研究課題
モデル植物シロイヌナズナは遺伝子への挿入変異による変異体リソースが作成できることから、全ての遺伝子に関して一遺伝子破壊系統を確立すること(saturation mutagenesis)が可能である。このことはシロイヌナズナが、変異体を用いて全遺伝子の機能解析が実現可能な多細胞生物であり、ゲノム的な解析に非常に有利なモデル生物種であると捉えることができる。一方、これまでに形態異常を指標とした網羅的な表現型観察が試みられた例はあるが、目視で見付けることが難しい表現型(non-visible phenotypes)まで包括的に探索した表現型解析の研究例はない。そこで本研究課題では、シロイヌナズナの遺伝子破壊型変異系統を用いたフェノーム解析の一端として、化合物等を与えた条件で育成させることで、目視により見付けることが難しい条件的表現型(conditional phenotypes)を効率的に調べることを目的とした。各遺伝子変異体の生育環境条件によって現れる表現型の探索と変異体ラインの化合物添加による新規表現型スクリーニング系の開発を目指している。これまでに、化合物等を植物体に与えた場合に見られる表現型を多検体同時に探索するために、ハイスループットな化合物応答試験の構築に向けた予備的な検定実験を進めてきた。植物の初期の育成段階である種子の発芽からその後の幼苗育成に関して、マルチタイタープレートにおける生育の様子をスキャナーで取り込み、デジタル画像として保存する。その後、プレートの各ウェル画像を切り取り、画像処理作業によって生育状況の定量的データ化を可能にした。トランスポゾンタグラインを用いて、植物ホルモンABAや塩ストレス(NaCl)存在下での生育状況のデータ取得を行っている。
すべて 2010 2009
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Proc.Natl Acad.Sci.USA 107
ページ: 2361-2366
Plant J. 61
ページ: 529-542
The Handbook of Plant Mutation Screening : Mining of Natural and Induce Alleles(WILEY-VCH Verlag GmbH & Co.KGaA, Weinheim)
ページ: 17-30
PLoS Genet. 5
ページ: e1000781
Gen.Biol.Evol. 2009
ページ: 409-414
Plant Cell Physiol 50
ページ: 1215-1231
ページ: 1249-1259
Induced Plant Mutations in the Genomics Era(Food and Agriculture Organization of the United Nations, Rome)
ページ: 131-133
