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主要組織適合遺伝子複合体(MHC)分子の進化研究において、魚類グループは動物系統発生的に大変重要なグループである。MHC分子群は最も原始的な有顎脊椎動物である軟骨魚類において初めて出現して来ている。本研究では、新たに得られるMHC関連遺伝子群の配列の詳細な解析を行う事により、有顎脊椎動物において生体防御の要として働いているMHC分子群の分子進化の理解を進展させることを目的としている。種々のデータベース解析と、実際にゲノムDNAまたはcDNAを用いたPCR実験法を組み合わせて、候補遺伝子断片の解明を実施した。これまでに得られたMHC関連遺伝子の部分配列を基に、遺伝子全体の配列を解析した。種々の組織、細胞のmRNAを用いRT-PCRにより発現解析を行ない、RACE法を用いてcDNA配列を解析した。MHC関連遺伝子の選択的スプライシング機構の存在については、MHCクラスI分子の軽鎖に関しても、PCR法を用いて詳細な解析を実施した。ゲノムDNA及びcDNAを基質としてPCRを行ない、産物の塩基配列を決定して比較検討し、エキソン/イントロン構造を明らかにした。また、得られた遺伝子情報に基づき、既知のMHC分子群構成メンバー等との配列比較解析を進めた。遺伝子産物のアミノ酸配列の整列を行ない、MHC関連分子のMHC分子群中での分子進化学的位置付けの解析を行なった。これまでのMHC関連遺伝子解析で得られた結果の総括を行なった。
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