Ihsanawati, 木村聡, 冨川 千恵, 越智 杏奈, 横川 隆志, 鈴木 勉, 横山 茂之, 別所 義隆, 堀 弘幸
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会合同年会(BMB2008)
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2008-12-09
  • [学会発表] 無細胞翻訳系を用いた酵母由来ヘテロサブユニットtRNA修飾酵素の合成と解析2008

    • 著者名/発表者名
      岡田 和樹, 宗吉 裕樹, 遠藤 弥重太, 堀 弘幸
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会・第8 1回日本生化学会合同年会(BMB2008)
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2008-12-09
  • [学会発表] 酵母由来tRNA (m^7G46)メチル基転移酵素[Trm8-Trm82]の解析及び、ウリ類炭疽病菌Trm8オーソログAPH1遺伝子の比較解析2008

    • 著者名/発表者名
      宗吉 裕樹, 松本 啓介, 高野 義孝, 高柳 直幸, 遠藤 弥重太, 堀 弘幸
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会合同年会(BMB2008)
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2008-12-09
  • [学会発表] 好熱菌由来tRNA (m^7G46) methyltransferase [TrmB] の触媒メカニズムの解明に向けた機能解析2008

    • 著者名/発表者名
      冨川千恵 堀 弘幸
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会合同年会(BMB2008)
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2008-12-09
  • [学会発表] tRNA修飾に対する翻訳伸長因子EF-Tuの影響2008

    • 著者名/発表者名
      中村 仁, 堀 弘幸
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会合同年会(BMB2008)
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2008-12-09
  • [学会発表] Broad substrate RNA specificity of Trml [tRNA (m^2_2 G26)methyltransferase] from Aquifex aeolicus2008

    • 著者名/発表者名
      T. Awai, H. Hori
    • 学会等名
      2008 International Symposium on Micro-NanoMe chatronics and Human Science
    • 発表場所
      Nagoya
    • 年月日
      2008-11-06
  • [学会発表] Yeast tRNA (m^7G46)methyltransferase which contains two protein subunits (Trm8 and Trm82) synthesized in a wheat germ cell-free translation system2008

    • 著者名/発表者名
      Y. Muneyoshi, K. Matsumoto, C. Tomikawa, T. Toyooka, Anna Ochi, T. Masaoka, Y. Endo, H. Hori
    • 学会等名
      Protein Island Matsuyama International Symposium 2008
    • 発表場所
      Matsuyama
    • 年月日
      2008-09-27
  • [学会発表] Effects of tRNA (m7G46) modification in an extreme thermophile, Thermus thermophilus2008

    • 著者名/発表者名
      Chie Tomikawa, Takashi Yokogawa, Hiroyuki Hori
    • 学会等名
      FEBS Meeting
    • 発表場所
      Greek
    • 年月日
      2008-09-13
  • [学会発表] 超好熱性真正細菌Aquifex aeolicusの推定上のtrml遺伝子産物の性質決定2008

    • 著者名/発表者名
      粟井貴子, 木村 聡, Ihsanawati, 冨川千恵, 越智杏奈, 別所義隆, 横山茂之, 横川隆志, 鈴木勉, 堀弘幸
    • 学会等名
      高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第7回連携研究会
    • 発表場所
      理研・播磨(SPring-8)
    • 年月日
      2008-09-13
  • [学会発表] Therms thermophilus tRNA (m^1 A58) methyltransferase [Trml]の基質認識機構2008

    • 著者名/発表者名
      美濃地 真之, 牛尾 なつみ, 堀 弘幸
    • 学会等名
      高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第7回連携研究会
    • 発表場所
      理研・播磨(SPring-8)
    • 年月日
      2008-09-13
  • [学会発表] Thermus thremophilus由来tRNA U54 メチル化酵素TrmFO in vitro アツセイ法の確立2008

    • 著者名/発表者名
      山下 光輝, 岩下 知香子, 西増 弘志, 濡木 理, 堀 弘幸
    • 学会等名
      高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第7回連携研究会
    • 発表場所
      理研・播磨(SPring-8)
    • 年月日
      2008-09-13
  • [学会発表] tRNAシュードウリジン55合成酵素TruB遺伝子破壊株及び変異株の生育について2008

    • 著者名/発表者名
      石田 一雄, 冨川 千恵, 岩下 知香子, 堀 弘幸
    • 学会等名
      高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第7回連携研究会
    • 発表場所
      理研・播磨(SPring-8)
    • 年月日
      2008-09-13
  • [学会発表] Thermus thermophilus HB8 tRNA (Gm18) methyltransferase [TrmH] C末端領域による基質認識メカニズム2008

    • 著者名/発表者名
      越智杏奈、堀弘幸
    • 学会等名
      第10回日本RNA学会年会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2008-07-25
  • [学会発表] 真正細菌Aquifex aeolicus由来Trm1 [tRNA (m22G26) methyltransferase] はG26のみならずG27もメチル化する2008

    • 著者名/発表者名
      粟井貴子, 木村 聡, Ihsanawati, 冨川千恵, 越智杏奈, 別所義隆, 横山茂之, 横川隆志, 鈴木 勉, 堀 弘幸
    • 学会等名
      第10回日本RNA学会年会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2008-07-25
  • [学会発表] 高度好熱菌Thermus thermophilusにおけるtRNA m7G46修飾の役割は一体何か?2008

    • 著者名/発表者名
      冨川千恵, 横川隆志, 堀 弘幸
    • 学会等名
      第1O回日本RNA学会年会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2008-07-23
  • [学会発表] 超好熱菌Aquifex aeolicus由来tRNA (m1G37)メチル化酵素 [TrmD] のサブユニット間ジスルフィド結合形成の役割2008

    • 著者名/発表者名
      豊岡 峻, 粟井貴子, 金井 保, 今中忠行, 堀 弘幸
    • 学会等名
      第1O回日本RNA学会年会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2008-07-23
  • [学会発表] RNA転写後複合体ネットワークの試験管内再構成2008

    • 著者名/発表者名
      堀 弘幸
    • 学会等名
      第6回科研費特定領域「バイオ操作」公開シンポジウム
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2008-06-13
  • [備考]

    • URL

      http://www.ehime-u.ac.jp/~achem/bchem/

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公開日: 2010-06-11   更新日: 2016-04-21  

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