シクロデキストリンによる包接現象及び分子認識に関する分子シミュレーション

2009 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 19740261
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生物物理・化学物理
• 研究機関: 山口大学
• 研究代表者: 浦上 直人 山口大学, 大学院・理工学研究科, 講師 (50314795)
• 研究期間 (年度): 2007 – 2009
• キーワード: 計算物理 / 超分子化学 / 自己組織化 / 分子認識 / ナノ材料

研究概要

シクロデキストリンと高分子鎖の包接化合物形成を調べるために、粗視化モデルを構築し、シミュレーションを行った。その結果、擬ポリロタキサンの形成過程の様子を明らかにすることができた。擬ポリロタキサン形成後、シクロデキストリンは振動とシフトの2種類の運動により、高分子鎖上をランダムウォークすることを見出した。シクロデキストリンの分子認識に関しては、高分子鎖の鎖長認識を再現することができ、その認識メカニズムを明らかにすることができた。

研究成果

• [雑誌論文] Simulation of pseudopolyrotaxane formation and orientational order between pseudopolyrotaxanes (2010)
  • 著者名/発表者名: N. Urakami, J. Imada, T. Yamamoto
  • 雑誌名: J. Chem. Phys. 132 ページ: 054901(1-7)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Simulation of Chain Length Recognition Observed in Formation of Inclusion Complex
  • 著者名/発表者名: N. Urakami, J. Imada, T. Yamamoto
  • 雑誌名: Comput. Phys. Comm. (accepted)(in print)
  • 査読あり
• [雑誌論文] シクロデキストリンの包接化合物形成と分子認識-粗視化モデルを用いたシミュレーション-
  • 著者名/発表者名: 浦上直人
  • 雑誌名: 分子シミュレーション研究会会誌 (掲載決定)
  • 査読あり
• [学会発表] Simulation of Chain Length Recognition in the Formation of Inclusion Complex (2009)
  • 著者名/発表者名: N. Urakami, J. Imada, T. Yamamoto
  • 学会等名: Conference on Computational Physics
  • 発表場所: Kaohsiung(Taiwan)
  • 年月日: 2009-12-18
• [学会発表] 擬ポリロタキサンの形成と鎖長認識シミュレーション (2009)
  • 著者名/発表者名: 浦上直人、今田絢子、山本隆
  • 学会等名: 第58回高分子学会討論会
  • 発表場所: 熊本
  • 年月日: 2009-09-18
• [学会発表] 環状分子による鎖長認識メカニズムの解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 浦上直人、今田絢子、山本隆
  • 学会等名: 第58回高分子学会年次大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2009-05-28
• [学会発表] 包接化合物形成における鎖長認識メカニズム (2008)
  • 著者名/発表者名: 今田絢子、浦上直人、山本隆
  • 学会等名: 第22回分子シミュレーション討論会
  • 発表場所: 岡山
  • 年月日: 2008-11-17
• [学会発表] Simulation of the formation of inclusion complex and the molecular recognition (2008)
  • 著者名/発表者名: N. Urakami, J. Imada, T. Yamamoto
  • 学会等名: The 2008 Conference on Computational Physics
  • 発表場所: Ouro Preto (Brazil)
  • 年月日: 2008-08-08
• [学会発表] 包接化合物形成における分子認識シミュレーション (2008)
  • 著者名/発表者名: 浦上直人、今田絢子、山本隆
  • 学会等名: 第57回高分子学会年次大会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2008-05-28
• [学会発表] シクロデキストリンの分子認識シミュレーション (2007)
  • 著者名/発表者名: 今田絢子、浦上直人、山本隆
  • 学会等名: 第21回分子シミュレーション討論会
  • 発表場所: 金沢
  • 年月日: 2007-11-27
• [学会発表] 包接化合物の安定性による鎖長認識メカニズムの解明 (2007)
  • 著者名/発表者名: 浦上直人、今田絢子、山本隆
  • 学会等名: 日本物理学会第62回年次大会
  • 発表場所: 札幌
  • 年月日: 2007-09-23
• [学会発表] The Molecular Dynamics Simulation of Inclusion Complex Formation (2007)
  • 著者名/発表者名: N. Urakami, J. Imada, T. Yamamoto
  • 学会等名: YITP Workshop 2007 New Frontiers in Colloidal Physics: A Bridge between Micro- and Macroscopic Concepts in Soft Matter
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2007-07-26
• [学会発表] 環状分子と高分子鎖における包接・解離シミュレーション (2007)
  • 著者名/発表者名: 今田絢子、浦上直人、山本隆
  • 学会等名: 第56回高分子学会年次大会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2007-05-29
• [備考]
  • URL: http://www.mms.sci.yamaguchi-u.ac.jp/~urakami/index.html