蛍光プローブによる機能性RNAの細胞内リアルタイム検出ならびに制御法の開発

2008 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 19550164
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生体関連化学
• 研究機関: 京都工芸繊維大学
• 研究代表者: 村上 章 京都工芸繊維大学, 工芸科学研究科, 教授 (60210001)
• 研究分担者: 小堀 哲生 京都工芸繊維大学, 工芸科学研究科, 准教授 (00397605) ; 山吉 麻子 京都工芸繊維大学, 工芸科学研究科, 助教 (70380532)
• 研究期間 (年度): 2007 – 2008
• キーワード: バイオテクノロジー / 遺伝子 / 核酸 / 細胞・組織 / RNAプローブ

研究概要

ヒトゲノムプロジェクトが明らかにした「RNA World」は、機能未知のRNAの存在を浮かび上がらせた。これらRNAの機能の解明は21世紀の生命科学の重要な課題である。本研究では独自開発した核酸分子素子を用い、機能性RNAを生細胞内で検出する手法開発ならびに特定のRNAの機能を選択的に制御する手法の開発を行った。その結果、生細胞内で特定のRNAのin situ検出に成功すると共に、1塩基変異を持つRNAの選択的機能制御に成功した。

研究成果

• [雑誌論文] Synthesis and Photo-inducCross-linking Reactions of 4,5', 8-Trimethyl-c-fosprobe核細胞質ピレン法によるガン細胞中のc-fos-mRNAのリアルタイムイメージング例(疑似カラー)psoralen-incorporated Oligodeoxyribonucleotide (2009)
  • 著者名/発表者名: Kobori A., Takaya T., Higuchi M., Yamayoshi A, Murakami A
  • 雑誌名: Chemistry lett. 38 ページ: 272-273
  • 査読あり
• [雑誌論文] Synthesis of antisense oligo-nucleotides containing2'-O-psoralenyl-methoxyalkyl adenosine for photodynamic regulation of point mutations in RNA (2009)
  • 著者名/発表者名: Higuchi M., Kobori A., Yamayoshi A., Murakami A.
  • 雑誌名: Bioorganic & Medicinal chemistry 17 ページ: 475-483
  • 査読あり
• [雑誌論文] Microarray-based label-free detection of RNAusing bispyrene-modified 2'-O-methyloligo-ribonucleotide as capture and detection probe (2008)
  • 著者名/発表者名: Sakamoto T., Kobori A., Murakami A.
  • 雑誌名: Bioorganic & Medicinal chemistry Letters 18 ページ: 2590-2593
  • 査読あり
• [雑誌論文] Naphthyridine-tethered Oligodeoxyribo-nucleotides : Dye/DNA conjugates for Homogeneous SNPs Assays (2008)
  • 著者名/発表者名: Kobori A., Mori T., Ubayashi M., MurakamiA.
  • 雑誌名: Chem. Lett. 37 ページ: 354-355
  • 査読あり
• [雑誌論文] Transcriptome analysis device based on a liquid phase detection by fluorescently labeled nucleic acid probes (2007)
  • 著者名/発表者名: Yokokawa R., Tamaoki S., Sakamoto T., Murakami A., Sugiyama S.
  • 雑誌名: Biomedical Microdevices 9 ページ: 869-875
  • 査読あり
• [雑誌論文] Homogeneous fluorescence assays for RNA-diagnosis by pyrene-conjugated 2'-O-methyloligoribonucleo-tides (2007)
  • 著者名/発表者名: Sakamoto T., Kobori A., Shigesawa M., Amitani Y., Higuchi M., Murakami A
  • 雑誌名: Nucleosides, Nucleotides, & Nucleic Acids 26 ページ: 1659-1664
  • 査読あり
• [雑誌論文] Synaptic adhesion molecule OBCAM ; synaptogenesis and dynamic internalization (2007)
  • 著者名/発表者名: Yamada M., Hashimoto T., Hayashi H., Higuchi M., Murakami A., Nakashima T., Maekawa S., Miyata S
  • 雑誌名: Brain Research 1165 ページ: 5-14
  • 査読あり
• [雑誌論文] Specific apoptosis induction in human papillomavirus-positive cervical carcinoma cells by photodynamic antisense regulation (2007)
  • 著者名/発表者名: Yamayoshi A., Kato K, Suga S., Ichinoe A., Arima T., Matsuda T., Kato H., Murakami A., Wake N.
