実際的簡潔データ構造の開発と大量データ活用

2010 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 19680001
• 研究種目: 若手研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 情報学基礎
• 研究機関: 国立情報学研究所
• 研究代表者: 定兼 邦彦 国立情報学研究所, 情報学プリンシプル研究系, 准教授 (20323090)
• 研究期間 (年度): 2007 – 2010
• キーワード: データ圧縮 / 情報検索 / 文字列検索 / 簡潔データ構造 / 接尾辞配列 / 接尾辞木 / 圧縮接尾辞配列 / 順序木

研究概要

これまで理論的な研究だけが行われてきた簡潔データ構造に対し,現実の計算機で用いる際の問題点を解決した,実際的な簡潔データ構造を開発した.順序木に対しては,既存の簡潔データ構造のサイズを4割削減し,なおかつこれまで実現できなかった多くの演算を行えるようになった.また,文字列検索の簡潔データ構造である圧縮接尾辞配列,圧縮接尾辞木のライブラリを作成した.これにより,110ギガバイトの文書データからの検索を行うためのデータ構造のサイズを680ギガバイトから22ギガバイトに圧縮することができた.

研究成果

• [雑誌論文] Random Access to grammar-Compressed Strings (2011)
  • 著者名/発表者名: P.Bille, G.M.Landau, R.Raman, K.Sadakane, S.S.Rao, O.Weimann.
  • 雑誌名: Proceedings of ACM-SIAM SODA ページ: 373-389
  • 査読あり
• [雑誌論文] Faster Computation of the Robinson-Foulds Distance between Phylogenetic Networks (2010)
  • 著者名/発表者名: T.Asano, J.Jansson, K.Sadakane, R.Uehara, G.Valiente
  • 雑誌名: Proceedings of CPM LNCS 6129 ページ: 190-201
  • 査読あり
• [雑誌論文] 高速復元可能な接尾辞配列圧縮法 (2010)
  • 著者名/発表者名: 田中洋輔, 小野廣隆, 定兼邦彦, 山下雅史
  • 雑誌名: 電子情報通信学会論文誌D J93-D(8) ページ: 1567-1575
  • 査読あり
• [雑誌論文] Fully-Functional Succinct Trees (2010)
  • 著者名/発表者名: K.Sadakane, G.Navarro
  • 雑誌名: Proceedings of ACM-SIAM SODA ページ: 134-149
  • 査読あり
• [雑誌論文] Succinct Trees in Practice (2010)
  • 著者名/発表者名: D.Arroyuelo, R.Canovas, G.Navarro, K.Sadakane
  • 雑誌名: Proceedings of Workshop on Algorithm Engineering and Experiments (ALENEX) ページ: 84-97
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Linear-Time Burrows-Wheeler Transform Using Induced Sorting (2009)
  • 著者名/発表者名: D.Okanohara, K.Sadakane
  • 雑誌名: Proceedings of SPIRE LNCS5721 ページ: 90-101
  • 査読あり
• [雑誌論文] Breaking a Time-and-Space Barrier in Constructing Full-Text Indices (2009)
  • 著者名/発表者名: W.K.Hon, K.Sadakane, W.K.Sung
  • 雑誌名: SIAM Journal on Computing 38(6) ページ: 2162-2178
  • 査読あり
• [雑誌論文] An Online Algorithm for Finding the Longest Previous Factors (2008)
  • 著者名/発表者名: D.Okanohara, K.Sadakane
  • 雑誌名: Proc.16th Annual European Symposium (ESA) LNCS 5193 ページ: 696-707
  • 査読あり
• [雑誌論文] Faster Suffix Sorting (2007)
  • 著者名/発表者名: J.Larsson, K.Sadakane
  • 雑誌名: Theoretical Computer Science 387(3) ページ: 258-272
  • 査読あり
• [雑誌論文] Compressed Suffix Trees with Full Functionality. (2007)
  • 著者名/発表者名: K.Sadakane
  • 雑誌名: Theory of Computing Systems. 41(4) ページ: 589-607
  • 査読あり
• [雑誌論文] Succinct Data Structures for Flexible Text Retrieval Systems (2007)
  • 著者名/発表者名: K.Sadakane
  • 雑誌名: Journal of Discrete Algorithms 5(1) ページ: 12-22
  • 査読あり
• [学会発表] 文法圧縮された文字列のランダムアクセス (2010)
  • 著者名/発表者名: 定兼邦彦
  • 学会等名: 日本オペレーションズ・リサーチ学会研究部会画期における最適化
  • 発表場所: 京都大学
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] 順序木の簡単・簡潔な表現法 (2009)
  • 著者名/発表者名: 定兼邦彦
  • 学会等名: 日本オペレーションズ・リサーチ学会研究部会画期における最適化
  • 発表場所: 京都大学
  • 年月日: 2009-11-26
• [学会発表] 動的簡潔順序木 (2009)
  • 著者名/発表者名: 定兼邦彦
  • 学会等名: 電子情報通信学会コンピュテーション研究会
  • 発表場所: 京都大学
  • 年月日: 2009-04-17
• [学会発表] 括弧列の簡単・簡潔な表現法 (2008)
  • 著者名/発表者名: 定兼邦彦
  • 学会等名: 電子情報通信学会コンピュテーション研究会
  • 発表場所: 東北大学
  • 年月日: 2008-10-10
• [学会発表] DNA配列に適した圧縮全文索引 (2008)
  • 著者名/発表者名: 定兼邦彦
  • 学会等名: 電子情報通信学会コンピュテーション研究会
  • 発表場所: 日本IBM東京基礎研究所
  • 年月日: 2008-03-10
• [備考] ホームページ等
  • URL: http://researchmap.jp/sada/csalib/