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2008 年度 実績報告書

ゲノム情報に基づく病原性放線菌Nocardiaの新しい同定法の確立

研究課題

研究課題/領域番号 19590441
研究機関千葉大学

研究代表者

三上 襄  千葉大学, 真菌医学研究センター, 教授 (40092100)

キーワードノカルジア / 病原放線菌 / 分子分類学 / 感染症 / gyrB遺伝子
研究概要

病原性Nocardiaの62種の中の主な菌種(56種)の基準種を用いて、必須遺伝子であるgyrBの解析情報に基づく新しい分類体系の確立を目的に研究を進めた。その結果、Nocardiaの56菌種内のgyrB遺伝子情報の相同性は、82.4〜99.9%であった。また解析した約1,200塩基数の中での違いは、2〜270塩基に相当することが明らかになった。gyrB情報に基づくNocardiaの系統学的な位置関係を16SrRNA遺伝子と比較した場合、gyrB遺伝子を用いた場合の系統樹は、16SrRNA遺伝子情報とほぼ同様な系統関係を示すことを確認することができた。さらに、gyrB遺伝子情報に基づく56菌種の系統的な位置関係の解像度は、16SrRNAの遺伝子に比べて(16SrRNAでは、94.4-100%であった)、3.6倍の差を示し、gyrB遺伝子が種の同定や分類において明らかに優れていることを証明することができた。gyrB遺伝子の相同性について、56菌種のそれぞれの菌種の中で、相互の相同性の関係が93.5%以上を同一菌種とした場合では、56菌種は、36菌種がそれぞれ2〜7菌種を含む13クラスターにわけられること、また残りの19菌種は、それぞれ一菌種からなるクラスターに分けることができた。
病原性放線菌の中で、Nocardiaと同じぐミコール酸を含む放線菌は8菌属があるがgyrB geneの特定の領域の配列を細いることにより、容易に区別する方法を見出し報告することができた。また、これらの情報に基づく簡便な鑑別法を考案して報告した。
また、Nocardiaと同様に、患者から多く分離される病原性の放線菌GordoniaについてもgyrB遺伝子とさらにsecA1遺伝子配列情報が、本菌種の鑑別に極めて有用であることを明らかにすることができた。

  • 研究成果

    (14件)

すべて 2009 2008 その他

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (6件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Phylogenetic studies of Gordonia species based on gyrB and secAl gene analysis2009

    • 著者名/発表者名
      Kang Y, Mikami Y, 他2名
    • 雑誌名

      Mycopathol 167

      ページ: 95-100

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Nocardia brasiliensisによる皮膚ノカルジア症の小児例2009

    • 著者名/発表者名
      吉田和恵, 三上襄, 他2名
    • 雑誌名

      臨床皮膚科 63

      ページ: 145-147

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Nocardia exalbida brain abscess in a partient with follicular lymphoma2008

    • 著者名/発表者名
      Ono M, Mikami Y, 他6名
    • 雑誌名

      Int J Hematol 88

      ページ: 95-100

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cloning of the gene cluster responsible for the biosynthesis brasilicardin A, a unique diterpenoid2008

    • 著者名/発表者名
      Hayashi, Mikami Y, 他5名
    • 雑誌名

      J Antibiot 61

      ページ: 164-167

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 口腔臨床に必要な真菌学「口腔内科学」(尾崎登喜雄)(飛鳥出版社)2008

    • 著者名/発表者名
      明見能成, 三上襄
    • ページ
      11-17
  • [雑誌論文] 医科細菌学(改定第4版)(笹川千尋、林哲也)(南江堂)2008

    • 著者名/発表者名
      三上襄
    • ページ
      390
  • [雑誌論文] カリニ肺炎、放線菌による感染症、薬剤抵抗性細菌2008

    • 著者名/発表者名
      三上襄
    • 雑誌名

      微生物の事典(渡辺真ら4名編)(朝倉書店)

  • [学会発表] 中国貴陽医学院で分離された病原性酵母の分類学的研究2008

    • 著者名/発表者名
      康穎倩, 三上襄, 他2名
    • 学会等名
      第52回日本医真菌学会総会
    • 発表場所
      長崎
    • 年月日
      20080910-20080911
  • [学会発表] Nocardia brasiliensisによる皮膚ノカルジア症の2例2008

    • 著者名/発表者名
      岩沢真理, 三上襄, 他2名
    • 学会等名
      第52回日本医真菌学会総会
    • 発表場所
      長崎
    • 年月日
      20080910-20080911
  • [学会発表] NBRP・ナショナルバイオリソースプロジェクト「病原微生物」-真菌・放線菌2008

    • 著者名/発表者名
      田中玲子, 三上襄, 他4名
    • 学会等名
      日本微生物資源学会第15回大会
    • 発表場所
      千葉
    • 年月日
      20080630-20080702
  • [学会発表] アゾール系抗菌剤clotrimazoleのNocardia farcinicaにおける標的分子の探索2008

    • 著者名/発表者名
      志保沢里奈, 三上襄, 他1名
    • 学会等名
      日本微生物資源学会第15回大会
    • 発表場所
      千葉
    • 年月日
      20080630-20080702
  • [学会発表] 新たに臨床材料から分離されたRothia sp. について2008

    • 著者名/発表者名
      青山一紀, 三上襄, 他1名
    • 学会等名
      日本微生物資源学会第15回大会
    • 発表場所
      千葉
    • 年月日
      20080630-20080702
  • [学会発表] gyrB遺伝子によるNocardia属菌群の分類(multilocus sequence typingを目指して)2008

    • 著者名/発表者名
      五ノ井透, 武田健二郎, 志賀祐介, 松澤哲弘, 三上襄
    • 学会等名
      2008年度日本放線菌学会
    • 発表場所
      山梨
    • 年月日
      20080000
  • [備考]

    • URL

      http://www.pf.chiba-u.ac.jp/

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公開日: 2010-06-11   更新日: 2016-04-21  

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