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2008 年度 実績報告書

ディファレンシャル・ユビキチン化プロテオミクスを用いた植物病害抵抗性因子の同定

研究課題

研究課題/領域番号 19710169
研究機関独立行政法人理化学研究所

研究代表者

中神 弘史  独立行政法人理化学研究所, 植物免疫研究チーム, 研究員 (20435663)

キーワードプロテオーム / 植物 / シグナル伝達
研究概要

作物の安定生産は、人口増加に伴う食糧危機を回避する一つの手段として重要な課題である。長年の交配による抵抗性品種の選抜育成および様々な農薬の開発にも関わらず、現在でも約3割の作物が、細菌、カビ、線虫、ウィルス、昆虫等の植物病原体や雑草の被害により失われている。その解決策として本研究は、植物の病害抵抗性に関与するタンパク質をプロテオミクス的解析手法を用いて同定・解析することで植物病害抵抗性の分子機構の理解を深め、得られた知見に基づく効率的な品種改良により、農薬にも頼らない持続的な耐病性作物の作出を目指す。
本研究は病原体接種時にユビキチン修飾が誘導される植物側の因子の網羅的解析を目的としている。比較修飾プロテオーム解析の遂行には、1)網羅的解析用へのLC-MSシステムの最適化、2)修飾タンパク質の精製法の確立、3)LC-MSを用いた比較定量解析法の確立、が主要な研究課題となる。リン酸化タンパク質の精製法がユビキチン化タンパク質の精製法と比較して既により確立されていることより、まず病原体接種時のリン酸化の比較変動解析を通じて1)3)を試みた。その成果として、LC-MSシステムの最適化および安定同位体標識による比較定量法の確立に成功したことに加えて、植物で初めてタンパク質のリン酸化状態の包括的な解析に成功し、論文として発表した。また、ユビキチン化タンパク質の精製法の改良も行い、改良法によるユビキチン化タンパク質の同定に成功した。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2009 2008 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (1件) 備考 (3件)

  • [雑誌論文] Large-scale phosphorylation mapping reveals the extent of tyrosine phosphorylation in Arabidopsis2008

    • 著者名/発表者名
      Naoyuki Sugiyama
    • 雑誌名

      Molecular Systems Biology 4

      ページ: 193

    • 査読あり
  • [学会発表] シロイヌナズナおよびイネにおけるリン酸化部位の大規模解析(リン酸化プロテオミクス)2009

    • 著者名/発表者名
      中神弘史
    • 学会等名
      日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2009-03-22
  • [備考]

    • URL

      http://ksg.psc.riken.jp/Proiects_J.html

  • [備考]

    • URL

      http://omicspace.riken.jp/gps/

  • [備考]

    • URL

      http://pepbase.iab.keio.ac.jp/phospho/msb/

URL: 

公開日: 2010-06-11   更新日: 2016-04-21  

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