研究課題
遺伝子の根幹である2本鎖DNAを認識する分子は生命の基本原理を理解するためのツールとしてだけではなく、遺伝子発現の選択的な制御によるくすりとしての開発も期待されるため、2本鎖DNAの配列情報に基づく一般的なルールの確立に関する研究が多くなされてきた。しかしそのルールの確立にはまだ至っていないのが現状である。さらに研究が進むにつれ、DNAの高次構造が遺伝子発現制御機構に重要な役割を果たしている可能性が次々と示されているが、DNA高次構造の認識分子を論理的に分子設計するのは非常に困難であると考えられる。そこで本研究では、クリックケミストリーを応用したコンビナトリアル化学を用いて、2本鎖DNA認識分子の新しい検索法の開発を検討することとした。本年度はまず低分子としてインターカレーターであるアクリジン誘導体及びすでに2本鎖DNAに結合することがしられているペプチドを用いて、2本鎖DNAをテンプレートとする、クリックケミストリー反応が進行する条件を検討した。その結果、アジド基を有するアクリジン誘導体とアセチレンを官能基としてN末端に持つDNA結合性ペプチドを用いて、2本鎖DNA上で反応が加速されることがわかった。また本反応効率がアジド基とアクリジンを結合するスペーサーの長さにより異なること、さらに固相に結合させたペプチド上でも反応が加速することを見出すことができた。これらの結果は本方法がDNA結合分子を検索する方法として適用できることを示すものであると考えている。
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