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Gastrointestinal stromal tumor(GIST)は、消化管間葉系腫瘍のなかで最も頻度の高い腫瘍である。KITやPDGFRA遺伝子変異だけでは、GISTの多様な分子病態を説明する事はできない。近年、マイクロRNA(以下miRNA)の役割が注目されているが、GISTにおけるmiRNA発現異常や下流の標的遺伝子に関しては全く報告がない。本研究では、GISTにおけるmiRNA発現異常を解析し、その病態を解明することを目的とする。本年度は、GISTのジェネティック、エピジェネティック異常と関連するmiRNA発現の解析を系統的に行った。癌抑制遺伝子SFRP、DKK、WIF1などのメチル化は、上皮性の癌と比較して低頻度であった。一方、ゲノムワイドな低メチル化の指標となることが報告されている反復配列LINE-1の低メチル化がしばしば見られることを明らかにした。従って、GISTでは個々の癌抑制遺伝子のhypermethylationより、ゲノムワイドなhypomethylationがより多く見られた。現在、miRNAの網羅的発現を解析中であり、ジェネティック、エピジェネティック異常との関連を明らかにしていく予定である。
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