第三紀後期のユーラシア産小型哺乳類の断続的放散と環境適応に関する分子系統学的解析

2009 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 19405010
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 海外学術
• 研究分野: 生物多様性・分類
• 研究機関: 北海道大学
• 研究代表者: 鈴木 仁 北海道大学, 大学院・地球環境科学研究院, 准教授 (40179239)
• 研究分担者: 佐藤 淳 福山大学, 生命工学部, 講師 (80399162)
• 連携研究者: 篠原 明男 宮崎大学, フロンティア科学実験総合センター, 助教 (50336294) ; 甲能 直樹 独立行政法人国立科学博物, 地学研究部, 主任研究官 (20250136)
• 研究期間 (年度): 2007 – 2009
• キーワード: 第三紀 / 哺乳類 / 遺伝子 / 進化 / 分子系統 / 環境適応

研究概要

分子系統学的解析の結果、ネズミ類、ウサギ類、モグラ類、イタチ類は500-600万年前、200-300万年前の2回の系統放散により、東南アジア、インド、ミャンマーなどの空間を拠点として種の多様化が起きたことが明らかとなった。このグローバルな傾向に呼応し日本列島の哺乳類種の多様化が生じたことも示唆された。広域分散後の系統において毛色関連遺伝子Mclrのアミノ酸置換速度が加速化された例が見出された。

