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2007 年度 実績報告書

RNAネットワークを内包した人工細胞の創成

研究課題

研究課題/領域番号 19651091
研究機関京都大学

研究代表者

齊藤 博英  京都大学, 生命科学研究科, 助教 (20423014)

キーワード人工細胞モデル / 情報変換素子 / RNA / リポソーム / 無細胞蛋白質合成 / シンセティックバイオロジー / 翻訳制御
研究概要

核酸や蛋白質などの化学物質から、進化する生命システムがいかにして誕生したのかという問題の解決は、生命科学が目指す大きな目標の一つである。本申請研究では、(1)機能性RNA-蛋白質(RNP)複合体を試験管内で再構成できる基盤技術を開発し、(2)このRNPを利用して、転写後の遺伝子翻訳を自在に制御できる人工翻訳制御システムを構築する。さらに、(3)このシステムを人工脂質二重膜に内包させ、in vitroにおけるRNAネットワークを内包した細胞モデルの実験進化系を構築する。本年度は、人工翻訳制御システムを内包した人工細胞モデルの作成に特に着目し、研究を進めた。具体的には、無細胞蛋白質合成系であるPURE SYSTEMを内包したリポソームを作成し、個々のリポソームにおける遺伝子発現反応をモニタリング・定量するシステムを新たに開発した(2008年度特許出願済、論文投稿中)。これはリアルタイムで複数のリポソームの動き、遺伝子発現を解析できるこれまでにないシステムであり、人工細胞モデル構築の基盤技術としての利用が期待できる。また、micro RNAなどの低分子RNAを基質として、翻訳をON/OFF制御する人工システムを構築し、これをリポソームに内包することで、目的低分子RNA存在時のみ遺伝子を発現する人工リポソームの作成に成功した。これらの研究成果は、RNAを入力因子として、目的の蛋白質の出力に変換できる、細胞内外で人工遺伝子回路を構築するための「人工情報変換素子」としての利用が期待できる。

  • 研究成果

    (21件)

すべて 2009 2008 2007 その他

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 6件) 学会発表 (5件) 図書 (2件) 備考 (1件) 産業財産権 (7件) (うち外国 2件)

  • [雑誌論文] Synthetic biology with RNA motifs2009

    • 著者名/発表者名
      Hirohide Saito, Tan Inoue
    • 雑誌名

      The International Journal of Biochemistry & Cell Biology 41

      ページ: 398-404

    • 査読あり
  • [雑誌論文] A designed RNA selection: establishment of a stable complex between a target and selectant RNA via two2009

    • 著者名/発表者名
      Tomoaki Shiohara, Hirohide Saito, Tan Inoue
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research 37

      ページ: e23

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Motif-programmed artificial protein induces apoptosis in several cancer cells by disrupting mitochondria2008

    • 著者名/発表者名
      Hirohide Saito, Tamiko Minamisawa, Takao Yamori, Kiyotaka Shiba
    • 雑誌名

      Cancer Science 99

      ページ: 398-406

    • 査読あり
  • [雑誌論文] RNA and RNP as new molecular parts in synthetic biology2007

    • 著者名/発表者名
      Hirohide Saito, Tan Inoue
    • 雑誌名

      Journal of Biotechnology 132

      ページ: 1-7

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Motif programming: a microgene-based method for creating synthetic proteins containing multiple functional motifs2007

    • 著者名/発表者名
      Hirohide Saito, Tamiko Minamisawa, Kiyotaka Shiba
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research 35

      ページ: e38

    • 査読あり
  • [雑誌論文] The role of peptide motifs in the evolution of a protein network2007

    • 著者名/発表者名
      Hirohide Saito, Shunichi Kashida, Tan Inoue, Kiyotaka
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research 35

      ページ: 6357-6366

    • 査読あり
  • [学会発表] RNP相互作用モチーフを活用したシンセティック・バイオロジー2008

    • 著者名/発表者名
      Hirohide Saito
    • 学会等名
      第10回日本RNA学会年会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      20080723-20080725
  • [学会発表] RNP-based nanostructures and translational regulatory switches in vitro2008

