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2008 年度 実績報告書

固体核磁気共鳴シミュレーション解析法によるタンパク質結晶の水和構造の研究

研究課題

研究課題/領域番号 19510103
研究機関金沢大学

研究代表者

水野 元博  金沢大学, 物質化学系, 教授 (70251915)

キーワード複合材料・物性 / タンパク質 / 物性実験
研究概要

本研究の目的はタンパク質結晶中の様々な環境に存在する水和水のダイナミクスを自作の固体重水素NMRのシミュレーション解析法で詳細に解析し,タンパク質結晶の構造や物性と水和水の関係を解明することである。今年度は,固体重水素NMRのスペクトルやstimulated echoのシミュレーション解析法を開発し,広いダイナミックレンジで分子運動の情報を得ることを可能にした。この結果を欧文誌Journal of Physical Chemistry Aに発表した。また,異なる水和量の卵白リゾチーム結晶,アルブミン結晶,フェリチン結晶を調製し,重水素NMRのスピン-格子緩和時間(T_1),広幅スペクトル,QCPMGスペクトル,及びMASスペクトルの測定を行い,これらのタンパク質結晶中の水和水の環境およびダイナミクスを解析した。これらの結晶中には運動性の低い水分子と低温(200K付近)まで速い運動をしている水分子が存在することが確認された。200K以下では速い運動をしていた水分子の速度が急激に遅くなり,水分子の構造(H-O-H角)に分布が生じることが固体重水素NMRスペクトルのシミュレーション解析により明らかになった。卵白リゾチーム結晶やアルブミン結晶では200K付近でガラス転移が起こることが知られているが,この200K付近での水分子の運動の凍結はガラス転移と密接に関係していると予想される。これらの結果をJoint International Open Symposium for Molecular Science and Fluctuations toward Biological Functions(2009年3月岡崎)第2回分子科学討論会(2009年9月福岡),第89回日本化学会春季年会(2009年3月日本大学舟橋キャンパス)で発表した。

  • 研究成果

    (9件)

すべて 2009 2008 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (4件) 図書 (1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Deuterium NMR Study of Molecular Dynamics and Phase Transition in Acetonitrile Crystal2008

    • 著者名/発表者名
      Y. Suzuki, M. Sato, K. Takanohashi, T. Ida, M. Mizuno
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. A 112

      ページ: 13481-13486

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Conformation and Molecular Dynamics of Single Polystyrene Chain Confined in Coordination Nanospace2008

    • 著者名/発表者名
      T. Uemura, S. Horike, K. Kitagawa, M. Mizuno, K. Endo, S. Bracco, A. Comotti, M. Nagaoka, S. Kitagawa
    • 雑誌名

      J. Am. Chem. Soc. 130

      ページ: 6781-6788

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Photochromism of an Organorhodium Dithionite Complex in the Crystalline-State : Molecular Motion of Pentamethylcyclopentadienyl Ligands Coupled to Atom Rearrangement in a Dithionite Ligand2008

    • 著者名/発表者名
      H. Nakai, T. Nonaka, Y. Miyano, M. Mizuno, Y. Ozawa, K. Toriumi, N. Koga, T. Nishioka, M. Irie, Kisobe
    • 雑誌名

      J. Am. Chem. Soc. 130

      ページ: 17836-17845

    • 査読あり
  • [学会発表] 固体NMRによるリゾチーム結晶中の水和水のダイナミクスと構造の研究2009

    • 著者名/発表者名
      新屋隆士, 宮東達也, 水野元博
    • 学会等名
      日本化学会第89春季年会
    • 発表場所
      日本大学理工学部船橋キャンパス
    • 年月日
      2009-03-30
  • [学会発表] Hydration Water Dynamics in Biomaterials Studied by Simulation Analysis of Deuterium Solid-state NMR2009

    • 著者名/発表者名
      水野元博, 新屋隆士, 宮東達也
    • 学会等名
      Joint International Open Symposium for Molecular Science and Fluctuations toward Biological Functions
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター
    • 年月日
      2009-03-17
  • [学会発表] 固体NMRによるフェリチン結晶の水和水のダイナミクスの研究2008

    • 著者名/発表者名
      新屋隆士, 宮東達也, 水野元博
    • 学会等名
      第47回NMR討論会
    • 発表場所
      筑波大学大学会館講堂
    • 年月日
      2008-11-14
  • [学会発表] 固体NMRによるリゾチーム結晶の水和水のダイナミクスと物性の研究2008

    • 著者名/発表者名
      新屋隆士, 水野元博
    • 学会等名
      第2回分子科学討論会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 年月日
      2008-09-25
  • [図書] 多核種の溶液および固体NMR2008

    • 著者名/発表者名
      北川進, 水野元博, 前川雅彦
    • 総ページ数
      349
    • 出版者
      三共出版
  • [備考]

    • URL

      http://chem.s.kanazawa-u.ac.jp/theo/index.html

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公開日: 2010-06-11   更新日: 2016-04-21  

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