研究成果

• [雑誌論文] Detection of recombinant haplotypes in wild mice (Mus musculus) provides new insights into the origin of Japanese mice (2010)
  • 著者名/発表者名: Nunome, M, Ishimori, C, Aplin, K, Tsuchiya, K, Yonekawa, H, Moriwaki, K, Suzuki, H.
  • 雑誌名: Molecular Ecology (in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] The influence of Pleistocene refugia on the evolutionary history of the Japanese hare, Lepus brachyurus (2010)
  • 著者名/発表者名: Nunome, M, Torii, H, Matsuki, R, Kinoshita, G, Suzuki, H.
  • 雑誌名: Zoological Science
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mitochondrial phylogeo- graphy and population his tory of the large Japanese wood mouse (Apodemus speciosus) on Sado Island, Japan (2010)
  • 著者名/発表者名: Tomozawa, M, Tomida, H, Suzuki, H, Tsuchiya, K.
  • 雑誌名: Mammal Study 35 ページ: 93-97
  • 査読あり
• [雑誌論文] Muslepidoides (Muridae, Rodentia) of Central Burma is a Distinct Species of Potentially Great Evolutionary and Biogeographic Significance (2010)
  • 著者名/発表者名: Shimada, T, Aplin, KP, Suzuki, H.
  • 雑誌名: Zoological Science 27(5) ページ: 449-459
  • 査読あり
• [雑誌論文] Deciphering and dating the red panda's ancestry and early adaptive radiation of Musteloidea (2009)
  • 著者名/発表者名: Sato, JJ, Wolsan, M, Minami, S, Hosoda, T, Sinaga, MH, Hiyama, K, Yamaguchi, Y, Suzuki, H.
  • 雑誌名: Molecular Phylogenetics and Evolution 53 ページ: 907-922
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comparative analysis of evolutionary modes in Mc1r coat color gene in wild mice and mustelids (2009)
  • 著者名/発表者名: Shimada T, Sato JJ, Aplin KP, Suzuki H
  • 雑誌名: Genes & Genet Systems 84 ページ: 225-231
  • 査読あり
• [雑誌論文] オキナワトゲネズミ再発見と, トゲネズミ研究の最近 (2009)
  • 著者名/発表者名: 山田文雄, 黒岩麻里, 鈴木仁, 村田智慧
  • 雑誌名: 哺乳類科学 49 ページ: 1,133-135
• [雑誌論文] A molecular phylogenetic view of mammals in the "three-story museum" of Hokkaido, Honshu, and Ryukyu Islands (2009)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, H.
  • 雑誌名: The Wild Mammals of Japan.(Eds., Ohdachi SD, Ishibashi Y, Iwasa MA, Saitoh T, Shoukadoh) ページ: 261-263
• [雑誌論文] Mozaic genome structure of multiple subspecies in the Japanese wild mouse Mus musculus (2009)
  • 著者名/発表者名: Nunome., M., Suzuki H., Moriwaki K.
  • 雑誌名: The Wild Mammals of Japan.(Eds., Ohdachi SD, Ishibashi Y, Iwasa MA, Saitoh T, Shoukadoh) ページ: 180-181
• [雑誌論文] A biogeographic view of Apodemus in Asia and Europe inferred from nuclear and mitochondrial gene sequences (2008)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, H., Filippucci, MG., Chelomina, GN., Sato, JJ., Serizawa, K, Nevo, E.
  • 雑誌名: Biochemical Genetics 46 ページ: 329-346
  • 査読あり
• [雑誌論文] A trend of central versus peripheral structuring in mitochondrial and nuclear gene sequences of the Japanese wood mouse, Apodemus speciosus (2008)
  • 著者名/発表者名: Tomozawa, M, Suzuki, H.
  • 雑誌名: Zoological Science 25 ページ: 273-285
  • 査読あり
• [雑誌論文] Phylogenetic relationships of the short-faced mole, Scaptochirus moschatus (Mammalia : Eulipotyphla), among Eurasian fossorial moles, as inferred from mitochondrial and nuclear gene sequences (2008)
  • 著者名/発表者名: Shinohara, A, Kawada, S, Harada, M, Koyasu, K, Oda, S, Suzuki, H.
  • 雑誌名: Mammal Study 33 ページ: 77-82
  • 査読あり
• [雑誌論文] Isolation and development of microsatellite markers for the Japanese dormouse, Glirulus japonicus (2008)
  • 著者名/発表者名: Yasuda, SP, Nakayama, A, Iwabuchi, M, Minato, S, Tsuchiya, K, Suzuki, H.
  • 雑誌名: Molecular Ecology Resources 9 ページ: 569-571
  • 査読あり
• [雑誌論文] 日本の野生哺乳類にみる毛色の進化 (2008)
  • 著者名/発表者名: 鈴木仁
  • 雑誌名: 生物の科学遺伝 62(6) ページ: 60-61
• [雑誌論文] Phylogenetic relationships and divergence times among dormice (Rodentia, Gliridae) based on three nuclear genes (2007)
  • 著者名/発表者名: Nunome, M., Yasuda, SP., Sato, JJ., Vogel, P., Suzuki, H.
  • 雑誌名: Zoological Scripta 36 ページ: 537-546
  • 査読あり
• [学会発表] ミトコンドリアDNAから見た台湾産イタチ類相の形成史 (2009)
  • 著者名/発表者名: 細田徹治
  • 学会等名: 日本哺乳類学会
  • 発表場所: 台北大会
  • 年月日: 20091100
• [学会発表] 複数遺伝子座を用いたニホンノウサギ4亜種の遺伝的背景の解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 布目三夫
  • 学会等名: 日本哺乳類学会2009年度大会
  • 発表場所: (口頭発表)
  • 年月日: 20091000
• [学会発表] A role of Pleistocene refugia in shaping genetic diversity of the Japanese hare, Lepus brachyurus (2009)
  • 著者名/発表者名: Nunome, M.
  • 学会等名: 第10回国際哺乳類学会議
  • 発表場所: アルゼンチン ポスター発表
  • 年月日: 20090800
