2008 年度研究成果報告書

分子間相互作用予測を目指したタンパク質複合体結合部位の幾何形状解析

研究課題

研究課題/領域番号	19500253
研究種目	基盤研究(C)
配分区分	補助金
応募区分	一般
研究分野	生体生命情報学
研究機関	奈良先端科学技術大学院大学
研究代表者	川端猛奈良先端科学技術大学院大学, 情報科学研究科, 准教授 (60343274)
研究期間 (年度)	2007 – 2008
キーワード	バイオインフォマティクス / 構造バイオインフォマティクス / タンパク質 / 分子認識 / 分子形状 / モルフォロジー
研究概要	単体の蛋白質の立体構造データから結合する分子の種類、結合する場所を予測することを最終目標として研究を進め、蛋白質表面の結合部位の候補を認識するプログラムGHECOMを開発した。このプログラムはモルフォロジーという画像処理技術を使用し、様々な深さのマルチスケールなポケットを同時に認識することができ、その深さから結合する分子の種類などの情報を推定できる。プログラムはフリーウエアとして一般公開している。