エピジェネティクス制御を指向したヒストンテールペプチドライブラリの構築

2008 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 19710181
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生物分子科学
• 研究機関: 東北大学 (2008); 東京大学 (2007)
• 研究代表者: 坂本 清志 東北大学, 多元物質科学研究所, 助教 (30335228)
• 研究期間 (年度): 2007 – 2008
• キーワード: 生体機能関連物質 / ポリペプチド / ライブラリ

研究概要

本研究では様々なアミノ酸側鎖翻訳後修飾を位置特異的に施したヒストンテールポリペプチドライブラリの構築を行った。さらに、構築したライブラリを用いて、代表的クロマチン関連因子由来のブロモドメインやクロモドメインとの相互作用を解析した。また、得られた情報に基づき、ヒストン認識ドメインや人工の刺激応答部位を複合化した分割型 GFPを設計し、任意のタンパク質翻訳後修飾反応や外部刺激を特異的に検出可能な蛍光プローブを構築することに成功した。

研究成果

• [雑誌論文] Design of Photoactivable Split-GFP by Incorporation of A Photolabile Linker (2009)
  • 著者名/発表者名: S. Sakamoto, Y. Araki, T. Wada
  • 雑誌名: Peptide Science 2008 ページ: 487-490
  • 査読あり
• [雑誌論文] Resin-Bound Peptide Catalyzed Asymmetric Synthesis under Aqueous Conditions (2009)
  • 著者名/発表者名: K. Akagawa, H. Akabane, T. Fujiwara, T. Yamashita, S. Sakamotro, K. Kudo
  • 雑誌名: Peptide Science 2008 ページ: 529-530
  • 査読あり
• [雑誌論文] Asymmetric transfer hydrogenation in aqueous media catalyzed by resin-supported peptide having polyleucine tether (2009)
  • 著者名/発表者名: K. Akagawa, H. Akabane, S. Sakamoto, K. Kudo
  • 雑誌名: Tetrahedron : Asymmetry 20 ページ: 461-466
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cyclo[-His-His-] Derived C2-Symmetric Diketopiperazine as Chiral Ligand for Asymmetric Diels-Alder Reactions (2009)
  • 著者名/発表者名: M. Furutani, S. Sakamoto, K. Kudo
  • 雑誌名: Heterocycles 78 ページ: 1171-1176
  • 査読あり
• [雑誌論文] Supramolecular Control of Split-GFP Reassembly by Conjugation of β-Cyclodextrin and Coumarin Units (2008)
  • 著者名/発表者名: S. Sakamoto, K. Kudo
  • 雑誌名: J. Am. Chem. Soc 130 ページ: 9574-9582
  • 査読あり
• [雑誌論文] Organocatalytic Asymmetric Transfer Hydrogenation in Aqueous Media using Resin-Supported Peptide having Polyleucine (2008)
  • 著者名/発表者名: K. Akagawa, H. Akabane, S. Sakamoto, . Kudo
  • 雑誌名: Org. Lett 10 ページ: 2035-2037
  • 査読あり
• [雑誌論文] Glucose Responsive Two-step Release of Hydrogel-Immobilized Protein (2008)
  • 著者名/発表者名: K. Murota, S. Sakamoto, K. Kudo
  • 雑誌名: Chem. Lett 37 ページ: 582-583
  • 査読あり
• [雑誌論文] Construction of β-Cyclodextrin and Fluorophore Conjugated Split-GFP Whose Reassembly Is Accelerated by the Addition of Hydrophobic Guest Molecules (2008)
  • 著者名/発表者名: S. Sakamoto, K. Kudo
  • 雑誌名: Peptide Science 2007 ページ: 455-458
  • 査読あり
• [雑誌論文] Design and Characterization of Split-GFP Whose Reassembly Is Accelerated by Phosphorylation (2008)
  • 著者名/発表者名: M. Kasahara, S. Sakamoto, K. Kudo
  • 雑誌名: Peptide Science 2007 ページ: 459-463
  • 査読あり
• [雑誌論文] Reversible Immobilization of Protein into Hydrogel Using Designed Coiled-coil Peptides (2007)
  • 著者名/発表者名: K. Murota, S. Sakamoto, K. Kudo
  • 雑誌名: Chem. Lett 36 ページ: 1320-1321
  • 査読あり
• [雑誌論文] Orientation Control of Self-stacking D,L-Alternating Cyclic Octa-α-peptide through Multiple Electrostatic Interactions (2007)
