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2008 年度 実績報告書

イカロドプシンのX線結晶構造解析

研究課題

研究課題/領域番号 19770129
研究機関名古屋大学

研究代表者

村上 緑  名古屋大学, 理学研究科, 助教 (20324387)

キーワードロドプシン / X線結晶構造解析 / GPCR
研究概要

視物質ロドプシンは網膜視細胞に存在する光受容膜蛋白質である。無脊椎動物のロドプシンは、脊椎動物のロドプシンとは対照的に光活性型アシッドメタ中間体が安定であり、また、生体内に普遍的に存在するGq型G蛋白質と共役するという特徴をもつ。研究代表者らはスルメイカのロドプシンについてX線結晶構造解析を行い、昨年度までに基底状態の立体構造を2.5A分解能で決定し、無脊椎動物型ロドプシンの機能を裏付ける特徴的な構造を解明した。今年度は光反応初期中間体であるバソロドプシンの結晶構造解析を目指し、イカロドプシン結晶中でバソ反応中間体を捕捉する条件を検討した。すなわち、液体窒素温度に冷却した結晶に対して、適当な波長の光を照射することで発色団レチナールの光異性化を促した。その結果、青色光照射によりバソ反応中間体(全トランス型) と、橙色光照射によりロドプシン(11-cis型) とイソロドプシン(9-cis型) の混合状態とを可逆的に生成することに成功した。ロドプシンとイソロドプシンの存在比率は照射する光の波長で制御可能であり、バソ反応中間体とイソロドプシンのそれぞれを結晶中で効率良く捕捉できる条件を見出すことができた。バソ反応中間体についてはX線回折実験を行い、回折条件の検討を行った。一方、130K以上で青色光照射によりバソ中間体からルミ中間体へと熱緩和し、160Kで効率よくルミ中間体を捕捉できる条件を見出した。

  • 研究成果

    (16件)

すべて 2009 2008 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (9件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] イカロドプシンの結晶構造と無脊椎動物の視覚2009

    • 著者名/発表者名
      村上緑
    • 雑誌名

      生物物理 49

      ページ: 15-16

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Functionally important structural elements of the cyanobacterial clock-related protein Pex2009

    • 著者名/発表者名
      S. Kurosawa, R. Murakami, K. Onei, M. Morishita, D. Hasegalira, R. Iwase, T. Uzumaki, F. Hayashi, T. Kitajima-Ihara, S. Sakata, M. Murakami, T. Kouyama and M. Ishiura
    • 雑誌名

      Genes Cells 14

      ページ: 1-16

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effect of xenon binding to a hydrophobic cavity on the proton pumping cycle in bacteriorhodopsin2008

    • 著者名/発表者名
      N. Hayakawa, T. Kasahara, D. Hasegawa, K. Yoshimura, M. Murakami and T. Kouyama
    • 雑誌名

      J. Mol. Biol. 384

      ページ: 812-823

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of squid rhodopsin2008

    • 著者名/発表者名
      M. Murakami and T. Kouyaina
    • 雑誌名

      Nature 453

      ページ: 363-367

    • 査読あり
  • [雑誌論文] スルメイカロドプシンのX線結晶構造解析2008

    • 著者名/発表者名
      村上緑、神山勉
    • 雑誌名

      実験医学 26

      ページ: 2237-2240

    • 査読あり
  • [学会発表] イカロドプシン光反応初期中間体の構造解析2009

    • 著者名/発表者名
      村上緑、神山勉
    • 学会等名
      第4回日本生物物理学会中部支部討論会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2009-03-31
  • [学会発表] イカロドプシン光異性化反応の構造解析2009

    • 著者名/発表者名
      村上緑
    • 学会等名
      シンポジウム : 名大の生物物理の生誕50周年
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2009-03-26
  • [学会発表] バクテリオロドプシンのアルカリpHでの光誘起構造変化2008

    • 著者名/発表者名
      山本昌孝、村上緑、神山勉
    • 学会等名
      日本生物物理学会第46回年会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      20081203-05
  • [学会発表] イカロドプシンのX線結晶構造解析2008

    • 著者名/発表者名
      村上緑、神山勉
    • 学会等名
      日本生物物理学会第46回年会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      20081203-05
  • [学会発表] Crystallization of visual pigments and archaeal rhodopsins2008

    • 著者名/発表者名
      T. Kouyama, M. Murakami, K. Yoshimura and M. Yamamoto
    • 学会等名
      XXI Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography
    • 発表場所
      Osaka
    • 年月日
      20080823-31
  • [学会発表] Protein-lipid interactions in 3D crystals of squid rhodopsin and archaeal rhodopsins2008

    • 著者名/発表者名
      T. Kouyama, M. Murakami and K. Yoshimura
    • 学会等名
      13 th International conference of retinal proteins
    • 発表場所
      Barcelona
    • 年月日
      20080615-19
  • [学会発表] Dimeric structure of squid rhodopsin2008

    • 著者名/発表者名
      M. Murakami and T. Kouyama
    • 学会等名
      13 th International conference of retinal proteins
    • 発表場所
      Barcelona
    • 年月日
      20080615-19
  • [学会発表] スルメイカロドプシンのX線結晶構造解析2008

    • 著者名/発表者名
      村上緑、神山勉
    • 学会等名
      第8回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      20080610-12
  • [学会発表] X-ray structure of squid rhodopsin2008

    • 著者名/発表者名
      M. Murakami
    • 学会等名
      International symposium on membrane proteins and high resolution X-ray structural analysis
    • 発表場所
      Hyogo
    • 年月日
      2008-09-01
  • [備考]

    • URL

      http://www.nagoya-u.ac.jp/pdf/research/news/20080515_sci.pdf?20090424

  • [備考]

    • URL

      http://www.spring8.or.jp/ja/current_result/press_release/2008/080515-2

URL: 

公開日: 2010-06-11   更新日: 2016-04-21  

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