研究課題/領域番号 |
19570100
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研究機関 | 独立行政法人産業技術総合研究所 |
研究代表者 |
星野 保 独立行政法人産業技術総合研究所, ゲノムファクトリー研究部門, 主任研究員 (60357944)
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研究分担者 |
湯本 勲 独立行政法人産業技術総合研究所, ゲノムファクトリー研究部門, 研究グループ長 (30358303)
吉宗 一晃 独立行政法人産業技術総合研究所, ゲノムファクトリー研究部門, 研究員 (50325700)
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キーワード | 菌類 / 遺伝子多様性 / 環境適応 / 凍結耐性 / 種内分化 / 雪腐病 / 北米 |
研究概要 |
微生物は構造が単純で世代交代も早く、加えて容易に培養できることから、モデル生物として広く利用されている。一方、その多くは肉眼でその存在を確認できず、個体識別は容易では無い。風媒等によって栄養体・胞子が容易に移動することから、汎世界的に分布する種が多く、遺伝的多様性に乏しいとされ、化石により種分化の年代を測定することは困難なことから、微生物において分子進化時計の設定は、事実上不可能であった。このことは、進化学のモデル生物として微生物を利用する際の問題点である。雪腐病菌は、積雪環境下で越冬性作物に対して病原性を示す糸状菌の総称である。本研究の研究対象である低温性担子菌イシカリガマホタケは、菌核とよばれる直径数mmの「キノコの種」を形成することから、採取地での個体識別が可能であり、担子胞子が短命のため風媒等によって分散することが無く、主に菌糸の栄養増殖によって、その分布を拡大するとされる。このため他の微生物とは異なり、遺伝的多型が多く存在し、生息地に適応した亜種を生じ易いとされる。 本菌では、その変異を別種レベルあるいは別品種レベルが混在し、分類上混乱している。北半球各地で採取した菌株は、交配試験・遺伝子解析の結果、3グループに分かれ、それぞれを亜種レベルで記載可能と判断した。このため、基準標本の形態・遺伝子解析を行い、北半球に広く分布するgroup IはT.ishikariensisと同じであり、group IIはT.idahoensisおよびT.ishikariensis var.canadensisと同じであった。北極圏を中心に分布するgroup IIIは、これらの標本と異なり、現在廃棄名であるT.hyperboreaの記載に形態的特徴が合致した。今後、更に複数の遺伝子マーカーを用いた本菌の多様性解析を行い、地理的分布を反映した遺伝子の選出を行う予定である。
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