藍藻グループ3型シグマ因子により認識されるプロモーター新規配列の解析

2009 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 19580078
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 応用微生物学
• 研究機関: 茨城大学
• 研究代表者: 朝山 宗彦 茨城大学, 農学部, 准教授 (50231907)
• 研究期間 (年度): 2007 – 2009
• キーワード: 光合成微生物 / シアノバクテリア(藍藻) / 転写制御 / RNAポリメラーゼ / シグマ因子

研究概要

ゲノム全塩基配列が解読されたモデル光合成生物シアノバクテリア(藍藻)の一種Synechocystis sp.PCC6803株の転写装置(RNA polymerase,RNAP)におけるシグマ因子(σ factor)SigFに着目し、グループ3型シグマ因子のこれまで全く知られていなかったプロモーター認識能について検証した。その結果、SigFシグマ因子のみが厳密に認識することのできる共通コア配列が(転写開始点を+1として)-32(TAGGC)と-12(GGTAA)領域に発見された。これをもとに藍藻PCC6803におけるシグマ因子群のプロモーター認識能を分類整理した。

研究成果

• [雑誌論文] Sigma Factors for Cyanobacterial Transcription (2009)
  • 著者名/発表者名: Imamura S, Asayama M
  • 雑誌名: Gene Regulation and Systems Biology 3 ページ: 65-87
  • 査読あり
• [雑誌論文] Stringent promoter recognition and autoregulation by the group 3 σ-factor SigF in the cyanobacterium Synechocystis sp. strain PCC 6803 (2008)
  • 著者名/発表者名: Asayama M, Imamura S
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 16 ページ: 5297-5305
  • 査読あり
• [学会発表] Interference Expression at Levels of the Transcript and Protein among Group 1, 2, and 3 Sigma Factor Genes in a Cyanobacterium (2009)
  • 著者名/発表者名: 朝山宗彦
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会 (2007年度) 年会・第80回日本生化学会合同大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2009-12-12
• [学会発表] Construction and Utilization of Cyanobacterial Expression Vector (2009)
  • 著者名/発表者名: ASAYAMA Munehiko, HIRANO Eriko, HANAMI Tomoyo, HORIE Yoshinao, NISHIZAWA Tomoyasu, SHIRAI Makoto
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2009-12-10
• [学会発表] 高効率プロモーターを有する藻発現ベクターの構築と利用 (2009)
  • 著者名/発表者名: 朝山宗彦, 平野恵理子, 花見知世, 堀江良尚, 西澤智康, 白井誠
  • 学会等名: ラン藻の分子生物学2009 (CYANO 2009)
  • 発表場所: かずさアカデミアホール
  • 年月日: 2009-12-05
• [学会発表] シグマ因子とRNaseE相互作用因子 : 転写・転写後調節のこれまでのまとめと今後 (2009)
  • 著者名/発表者名: 朝山宗彦
  • 学会等名: ラン藻ゲノム交流会
  • 発表場所: 東京大学駒場キャンパス16号館
  • 年月日: 2009-07-04
• [学会発表] Stringent promoter recognition and autoregulation by the group 3 sigma-factor SigF in the cyanobacterium Synechocystis sp. strain PCC 6803 (2008)
  • 著者名/発表者名: 朝山宗彦
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会 (2008年度) 年会・第81回日本生化学会合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2008-12-09
• [備考] ホームページ
  • URL: http://info.ibaraki.ac.jp/scripts/websearch/index.htm
• [備考]
  • URL: http://asam.agr.ibaraki.ac.jp/