  • 雑誌名: Oligonucleotides 17 ページ: 66-79
  • 査読あり
• [雑誌論文] Selective photo- cross-linked of 2'-O-psoralen-conjugated oligo- nucleotide with RNAs having point mutations (2007)
  • 著者名/発表者名: Higuchi M., Yamayoshi A., Yamaguchi T., Iwase T.,Yamaoka T., Murakami A.
  • 雑誌名: Nucleosides, Nucleotides, & Nucleic Acids 26 ページ: 277-290
  • 査読あり
• [雑誌論文] Real-time monitoring of antibody secretion from B-cells on a microchip stimulatedwith a minute amount of mitogen (2007)
  • 著者名/発表者名: Munaka T., Abe H., Kanai M., Sakamoto T., Nakanishi H., Shoji S., Kimura S., Maekawa T., Murakami A
  • 雑誌名: The Analyst 132 ページ: 512-514
  • 査読あり
• [学会発表] 光架橋性塩基を有する人工核酸の合成とその機能評価 (2009)
  • 著者名/発表者名: 高屋和孝、樋口麻衣子、小堀哲生、山吉麻子、村上章
  • 学会等名: 日本化学会第89春季年会
  • 発表場所: 船橋市
  • 年月日: 2009-03-27
• [学会発表] RNA特異的検出プローブによるショウジョウバエ初期胚発現mRNAの検出 (2009)
  • 著者名/発表者名: 上田貴子、脇玲子、山吉麻子、小堀哲生、山口政光、村上章
  • 学会等名: 日本化学会第89春季年会
  • 発表場所: 船橋市
  • 年月日: 2009-03-27
• [学会発表] 蛍光修飾RNAプローブを用いた初期応答遺伝子のリアルタイムイメージング(II) (2009)
  • 著者名/発表者名: 脇玲子、上田貴子、山吉麻子、小堀哲生、村上章
  • 学会等名: 日本化学会第89春季年会
  • 発表場所: 船橋市
  • 年月日: 2009-03-27
• [学会発表] 蛍光修飾RNAプローブによる初期応答遺伝子のリアルタイムモニタリング (2008)
  • 著者名/発表者名: 脇玲子、小堀哲生、山吉麻子、村上章
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会・第81回日本化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸市
  • 年月日: 2008-12-09
• [学会発表] 蛍光核酸プローブによるショウジョウバエ初期胚発現遺伝子の検出 (2008)
  • 著者名/発表者名: 上田貴子、村上章、山口政光、小堀哲生、山吉麻子
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸市
  • 年月日: 2008-12-09
• [学会発表] 蛍光核酸プローブによるショウジョウバエの発生過程におけるmRNAの検出 (2008)
  • 著者名/発表者名: 上田貴子、脇玲子、山吉麻子、小堀哲生、山口政光、村上章
  • 学会等名: 第18回アンチセンスシンポジウム
  • 発表場所: 岐阜市
  • 年月日: 2008-11-17
• [学会発表] 点突然変異陽性細胞における光架橋性アンチセンス核酸の細胞増殖抑制効果 (2008)
  • 著者名/発表者名: 樋口麻衣子、山吉麻子、小堀哲生、加藤聖子、和氣徳夫、村上章
  • 学会等名: 第18回アンチセンスシンポジウム
  • 発表場所: 岐阜市
  • 年月日: 2008-11-17
• [学会発表] 光架橋型塩基を有するオリゴヌクレオチドの合成とその架橋特性 (2008)
  • 著者名/発表者名: 高屋和孝、樋口麻衣子、小堀哲生、山吉麻子、村上章
  • 学会等名: 第18回アンチセンスシンポジウム
