高次元オミックスデータとヘテロ医療診断データの統合的解析法の開発

2008 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 19710172
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 応用ゲノム科学
• 研究機関: 京都大学 (2008); 奈良先端科学技術大学院大学 (2007)
• 研究代表者: 大羽 成征 京都大学, 大学院・情報学研究科, 講師 (80362838)
• 研究期間 (年度): 2007 – 2008
• キーワード: バイオインフォマティクス / 遺伝子発現量データ / 多変量解析 / 多重検定 / 行列因子化

研究概要

近年の臨床医学データ解析では、解析対象となる変量に高次元性・ヘテロ性・欠測などの問題があること、解析結果出力時に統計的検定多重性の問題があることが困難を生んでいる。これらの問題の統合的解決法として、柔軟な確率モデルと統計的多重検定法の発展応用に基づく手法を開発した。

研究成果

• [学会発表] Re-weighted ODP for differential gene expression analysis (2008)
  • 著者名/発表者名: Nomura, H., Oba, S., and Ishii, S.
  • 学会等名: International Symposium on Artificial Life and Robotics (AROB 13th '08)
  • 発表場所: Oita Japan
  • 年月日: 20080000
• [学会発表] Collaborative filtering based on a Weighted Maximum Margin Matrix Factorization (2008)
  • 著者名/発表者名: Furuya, M., Oba, S., and Ishii, S.
  • 学会等名: International Symposium on Artificial Life and Robotics (AROB 13th '08)
  • 発表場所: Oita Japan
  • 年月日: 20080000
• [学会発表] 検定多重性とサンプル個性を利用した臨床ラベル関連遺伝子探索 (2008)
  • 著者名/発表者名: 大羽成征、石井信
  • 学会等名: 電子情報通信学会ニューロコンピューティング研究会
  • 発表場所: 琉球大学
  • 年月日: 20080000
• [学会発表] 最大マージン行列因子化法の確率モデル化と行列データの欠測予測 (2008)
  • 著者名/発表者名: 古谷允宏、大羽成征、石井信
  • 学会等名: 第11回情報論的学習理論ワークショップ
  • 発表場所: 仙台国際センター
  • 年月日: 20080000
• [学会発表] 典型パターン因子を統計量として用いた経験ベイズ検定による差異発現遺伝子検出法 (2008)
  • 著者名/発表者名: 大羽成征,石井信
  • 学会等名: 第11回情報論的学習理論ワークショップ
  • 発表場所: 仙台国際センター
  • 年月日: 20080000
• [学会発表] Heterogeneous Component Analysis (2007)
  • 著者名/発表者名: Oba, S., Kawanabe, M., Mueller, K-R., and Ishii, S.
  • 学会等名: proceedings of 21st annual conference on Neural Information Processing Systems
  • 発表場所: Vancouver Canada
  • 年月日: 20070000
• [学会発表] 二方向因子分析による行列データの欠損予測 (2007)
  • 著者名/発表者名: 袖林和宏、大羽成征、石井信
  • 学会等名: 情報論的学習理論ワークショップ
  • 発表場所: 東京工業大学
  • 年月日: 20070000
• [学会発表] 隠れ変数モデルに基づく同時検定用統計量最適化 (2007)
  • 著者名/発表者名: 大羽成征、石井信
  • 学会等名: 情報論的学習理論ワークショップ
  • 発表場所: 東京工業大学
  • 年月日: 20070000
• [学会発表] 多重検定のための検定統計量最適化:隠れ変数を仲立ちとした情報共有に基く新しいアプローチについて (2007)
  • 著者名/発表者名: 大羽成征、石井信
  • 学会等名: 統計関連学会連合大会
  • 発表場所: 神戸大学
  • 年月日: 20070000
• [学会発表] 二方向因子分析による欠測データ予測 (2007)
  • 著者名/発表者名: 袖林和広、大羽成征、石井信
  • 学会等名: 統計関連学会連合大会
  • 発表場所: 神戸大学
  • 年月日: 20070000
• [備考]
  • URL: http://hawaii.sys.i.kyoto-u.ac.jp/~oba/