• [学会発表] Multilocus phylogeny of Mustelidae and the ancestroy of the South American species (2009)
  • 著者名/発表者名: Wolsan, M.
  • 学会等名: 第10回国際哺乳類学会議
  • 発表場所: アルゼンチン
  • 年月日: 20090800
• [学会発表] ユーラシア産野生ハツカネズミの系統地理学的解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 臼田大輝
  • 学会等名: 日本遺伝学会第81回大会
  • 発表場所: 松本
  • 年月日: 2009-09-17
• [学会発表] 日本産小型哺乳類の系統地理学的概観と進化遺伝学への活用 (2009)
  • 著者名/発表者名: 鈴木仁
  • 学会等名: 日本遺伝学会ワークショップ : 遺伝学の素材としての日本の野生生物 (オーガナイザー)
  • 発表場所: 松本
  • 年月日: 2009-09-16
• [学会発表] 野生ネズミ類の多様性の歴史とゲノム学への活用 (2009)
  • 著者名/発表者名: 鈴木仁
  • 学会等名: 第89回理研バイオリソースセンターセミナー
  • 発表場所: つくば
  • 年月日: 2009-08-04
• [学会発表] Mus 属のユーラシア亜熱帯域での展開とモロシヌスの来た道 (2009)
  • 著者名/発表者名: 鈴木仁
  • 学会等名: 第23回モロシヌス研究会
  • 発表場所: 大津市
  • 年月日: 2009-07-11
• [学会発表] 日本産モグラ類の分子系統と系統地理 (2009)
  • 著者名/発表者名: 桐原崇
  • 学会等名: 研究交流会「哺乳類の多様性研究」
  • 発表場所: 札幌
  • 年月日: 2009-06-23
• [学会発表] マイクロサテライトマーカーを用いたアカネズミ島嶼集団の遺伝解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 友澤森彦
  • 学会等名: 日本哺乳類学会
  • 発表場所: 山口
  • 年月日: 20080913-20090914
• [学会発表] マイクロサテライトを用いたニホンヤマネの配偶システムと巣箱共有個体の血縁関係解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 安田俊平
  • 学会等名: 日本哺乳類学会
  • 発表場所: 山口
  • 年月日: 20080913-20080914
• [学会発表] 第四紀の複数のレフュージアがニホンノウサギの遺伝的多様性に与えた影響についての系統地理学的解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 布目三夫
  • 学会等名: 日本哺乳類学会
  • 発表場所: 山口
  • 年月日: 20080913-20080914
• [学会発表] 野生ハツカネズミの系統地理学的研究へのSNPsの活用 (2008)
  • 著者名/発表者名: 臼田大輝
  • 学会等名: 日本哺乳類学会
  • 発表場所: 山口
  • 年月日: 20080913-20080914
• [学会発表] Mc1r遺伝子の変異に基づく日本産クマネズミ Rattus rattus の遺伝的背景の解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 神戸嘉一
  • 学会等名: 日本哺乳類学会
  • 発表場所: 山口
  • 年月日: 20080913-20080914
• [学会発表] ESU策定のための汎用分子マーカー開発の試み -ニホンヤマネをモデルとして- (2008)
  • 著者名/発表者名: 安田俊平
  • 学会等名: 日本進化学会第10回大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 20080800
• [学会発表] The role of Pleistocene refugia in shaping genetic diversity of the Japanese hare (Lepus brachyurus) (2008)
  • 著者名/発表者名: 布目三夫
  • 学会等名: Hokkaido University Sustainability Weeks G8 Summit Round
  • 発表場所: 札幌
  • 年月日: 20080600
• [学会発表] 日本固有種ニホンテンの保全遺伝学的研究 (2008)
  • 著者名/発表者名: 佐藤淳
  • 学会等名: 第55回日本生態学会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 20080300
• [学会発表] トゲネズミの進化的位置づけ (2008)
  • 著者名/発表者名: 鈴木仁
  • 学会等名: 日本哺乳類学会
  • 発表場所: 山口
  • 年月日: 2008-09-13
• [学会発表] ミトコンドリアDNAおよび核遺伝子配列からみたコウベモグラ Mogera (2008)
  • 著者名/発表者名: 桐原崇
  • 学会等名: 日本哺乳類学会
  • 発表場所: 山口
  • 年月日: 2008-09-13
• [学会発表] 複数の遺伝子配列の変異に基づく日本産野生ハツカネズミの起源 (2008)
  • 著者名/発表者名: 鈴木仁
  • 学会等名: 日本動物学会第79回大会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2008-09-06
• [学会発表] 日本産野生ハツカネズミのが持つことなる亜種に由来する4つの遺伝的要素の特定 (2008)
  • 著者名/発表者名: 鈴木仁
  • 学会等名: 日本遺伝学会第80回大会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2008-09-03
• [学会発表] 第三紀後期以降の哺乳類の断続的放散と日本産小型哺乳類の起源～韓国から日本への系統移入の多様な物語～ (2008)
  • 著者名/発表者名: 鈴木仁
  • 学会等名: 韓国国立バイオリソースセンター (National Institute of Biological Resources(NIBR))
  • 発表場所: 仁川
  • 年月日: 2008-05-21
• [学会発表] A thirty-year project of the genetic survey on the wild mice Modern Achievements in Population (2007)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, H
  • 学会等名: Evolutionary and Ecological Genetics
  • 発表場所: ウラジオストック
  • 年月日: 20070900
• [学会発表] 下顎骨形態およびBmp4遺伝子からみたコウベモグラ (Mogera wogura) の種内変異 (2007)
  • 著者名/発表者名: 桐原崇
  • 学会等名: 日本哺乳類学会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 20070900
• [学会発表] ニホンノウサギにみられる冬毛の白化が集団の遺伝的分化に与える影響の検証 (2007)
  • 著者名/発表者名: 布目三夫
  • 学会等名: 日本哺乳類学会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 20070900
• [学会発表] 多重遺伝子族5S rDNAの変異を利用した集団の遺伝的分化の検出 (2007)
  • 著者名/発表者名: 安田俊平
  • 学会等名: 日本哺乳類学会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 20070900
• [学会発表] 日本産野生ハツカネズミにおける亜種間組換体探索と二次的接触の時空間動態把握 (2007)
  • 著者名/発表者名: 鈴本仁
  • 学会等名: 日本哺乳類学会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 20070900
• [学会発表] 複数の核遺伝子から見たアカネズミの遺伝的多様性～伊豆諸島集団の遺伝的独自性～ (2007)
  • 著者名/発表者名: 友澤森彦
  • 学会等名: 日本哺乳類学会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 20070900
• [学会発表] 複数の核遺伝子を用いたアカネズミ地域集団の歴史推定 (2007)
  • 著者名/発表者名: 友澤森彦
  • 学会等名: 日本動物学会
  • 発表場所: 弘前
  • 年月日: 20070900
• [学会発表] ニホンヤマネは何種いるのか : 遺伝子の解析から見えてきたこと (2007)
  • 著者名/発表者名: 安田俊平
  • 学会等名: 日本動物学会
  • 発表場所: 弘前
  • 年月日: 20070900
• [学会発表] 連鎖遺伝子群のイントロン配列解析と日本産野生ハツカネズミの起源 (2007)
  • 著者名/発表者名: 鈴木仁
  • 学会等名: 日本遺伝学会第79回大会
  • 発表場所: 岡山
  • 年月日: 20070900
• [図書] 第3章レッドエコシステム ボルネオ (大崎満、岩熊編) (2008)
  • 著者名/発表者名: 甲山隆司, 鈴木仁
  • 総ページ数: 73-99
  • 出版者: 岩波出版