  • 著者名/発表者名: K. Murota, S. Sakamoto, K. Kudo
  • 雑誌名: Chem. Lett 36 ページ: 1070-1071
  • 査読あり
• [学会発表] 外部刺激応答機能を持つ分割型 GFP 変異体を用いた高感度検出システムへの応用 (2009)
  • 著者名/発表者名: 坂本清志, 寺内美香, 荒木保幸, 和田健彦
  • 学会等名: 日本化学会第89春季年会
  • 発表場所: 船橋
  • 年月日: 2009-03-29
• [学会発表] 外部刺激応答型緑色蛍光タンパク質の合成と蛍光検出への応用 (2009)
  • 著者名/発表者名: 寺内美香, 坂本清志, 荒木保幸, 和田健彦
  • 学会等名: 日本化学会第89春季年会
  • 発表場所: 船橋
  • 年月日: 2009-03-29
• [学会発表] Cyvlo[His-His]型キラル配位子を用いた銅触媒不斉 Diels-Alder 反応 (2009)
  • 著者名/発表者名: 古谷昌太, 坂本清志, 工藤一秋
  • 学会等名: 日本化学会第89春季年会
  • 発表場所: 船橋
  • 年月日: 2009-03-28
• [学会発表] 塩基部配向規制因子としてフェニルボロン酸を有するペプチドリボ核酸 (PRNA) の RNA 錯体形成解離の pH による制御 (2009)
  • 著者名/発表者名: 遠藤絵梨子, 下司慶一郎, 坂本清志,荒木保幸, 井上佳久, 和田健彦
  • 学会等名: 日本化学会第89春季年会
  • 発表場所: 船橋
  • 年月日: 2009-03-28
• [学会発表] アルギニンおよびセリン含有 α-ペプチドリボ核酸の合成と DNA・RNA との相互作用 (2009)
  • 著者名/発表者名: 小野寺恵子, 西尾明洋, 坂本清志, 荒木保幸, 井上佳久, 和田健彦
  • 学会等名: 日本化学会第89春季年会
  • 発表場所: 船橋
  • 年月日: 2009-03-28
• [学会発表] 固相担持プロリル触媒を用いた分子内 Baylis-Hillman 反応 (2009)
  • 著者名/発表者名: 赤川賢吾, 坂本清志, 工藤一秋
  • 学会等名: 日本化学会第89春季年会
  • 発表場所: 船橋
  • 年月日: 2009-03-28
• [学会発表] レーザー励起による DNA-カチオン性ポルフィリン複合体の時間分解円二色性 (2009)
  • 著者名/発表者名: 村上憤, 荒木保幸, 坂本清志, 和田健彦
  • 学会等名: 日本化学会第89春季年会
  • 発表場所: 船橋
  • 年月日: 2009-03-28
• [学会発表] 外部刺激による緑色蛍光タンパク質の機能制御 (2008)
  • 著者名/発表者名: 坂本清志
  • 学会等名: 第11回生命化学研究会
  • 発表場所: 水上
  • 年月日: 2008-11-28
• [学会発表] 光によって活性化される分割型緑色蛍光タンパク質の設計 (2008)
  • 著者名/発表者名: 坂本清志, 荒木保幸, 和田健彦
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2008-10-29
• [学会発表] 樹脂固定化ペプチドを用いる水系溶媒中での触媒的不斉合成 (2008)
  • 著者名/発表者名: 赤川賢吾, 赤羽 創, 藤原巧真, 山下拓大, 坂本清志, 工藤一秋
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2008-10-29
• [学会発表] 外部刺激応答機能を持つ分割型緑色蛍光タンパク質変異体の設計 (2008)
  • 著者名/発表者名: 坂本清志, 和田健彦
  • 学会等名: 第3回バイオ関連化学合同シンポジウム
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2008-09-18
• [学会発表] β-シクロデキストリンと蛍光色素を複合化したGFP変異体の設計と半合成 (2008)
  • 著者名/発表者名: 坂本清志, 工藤一秋
  • 学会等名: 日本化学会第88春季年会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2008-03-28
• [学会発表] Construction of β-Cyclodextrin and Fluorophore Conjugated Split-GFP Whose Reassembly Is Accelerated by the Addition of Hydrophobic Guest Molecules (2007)
  • 著者名/発表者名: 坂本清志, 工藤一秋
  • 学会等名: 第44回ペプチド討論会
  • 発表場所: 富山
  • 年月日: 2007-11-08
• [学会発表] Design and Characterization of Split-GFP Whose Reassembly Is Accelerated by Phosphorylation (2007)
  • 著者名/発表者名: 笠原睦美, 坂本清志, 工藤一秋
  • 学会等名: 第44回ペプチド討論会
  • 発表場所: 富山
  • 年月日: 2007-11-08
• [学会発表] シクロデキストリン複合化緑色蛍光タンパク質の設計 (2007)
  • 著者名/発表者名: 坂本清志, 工藤一秋,
  • 学会等名: 第22回生体機能関連化学シンポジウム・若手フォーラム
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2007-09-30
• [学会発表] β-シクロデキストリンと蛍光色素を複合化した分割型GFP変異体の構築 (2007)
  • 著者名/発表者名: 坂本清志, 工藤一秋
  • 学会等名: 第22回生体機能関連化学シンポジウム
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2007-09-30
• [学会発表] タンパク質翻訳後修飾反応の検出を指向した分割型GFP変異体の構築 (2007)
  • 著者名/発表者名: 笠原睦美, 坂本清志, 工藤一秋
  • 学会等名: 第22回生体機能関連化学シンポジウム
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2007-09-29