インフルエンザ菌由来ペニシリン結合タンパク質構造による新抗生物質の開発

2008 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 19570109
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 構造生物化学
• 研究機関: 横浜市立大学
• 研究代表者: 朴 三用 横浜市立大学, 生命ナノシステム科学研究科, 准教授 (20291932)
• 研究分担者: JEREMY Tame 横浜市立大学, 生命ナノシステム科学研究科, 教授 (00336588) ; 雲財 悟 横浜市立大学, 生命ナノシステム科学研究科, 助教 (60336592)
• 研究期間 (年度): 2007 – 2008
• キーワード: 構造生物学

研究概要

細菌の細胞壁は、浸透圧や外界からの物理的損傷から自身を守り、成長や分裂時には盛んに生合成される組織の1つである。ペニシリンを代表とするβ-ラクタム系抗生物質は、もっとも古くから使用されてきた1つであり、主にグラム陰性菌に対して非常に有効で、現在も、最も多く使用されている抗菌剤である。本研究の目的は、インフルエンザ菌由来のPBPsの立体構造を解明し、新たなインフルエンザ菌の新抗生剤開発を行う予定である。

研究成果

• [雑誌論文] A Common Mechanism for the ATP-DnaA-dependent Formation of Open Complexes at the Replication Origin (2008)
  • 著者名/発表者名: Ozaki S, Kawakami H, Nakamura K, Fujikawa N, Kagawa W, Park SY, Yokoyama S, Kurumizaka H, Katayama T
  • 雑誌名: J Biol Chem. 283(13) ページ: 8351-62
• [雑誌論文] Crystal structures of the clock protein EA4 from the silkworm Bombyx mori (2008)
  • 著者名/発表者名: Hiraki T, Shibayama N, Akashi S, Park SY
  • 雑誌名: J Mol Biol. 377(3) ページ: 630-5
• [雑誌論文] The structural basis for an essential subunit interaction in influenza virus RNA polymerase (2008)
  • 著者名/発表者名: Obayashi E, Yoshida H, Kawai F, Shibayama N, Kawaguchi A, Nagata K, Tame JR, Park SY
  • 雑誌名: Nature. 454(7208) ページ: 1127-31
• [雑誌論文] Structure and mechanism of HpcG, a hydratase in the homoprotocatechuate degradation pathway of Escherichia coli (2007)
  • 著者名/発表者名: Izumi A, Rea D, Adachi T, Unzai S, Park SY, Roper DI, Tame JR
  • 雑誌名: J Mol Biol. 370(5) ページ: 899-911
• [雑誌論文] Dynamic allostery in the ring protein TRAP (2007)
  • 著者名/発表者名: Heddle JG, Okajima T, Scott DJ, Akashi S, Park SY, Tame JR
  • 雑誌名: J Mol Biol. 371(1) ページ: 154-67
• [雑誌論文] Protonation States of Buried Histidine Residues in Human Deoxyhemoglobin Revealed by Neutron Crystallography (2007)
  • 著者名/発表者名: Chatake T, Shibayama N, Park SY, Kurihara K, Tamada T, Tanaka I, Niimura N, Kuroki R, Morimoto Y
  • 雑誌名: J Am Chem Soc. 129(48) ページ: 14840-1
• [学会発表] Studies of protein-protein and protein-RNA complexes by mass spectrometry, IUCr (2008)
  • 著者名/発表者名: Satoko Akashi, Masahiro Watanabe, Jonathan GHeddle, Satoru Unzai, Park SY, Jeremy R.H.Tame
  • 学会等名: 第21回国際結晶学連合会議
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 20080823-31
• [学会発表] Protonation states of buried histidine residues in human deoxyhemoglobin revealed by neutron crystallography (2008)
  • 著者名/発表者名: Park SY, Toshiyuki Chatake, Naoya Shibayama, Yukiko Morimoto
  • 学会等名: XVth International Conference on Oxygen Binding and Sensing Proteins
  • 発表場所: Aarhus, Denmark
  • 年月日: 20080817-21
• [学会発表] Crystal structure of the clock protein EA4 from the silkworm bombyx mori (2008)
  • 著者名/発表者名: Park SY, H. Hiraki, N. Shibayama, S. Akashi
  • 学会等名: 2^<nd> International conference on protein science
  • 発表場所: Cairns Ausrralia
  • 年月日: 20080622-26
• [学会発表] Crystal structures of the clock protein EA4 from the silkworm bombyx mori (2008)
  • 著者名/発表者名: Park SY, T.Hiraki, N.Shibayama, S.Akashi
  • 学会等名: The Joint 4th AOHUPO(Asian Oceania Human Proeome Organisation and 2nd PRICPS(Pacific Rim International Conference on Protein Science
  • 発表場所: Cairns, Australia
  • 年月日: 20080622-26
• [学会発表] Haemoglobin as a drug target (2008)
  • 著者名/発表者名: Takeshi Yokoyama, Satoru Unzai, Park SY, Jeremy Tame
  • 学会等名: The40th crystallographic meeting at Erice
  • 発表場所: Italy
  • 年月日: 20080529-0608
• [学会発表] Dynamic allostery in the ring protein TRAP. Biophysics of ligand binding to drug targets. Workshop (2007)
  • 著者名/発表者名: Heddle JG, Akashi S, Park SY, Tame JR
  • 学会等名: llkirch, Strasbourg
  • 発表場所: France
  • 年月日: 20070514-16
• [学会発表] Crystal structure of penicillin binding protein 4 (dacB) from Escherichia coli (2007)
  • 著者名/発表者名: Park SY, JRH Tame
  • 学会等名: Biophysics of ligand binding to drug targets. Workshop, llkirch, Strasbourg
  • 発表場所: France
  • 年月日: 20070514-16
• [学会発表] Crystal structure of penicillin binding protein 4 (dacB) from Escherichia coli (2007)
  • 著者名/発表者名: Park SY, JRH Tame
  • 学会等名: 24^<th> European Crystallographic Meeting
  • 発表場所: Marrakech, Morocco
  • 年月日: 20070000
• [産業財産権] 新規抗生剤の開発
  • 発明者名: 朴三用
  • 権利者名: 横浜市立大学
  • 産業財産権番号: 特願2008-213424