  • 発表場所: 岐阜市
  • 年月日: 2008-11-17
• [学会発表] Excimer発光を利用した蛍光プローブによる疾患関連SNP検出 (2008)
  • 著者名/発表者名: 渡邊篤、上田貴子、山吉麻子、小堀哲生、村上章
  • 学会等名: 第18回アンチセンスシンポジウム
  • 発表場所: 岐阜市
  • 年月日: 2008-11-17
• [学会発表] PIWI-Antagonistic Peptideを結合させたアンチセンス核酸の設計と機能評価 (2008)
  • 著者名/発表者名: 山吉麻子、桃川大毅、山田有希子、小堀哲生、村上章
  • 学会等名: 第18回アンチセンスシンポジウム
  • 発表場所: 岐阜市
  • 年月日: 2008-11-17
• [学会発表] ピレン修飾型RNAプローブを用いた標的RNAのタイムラプスイメージング (2008)
  • 著者名/発表者名: 脇玲子、山吉麻子、小堀哲生、村上章
  • 学会等名: 第18回バイオ・高分子シンポジウム
  • 発表場所: 東京都
  • 年月日: 2008-07-25
• [学会発表] 光応答性塩基を有する人工核酸の開発 (2008)
  • 著者名/発表者名: 樋口麻衣子、高屋和孝、山吉麻子、小堀哲生、村上章
  • 学会等名: 第54回高分子研究発表会
  • 発表場所: 神戸市
  • 年月日: 2008-07-18
• [学会発表] エストロゲンレセプターを標的としたデコイ核酸によるヒト乳癌細胞増殖制御 (2008)
  • 著者名/発表者名: 山吉麻子、加藤聖子、和気徳夫、村上章
  • 学会等名: 第12回がん分子標的治療研究会
  • 発表場所: 東京都
  • 年月日: 2008-06-24
• [学会発表] 蛍光核酸プローブによるショウジョウバエ初期胚でのmRNAの検出 (2008)
  • 著者名/発表者名: 山吉麻子、上田貴子、小堀哲生、山口政光、村上章
  • 学会等名: 第55回日本生化学会近畿支部例会
  • 発表場所: 大阪市
  • 年月日: 2008-05-24
• [学会発表] RNAプローブを用いた初期応答遺伝子のリアルタイムイメージング(2) (2008)
  • 著者名/発表者名: 脇玲子、山吉麻子、小堀哲生、村上章
  • 学会等名: 第55回日本生化学会近畿支部例会
  • 発表場所: 大阪市
  • 年月日: 2008-05-24
• [学会発表] RUNX1遺伝子SNPのENA導入型ピレン修飾RNAプローブによるSNP検出 (2008)
  • 著者名/発表者名: 村上章、渡邊篤、山吉麻子、小堀哲生、岸田綱朗、松田修
  • 学会等名: 第88回日本化学会春季年会
  • 発表場所: 東京都
  • 年月日: 2008-03-26
• [学会発表] ナフチリジン修飾蛍光核酸プローブによるSNP検出 (2008)
  • 著者名/発表者名: 小堀哲生、森隆、山吉麻子、村上章
  • 学会等名: 第88回日本化学会春季年会
  • 発表場所: 東京都
  • 年月日: 2008-03-26
• [学会発表] デコイ核酸によるヒト乳癌細胞の増殖抑制機構 (2008)
  • 著者名/発表者名: 山吉麻子、島津典子、樋口麻衣子、小堀哲生、村上章
  • 学会等名: 第88回日本化学会春季年会
  • 発表場所: 東京都
  • 年月日: 2008-03-26
• [学会発表] 光架橋性アンチセンス核酸による分子標的治療へのアプローチ(III) (2008)
  • 著者名/発表者名: 樋口麻衣子、山吉麻子、小堀哲生、加藤聖子、和氣徳夫、村上章
  • 学会等名: 第88回日本化学会春季年会
  • 発表場所: 東京都
  • 年月日: 2008-03-26
• [学会発表] ピレン修飾RNAプローブによるRUNX1遺伝子中のSNP検出 (2007)
  • 著者名/発表者名: 村上章、渡邊篤、坂本隆、山吉麻子、小堀哲生、岸田網朗、松田修
  • 学会等名: 第17回アンチセンスシンポジウム
  • 発表場所: 金沢市
  • 年月日: 2007-12-04
• [学会発表] 光架橋型アンチセンス核酸による変異型K-ras遺伝子の発現制御 (2007)
  • 著者名/発表者名: 樋口麻衣子、高屋和孝、山吉麻子、堀哲生、加藤聖子、和氣徳夫、村上章
