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2008 年度 研究成果報告書

遺伝子マーカーを利用した海洋堆積物における硫酸還元細菌の分布生態と多様性解析

研究課題

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研究課題/領域番号 19580215
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 水産学一般
研究機関福井県立大学

研究代表者

近藤 竜二  福井県立大学, 生物資源学部, 准教授 (30244528)

研究期間 (年度) 2007 – 2008
キーワード硫酸還元細菌 / 亜硫酸還元酵素遺伝子 / 養殖漁場堆積物 / 有機汚濁 / リアルタイムPCR / PCR-DGGE
研究概要

本研究では、機能遺伝子をマーカーとして利用し、日本ならびに韓国の沿岸海域の底泥中における硫酸還元細菌の分布生態と多様性を解析した。まず、亜硫酸還元酵素遺伝子を標的とした定量PCR 法による硫酸還元細菌の計数方法を開発した。この方法によって底泥中の硫酸還元細菌を計数したところ、有機物汚濁の進行に伴って硫酸還元細菌が増加することが明らかとなった。PCR-DGGE によってその群集組成を調べた結果、主要な硫酸還元細菌がDesulfobacteraceae 科およびDesulfobulbaceae 科であったが、水域によって硫酸還元細菌の組成が異なることが明らかとなった。

  • 研究成果

    (17件)

すべて 2009 2008 2007 その他

すべて 雑誌論文 (6件) 学会発表 (10件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Dominantbacterioplankton populations in themeromictic Lake Suigetsu as determined bydenaturing gradient gel electrophoresis of16S rRNA gene fragments2009

    • 著者名/発表者名
      R. Kondo, A. Nakagawa, L. Mochizuki, K.Osawa, Y. Fujioka and J. Butani
    • 雑誌名

      Limnology 10(1)

      ページ: 63-69

  • [雑誌論文] Comparison of bacterialcommunities in fish farm sediments along anorganic enrichment gradient2009

    • 著者名/発表者名
      N. Kawahara, K. Shigematsu, T. Miyadaiand R. Kondo
    • 雑誌名

      Aquaculture 287 (1-2)

      ページ: 107-113

  • [雑誌論文] Rapid enumeration of sulphate-reducingbacteria from aquatic environments usingreal-time PCR2008

    • 著者名/発表者名
      R. Kondo, K. Shigematsu and J. Butani
    • 雑誌名

      Plankton & BenthosResearch 3 (3)

      ページ: 180-183

  • [雑誌論文] Distribution ofsulfate-reducing bacteria in fish firmsediments2008

    • 著者名/発表者名
      N. Kawahara, K. Shigematsu, S. Miura, T.Miyadai and R. Kondo
    • 雑誌名

      Plankton & Benthos Research 3(1)

      ページ: 42-45

  • [雑誌論文] Comparison of thediversity of sulfate-reducing bacterialcommunities in the water column andsurface sediments of a Japanese meromicticlake2007

    • 著者名/発表者名
      R. Kondo and J. Butani
    • 雑誌名

      Limnology 8 (2)

      ページ: 131-141

  • [雑誌論文] Spatial dynamics ofsulphate-reducing bacterial compositions insediments along a salinity gradient in a UKestuary2007

    • 著者名/発表者名
      R. Kondo, K. J. Purdy, S. Q. Silva and D. B.Nedwell
    • 雑誌名

      Microbes and Environments 22 (1)

      ページ: 11-19

  • [学会発表] T-RFLP 法による魚類養殖漁場底泥中の細菌群集組成の比較2009

    • 著者名/発表者名
      坂見知子、奥村 裕、村岡大祐、横山 寿、重松孝太朗、近藤竜二
    • 学会等名
      平成21 年度日本水産学会春季大会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2009-03-30
  • [学会発表] 日本および韓国沿岸域底泥中の硫酸還元細菌の分布と群集組成2009

    • 著者名/発表者名
      重松孝太朗、近藤竜二、坂見知子、横山寿、小泉喜嗣、尹 良湖
    • 学会等名
      平成21 年度日本水産学会春季大会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2009-03-28
  • [学会発表] 光合成硫黄細菌における亜硫酸還元酵素遺伝子の塩基配列の解析2008

    • 著者名/発表者名
      森 裕美、近藤竜二
    • 学会等名
      第24 回日本微生物生態学会
    • 発表場所
      札幌市
    • 年月日
      20081126-27
  • [学会発表] 沿岸域底泥中の硫酸還元細菌の分布と群集組成2008

    • 著者名/発表者名
      重松孝太朗、尹 良湖、近藤竜二
    • 学会等名
      第24 回日本微生物生態学会
    • 発表場所
      札幌市
    • 年月日
      20081126-27
  • [学会発表] 紅色硫黄酸化細菌に特異的なPCR プライマーの開発2008

    • 著者名/発表者名
      森 裕美、近藤竜二
    • 学会等名
      2008年日本プランクトン学会
    • 発表場所
      熊本市
    • 年月日
      2008-09-06
  • [学会発表] Specific detection ofpurple sulfur bacteria using PCR primersthat target dissimilatory sulfite reductasegene2008

    • 著者名/発表者名
      Y. Mori and R. Kondo
    • 学会等名
      12th International Symposium onMicrobial Ecology
    • 発表場所
      Cairns, Australia
    • 年月日
      2008-08-21
  • [学会発表] Comparison of bacterialcommunities in fish farm sediments along anorganic enrichment gradient2008

    • 著者名/発表者名
      R. Kondo, N. Kawahara, K. Shigematsu andT. Miyadai
    • 学会等名
      12thInternational Symposium on MicrobialEcology
    • 発表場所
      Cairns, Australia
    • 年月日
      2008-08-19
  • [学会発表] リアルタイムPCR法による硫酸還元細菌の迅速定量2008

    • 著者名/発表者名
      近藤竜二、重松孝太朗、部谷巡貴
    • 学会等名
      平成20 年度日本水産学会春季大会
    • 発表場所
      静岡市
    • 年月日
      2008-03-28
  • [学会発表] PCR法による海面養殖場底泥中の硫酸還元細菌の分布と多様性解析2007

    • 著者名/発表者名
      重松孝太朗、川原直城、近藤竜二
    • 学会等名
      平成19 年度日本水産学会秋季大会
    • 発表場所
      函館市
    • 年月日
      2007-09-26
  • [学会発表] Comparison of bacterialcommunities in fish farm sediments withdifferent pollution levels2007

    • 著者名/発表者名
      N. Kawahara, K. Shigematsu, T. Miyadaiand R. Kondo
    • 学会等名
      第23 回日本微生物生態学会
    • 発表場所
      松山市
    • 年月日
      2007-09-16
  • [備考] 近藤竜二.養殖場堆積物の微生物群集 平成20 年度日本水産学会水産増殖懇話会第2 回講演会(招待講演)

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公開日: 2010-06-10   更新日: 2016-04-21  

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