バイオ分子の自己組織化によるマイクロ・ナノ構造形成ダイナミクス

2008 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 19560091
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 機械材料・材料力学
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 安達 泰治 京都大学, 大学院・工学研究科, 准教授 (40243323)
• 研究分担者: 北條 正樹 京都大学, 大学院・工学研究科, 教授 (70252492)
• 研究期間 (年度): 2007 – 2008
• キーワード: マイクロ・ナノバイオメカニクス / 生体分子 / DNA / 自己組織化 / ナノ・バイオ工学 / 一本鎖DNA

研究概要

本研究では, DNAを用いたボトムアップ型微小構造物の作製において重要となる環状一本鎖DNAの作製過程において, Precursor DNAとTemplate DNAの塩基長が, 最終的な構造に及ぼす影響を明らかにした. 同一のPrec.DNAに対しては, 長いTemp.DNAを用いることで, 直列の多量体環が産生されることが示され, 適切な一本鎖DNAの長さと組み合わせの選択により, 単量体環と多量体環の産生比率を制御できる可能性を示した.

研究成果

• [雑誌論文] Coarse-grained Modeling and Simulation of Actin Filament Behavior Based on Brownian Dynamics Method (2009)
  • 著者名/発表者名: Yoshitaka Shimada, Taiji Adachi, Yasuhiro Inoue, and Masaki Hojo
  • 雑誌名: Molecular and Cellular Biomechanics in press
  • 査読あり
• [雑誌論文] Strain Field in Actin Filament Network in Lamellipodia of Migrating Cells : Implication for Network Reorganization (2009)
  • 著者名/発表者名: Taiji Adachi, Kennedy O. Okeyo, Yoshimichi Shitagawa, and Masaki Hojo
  • 雑誌名: Journal of Biomechanics 42-3 ページ: 297-302
  • 査読あり
• [雑誌論文] Simultaneous observation of calcium signaling response and membrane deformation due to localized mechanical stimulus in single osteoblast-like cells (2008)
  • 著者名/発表者名: Taiji Adachi, Katsuya Sato, Norio Higashi, Yoshihiro Tomita, and Masaki Hojo
  • 雑誌名: Journal of Mechanical Behavior of Biomedical Materials 1-1 ページ: 43-50
  • 査読あり
• [学会発表] 一重鎖DNAの環状化過程における塩基長の影響 (2008)
  • 著者名/発表者名: 紀平佑毅, 安達泰治, 須長純子, 北條正樹
  • 学会等名: 日本機械学会2008年度年次大会
  • 発表場所: 横浜市(No. 08-1 (2008) 267-268)
  • 年月日: 20080000
• [学会発表] Coarse-grained modeling and simulation of actin filament dynamics : Polymerization, depolymerization and severing (2008)
  • 著者名/発表者名: Taiji Adachi, Yoshitaka Shimada, Yasuhiro Inoue, and Masaki Hojo
  • 学会等名: 8th World Congress on Computational Mechanics
  • 発表場所: Venice
  • 年月日: 20080000
• [学会発表] ハイブリッド形成による環状一本鎖DNA作製手法の検討 (2008)
  • 著者名/発表者名: 紀平佑毅, 安達泰治, 須長純子, 北條正樹
  • 学会等名: 帝人21世紀フォーラム
  • 発表場所: 裾野市(40)
  • 年月日: 20080000
• [学会発表] アクチンフィラメントとリポソームのin vitro再構成条件の検討 (2007)
  • 著者名/発表者名: 丸岡有記子, 安達泰治, 須長純子, 北條正樹
  • 学会等名: 日本機械学会バイオフロンティア講演会
  • 発表場所: 福岡市(講演論文集, 07-35 (2007) 87-88)
  • 年月日: 20070000
• [学会発表] ハイブリッド形成による環状一本鎖DNA作製手法の検討 (2007)
  • 著者名/発表者名: 紀平佑毅, 安達泰治, 須長純子, 北條正樹
  • 学会等名: 日本機械学会バイオフロンティア講演会
  • 発表場所: 福岡市(講演論文集, 07-35 (2007) 79-80)
  • 年月日: 20070000
• [学会発表] Biomechanics of Actin Cytoskeleton : In vitro and in silico studies (2007)
  • 著者名/発表者名: Taiji Adachi
  • 学会等名: The 2^<nd> International Conference on Mechanics of Biomaterials & Tissues
  • 発表場所: Keynote Speaker, Hawaii
  • 年月日: 20070000
• [学会発表] ジャイアントリポソーム内でのアクチンタンパク質の機能発現 (2007)
  • 著者名/発表者名: 植田充彦, 丸岡有記子, 安達泰治, 須長純子, 北條正樹
  • 学会等名: 日本機械学会関西支部第82期定時総会講演会講演論文集
  • 発表場所: 大東市(74-1, 7-16)
  • 年月日: 20070000
• [産業財産権] 単量体環状一本鎖DNAおよび多量体環状一本鎖DNAの形成比率を制御する方法
  • 発明者名: 安達泰治, 須長純子, 紀平佑毅, 安室怜, 北條正樹
  • 権利者名: 独立行政法人理化学研究所
  • 産業財産権番号: 特許 特願 : 2008-092415(2008.3.31)