  • 学会等名: 第17回アンチセンスシンポジウム
  • 発表場所: 金沢市
  • 年月日: 2007-12-03
• [学会発表] 架橋型デコイ核酸によるヒト乳癌細胞増殖制御 (2007)
  • 著者名/発表者名: 山吉麻子、島津典子、樋口麻衣子、小堀哲生、村上章
  • 学会等名: 第17回アンチセンスシンポジウム
  • 発表場所: 金沢市
  • 年月日: 2007-12-03
• [学会発表] Synthesis of naphthyridine-conjugated DNA probes and their application to SNPs typing (2007)
  • 著者名/発表者名: Kobori A., Mori T., Yamayoshi A., Murakami A.
  • 学会等名: 第34回核酸化学シンポジウム(Fifth International Symposium on Nucleic Acids Chemistry)
  • 発表場所: 東京都
  • 年月日: 2007-11-20
• [学会発表] Selective regulation of mutant K-ras mRNA expression by photo-cross-linking antisense oligonuleotide (2007)
  • 著者名/発表者名: Higuchi M., Yamayoshi A., Kobori A., Murakami A.
  • 学会等名: 第34回核酸化学シンポジウム(Fifth International Symposium on 第34回核酸化学シンポジウムFifth International Symposium on Nucleic Acids Chemistry)
  • 発表場所: 東京都
  • 年月日: 2007-11-20
• [学会発表] Gene expression by decoy approach (II) : Development of photo-cross-linked oligonucleotides duplex as a decoy DNA for estrogen receptor (2007)
  • 著者名/発表者名: Yamayoshi A., Shimadzu N., Higuchi M., Kobori A., Murakami A
  • 学会等名: 第34回核酸化学シンポジウム(Fifth International Symposium on Nucleic Acids Chemistry)
  • 発表場所: 東京都
  • 年月日: 2007-11-20
• [学会発表] 点突然変異遺伝子の発現制御を目指したアンチセンス核酸の分子設計 (2007)
  • 著者名/発表者名: 樋口麻衣子、高屋和孝、山吉麻子、小堀哲生、村上章
  • 学会等名: 第56回高分子討論会
  • 発表場所: 名古屋市
  • 年月日: 2007-09-19
• [学会発表] Synthesis and fluorescence properties of DANP-conjugated DNA probes for SNPs detection (2007)
  • 著者名/発表者名: Kobori A., Mori T., Yamayoshi A., Murakami A
  • 学会等名: American Chemical Society 23th National Meeting
  • 発表場所: Boston, USA
  • 年月日: 2007-08-19
• [学会発表] Novel psoralen-conjugated antisense oligonucleotides having high photocross-linking efficiency (2007)
  • 著者名/発表者名: M.Higuchi, A.Yamayoshi, A.Kobori, A.Murakami
  • 学会等名: American Chemical Society 23th National Meeting
  • 発表場所: Boston, USA
  • 年月日: 2007-08-19
