アカガエル上科の分子系統地理学的研究:ゴンドワナ超大陸の分断と無尾類分岐の相関

2009 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 19770064
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生物多様性・分類
• 研究機関: 広島大学
• 研究代表者: 倉林 敦 広島大学, 大学院・理学研究科, 助教 (00327701)
• 研究期間 (年度): 2007 – 2009
• キーワード: ゴンドワナ大陸 / 分子系統地理 / 分岐年代解析 / アカガエル科 / ヒメアマガエル科 / ミトゲノム / 遺伝子配置 / 分子進化

研究概要

太古のゴンドワナ大陸の分断とカエル類の現在の分布と系統分岐が相関するかをDNAデータから検証する為に研究を行い、以下の成果を挙げた。(1)カエル類のミトゲノムを簡便に増幅できるプライマーを作成した。(2)分岐年代解析にはアミノ酸配列を用いることが望ましいことを示した。(3)アジアのヒメアマガエル類の一部は、オーストラリア産のグループと近縁で、大陸分断プロセスとは一致しない可能性があることを明らかにした。

研究成果

• [雑誌論文] Complete mitochondrial DNA sequence of the endangered frog Odorrana ishikawae (family Ranidae) and unexpected diversity of mt gene arrangement in ranids (2010)
  • 著者名/発表者名: 倉林敦、吉川夏彦、佐藤直樹、林陽子、大海昌平、藤井保、住田正幸
  • 雑誌名: Mol. Phylogenet. Evol 56巻 ページ: 543-553
  • 査読あり
• [雑誌論文] PCR Primers for the neobatrachian mitochondrial genome (2009)
  • 著者名/発表者名: 倉林敦、住田正幸
  • 雑誌名: Current Herpetology 28巻 ページ: 1-11
  • 査読あり
• [雑誌論文] Phylogeny, recombination, and mechanisms of stepwise mitochondrial genome reorganization in mantellid frogs from Madagascar (2008)
  • 著者名/発表者名: 倉林敦、住田正幸、米川博道、Frank Glaw、Miguel Vences、長谷川政美
  • 雑誌名: Mol. Biol Evol 25巻 ページ: 847-891
  • 査読あり
• [雑誌論文] anurans: A case study of divergence time estimation using different data and calibration settings (2008)
  • 著者名/発表者名: 井川武、倉林敦、臼杵知佐子、藤井保、住田正幸
  • 雑誌名: Gene 407巻 ページ: 116-129
  • 査読あり
• [学会発表] 無尾両生類の系統学の現在:高次系統・系統地理・DNAバーコーディング・ミトゲノムの進化 (2009)
  • 著者名/発表者名: 倉林敦
  • 学会等名: 第11回日本進化学会(ワークショップ・脊椎動物の高次系統と分子進化)
  • 発表場所: 札幌市
  • 年月日: 20090902-20090904
• [学会発表] 動物ミトゲノムの分子進化メカニズム:マダガスカルガエル科で観察された大規模なゲノム再編成に基づく新たなモデルの提唱 (2009)
  • 著者名/発表者名: 倉林敦, (他5名)
  • 学会等名: 第11回日本進化学会
  • 発表場所: 札幌市(一般発表)
  • 年月日: 20090902-20090904
• [学会発表] Primers for neobatrachian mtDNAs, mt genomic structures in afrobatrachians, and ranoid phylogeny (2008)
  • 著者名/発表者名: 倉林敦、住田正幸
  • 学会等名: 6th World Congress of Herpetology
  • 発表場所: マナウス、ブラジル
  • 年月日: 20080817-20080822
• [学会発表] Primers for neobatrachian frog mtDNA and unique mt genomic structures found in arthroleptoid families (2007)
  • 著者名/発表者名: 倉林敦、住田正幸
  • 学会等名: Asia-Africa Evolutionary Meeting
  • 発表場所: 千葉
  • 年月日: 20071204-20071206
• [学会発表] Complete mitochondrial genomes of three neobatrachian anurans: A case study of divergence time estimation using different data and calibration settings (2007)
  • 著者名/発表者名: 井川武、倉林敦、臼杵知佐子、藤井保、住田正幸
  • 学会等名: Asia-Africa Evolutionary Meeting
  • 発表場所: 千葉
  • 年月日: 20071204-20071206
• [備考] ホームページ等
  • URL: http://home.hiroshima-u.ac.jp/~amphibia/sumida/