    • 著者名/発表者名
      Hirohide Saito
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Laboratory meeting: Engineering Principles in Biological Systems
    • 発表場所
      コールドスプリングハーバーLab、アメリカ合衆国
    • 年月日
      2008-12-12
  • [学会発表] RNA-タンパク質相互作用モチーフを用いたナノスケール構造体の分子設計および構築2008

    • 著者名/発表者名
      大野博久
    • 学会等名
      BMB2008
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2008-12-09
  • [学会発表] Synthetic Translational Regulation with RNP Motifs2008

    • 著者名/発表者名
      Hirohide Saito
    • 学会等名
      First International Frontiers in Synthetic Biology -2008- Meeting on Synthetic Biology: Engineering Genes, Genomes & Cells for Drug Discovery
    • 発表場所
      ハーバード大学、アメリカ合衆国、ボストン
    • 年月日
      2008-12-02
  • [学会発表] Synthetic Biology with RNA Motifs2008

    • 著者名/発表者名
      Hirohide Saito
    • 学会等名
      The First Annual Meeting of the Japanese Society for Researchers on Cell Synthesis(細胞を創る研究会1. 0)
    • 発表場所
      大阪大学
    • 年月日
      2008-10-17
  • [図書] ゲノム中に潜むRNA機能構造モチーフ2009

    • 著者名/発表者名
      齊藤博英
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      細胞工学、秀潤社
  • [図書] ナノブロックとしてのRNA分子、バイオナノプロセス2008

    • 著者名/発表者名
      齊藤博英、井上丹
    • 総ページ数
      10
    • 出版者
      シーエムシー出版
  • [備考]

    • URL

      http://kuchem.kyoto-u.ac.jp/seika/

  • [産業財産権] 機能性RNA-蛋白質複合体の分子デザイン2008

    • 発明者名
      齊藤博英, 倉光祥平, 菊田雅之, 井上丹
    • 権利者名
      JST
    • 産業財産権番号
      特願:2008-297752
    • 出願年月日
      2008-11-21
  • [産業財産権] RNPモチーフを利用した、蛋白質応答型shRNA/RNAi制御システム2008

    • 発明者名
      齊藤博英, 樫田俊一, 林香倫, 井上丹
    • 権利者名
      JST
    • 産業財産権番号
      特願:2008-312951
    • 出願年月日
      2008-12-09
  • [産業財産権] RNPナノ構造体の作成法2008

    • 発明者名
      齊藤博英, 大野博久, 井上丹
    • 権利者名
      JST
    • 産業財産権番号
      特願:2008-188241
    • 出願年月日
      2008-07-22
  • [産業財産権] 低分子RNAによる細胞または人工細胞モデルでの翻訳制御システム2008

    • 発明者名
      齊藤博英, 加藤祐章, 吉川研一, 山田彩子, 山中透, 井上丹
    • 権利者名
      JST
    • 産業財産権番号
      特願:PCT/JP 2008/071214
    • 出願年月日
      2008-11-21
    • 外国
  • [産業財産権] RNP翻訳制御システムの作成法2008

    • 発明者名
      齊藤博英, 小林哲大, 原知明, 井上丹
    • 権利者名
      JST
    • 産業財産権番号
      特願:PCT/JP 2008/071213
    • 出願年月日
      2008-11-21
    • 外国
  • [産業財産権] RNP翻訳制御システムの作成法2008

    • 発明者名
      齊藤博英, 小林哲大, 原知明, 井上丹
    • 権利者名
      JST
    • 産業財産権番号
      特願:2008-186385
    • 出願年月日
      2008-07-22
  • [産業財産権] 低分子RNAによる細胞または人工細胞モデルでの翻訳制御システム2007

    • 発明者名
      齊藤博英, 加藤祐章, 吉川研一, 山田彩子, 山中透, 井上丹
    • 権利者名
      JST
    • 産業財産権番号
      特願:2007-303661
    • 出願年月日
      2007-11-22

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公開日: 2010-06-11   更新日: 2016-04-21  

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