• [学会発表] 光架橋型アンチセンス核酸のデザインと機能評価 (2007)
  • 著者名/発表者名: 樋口麻衣子、山吉麻子、小堀哲生、村上章
  • 学会等名: 第17回バイオ・高分子シンポジウム
  • 発表場所: 東京都
  • 年月日: 2007-07-30
• [学会発表] ショウジョウバエのmRNAを標的とした蛍光プローブの設計とその評価 (2007)
  • 著者名/発表者名: 村上章、上田貴子、山吉麻子、小堀哲生、坂本隆
  • 学会等名: 第53回高分子研究発表会(神戸)
  • 発表場所: 神戸市
  • 年月日: 2007-07-20
• [学会発表] ソラレンを修飾した光架橋性アンチセンス核酸の開発 (2007)
  • 著者名/発表者名: 樋口麻衣子、高屋和孝、山吉麻子、小堀哲生、村上章
  • 学会等名: 第53回高分子研究発表会(神戸)
  • 発表場所: 神戸市
  • 年月日: 2007-07-20
• [学会発表] ピレン修飾RNAプローブによるmRNAのin situ検出 (2007)
  • 著者名/発表者名: 村上章、脇玲子、坂本隆、山吉麻子、小堀哲生
  • 学会等名: 第53回高分子研究発表会(神戸)
  • 発表場所: 神戸市
  • 年月日: 2007-07-20
• [学会発表] 架橋型デコイ核酸の遺伝子発現制御の評価 (2007)
  • 著者名/発表者名: 山吉麻子、島津典子、小堀哲生、村上章
  • 学会等名: 第53回高分子研究発表会(神戸)
  • 発表場所: 神戸市
  • 年月日: 2007-07-20
• [学会発表] ENA導入型ピレン修飾RNAプローブを用いたSNPタイピング (2007)
  • 著者名/発表者名: 村上章、渡邊篤、岸田網朗、山吉麻子、小堀哲生、松田修
  • 学会等名: 第53回高分子研究発表会(神戸)
  • 発表場所: 神戸市
  • 年月日: 2007-07-20
• [学会発表] ソラレン誘導体を修飾した光架橋性アンチセンス核酸の開発 (2007)
  • 著者名/発表者名: 樋口麻衣子、小堀哲生、山吉麻子、村上章
  • 学会等名: 第54回日本生化学会近畿支部例会
  • 発表場所: 東京市
  • 年月日: 2007-05-19
• [学会発表] ENA導入型ピレン修飾RNAプローブを用いたSNP検出法の開発 (2007)
  • 著者名/発表者名: 村上章、渡邊篤、坂本隆、岸田網朗、松田修、小堀哲生
  • 学会等名: 第54回日本生化学会近畿支部例会
  • 発表場所: 京都市
  • 年月日: 2007-05-19
• [学会発表] エストロゲンレセプターを標的とした架橋型デコイ核酸による細胞増殖制御 (2007)
  • 著者名/発表者名: 山吉麻子、島津典子、樋口麻衣子、小堀哲生、村上章
  • 学会等名: 第54回日本生化学会近畿支部例会
  • 発表場所: 京都市
  • 年月日: 2007-05-19
• [学会発表] RNAプローブによる初期応答遺伝子の発現プロファイリング (2007)
  • 著者名/発表者名: 村上章、脇玲子、坂本隆、山吉麻子、小堀哲生
  • 学会等名: 第54回日本生化学会近畿支部例会
  • 発表場所: 京都市
  • 年月日: 2007-05-19
• [学会発表] ジアミノナフチリジンを導入した蛍光核酸プローブによる標的核酸の検出 (2007)
  • 著者名/発表者名: 小堀哲生、森隆、山吉麻子、村上章
  • 学会等名: 第2回日本ケミカルバイオロジー研究会
  • 発表場所: 京都市
  • 年月日: 2007-05-09
• [図書] 核酸医薬の最前線(監修 : 和田猛) (2009)
  • 著者名/発表者名: 山吉麻子、村上章
  • 総ページ数: 254(124-136)
  • 出版者: シー-エムシー出版
• [備考]
  • URL: http://www.cis.kit.ac.jp/~antisen/seijo.html
• [産業財産権] ピレン修飾RNA、およびRNAの分析方法 (2009)
  • 発明者名: 山名一成、雑古博文、中野英彦、岩瀬礼子、村上章
  • 権利者名: 株式会社島津製作所
  • 産業財産権番号: 特許権, 特許第4238381号
  • 取得年月日: 2009-01-09