ディファレンシャル・ユビキチン化プロテオミクスを用いた植物病害抵抗性因子の同定

2008 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 19710169
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 応用ゲノム科学
• 研究機関: 独立行政法人理化学研究所
• 研究代表者: 中神 弘史 独立行政法人理化学研究所, 植物免疫研究チーム, 研究員 (20435663)
• 研究期間 (年度): 2007 – 2008
• キーワード: 植物病害抵抗性 / プロテオミクス / ユビキチン化 / シグナル伝達

研究概要

本研究は病原体接種時にユビキチン化される植物側の因子の網羅的解析を目的としている。比較修飾プロテオーム解析の遂行には、1)網羅的解析用へのLC-MSシステムの最適化、2)修飾タンパク質の精製法の確立、3)LC-MSを用いた比較定量解析法の確立、が主要な研究課題となる。本研究成果として、LC-MSシステムの最適化および安定同位体標識による比較定量法の確立、そして改良型のユビキチン化タンパク質精製法を用いたユビキチン化タンパク質の同定に成功した。

研究成果

• [雑誌論文] Large-scale phosphorylation mapping reveals the extent of tyrosine phosphorylation in Arabidopsis (2008)
  • 著者名/発表者名: Naoyuki Sugiyama, Hirofumi Nakagami, Keiichi Mochida, Arsalan Daudi, Masaru Tomita, Ken Shirasu, Yasushi Ishihama
  • 雑誌名: Molecular Systems Biology 4 ページ: 193
  • 査読あり
• [雑誌論文] Trojan horse strategy in Agrobacterium transformation : abusing MAPK defense signaling (2007)
  • 著者名/発表者名: Armin Djamei, Andrea Pitzschke, Hirofumi Nakagami, Iva Rajh, Heribert Hirt
  • 雑誌名: Science 318(5849) ページ: 453-456
  • 査読あり
• [雑誌論文] ユビキチン結合領域を利用したユビキチン化タンパク質の精製法 (2007)
  • 著者名/発表者名: 中神弘史, 白須賢
  • 雑誌名: BIOバイオテクノロジージャーナル 9-10月号 ページ: 594-598
• [学会発表] 、シロイヌナズナおよびイネにおけるリン酸化部位の大規模解析(リン酸化プロテオミクス) (2009)
  • 著者名/発表者名: 中神弘史
  • 学会等名: 日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 名古屋大学
  • 年月日: 2009-03-22
• [学会発表] Plant Phosphoproteome by Hydroxy Acid-Modified Metal Oxide Chromatography (HAMMOC) (2008)
  • 著者名/発表者名: 杉山直幸
  • 学会等名: HUPO 7^<th> Annual World Congress
  • 発表場所: Amsterdam (Netherlands)
  • 年月日: 2008-08-19
• [学会発表] Global phosphoproteome analysis of Arabidopsis (2008)
  • 著者名/発表者名: 中神弘史
  • 学会等名: International symposium on Frontier in plant proteome research
  • 発表場所: つくば農林ホール
  • 年月日: 2008-03-10
• [学会発表] Hydroxy Acid-Modified Metal Oxide Chromatography (HAMMOC) for phosphoproteomics of plants (2008)
  • 著者名/発表者名: 杉山直幸
  • 学会等名: International symposium on Frontier in plant proteome research
  • 発表場所: つくば農林ホール
  • 年月日: 2008-03-10
• [備考]
  • URL: http://ksg.psc.riken.jp/Projects_J.html
• [備考]
  • URL: http://omicspace.riken.jp/gps/
• [備考]
  • URL: http://pepbase.iab.keio.ac.jp/phospho/msb/