タマネギとのシンテニーを利用したネギ染色体の集中マッピング

2008 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 19780010
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 育種学
• 研究機関: 独立行政法人農業技術研究機構
• 研究代表者: 塚崎 光 独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構, 野菜茶業研究所・野菜育種研究チーム, 主任研究員 (30355622)
• 研究期間 (年度): 2007 – 2008
• キーワード: ネギ / タマネギ / シンテニー / 集中マッピング / 座乗染色体 / SSR マーカー / 単一染色体添加 / 欠失系統 / 抽苔性

研究概要

近年、タマネギおよびネギでDNA マーカーが開発されるとともに連鎖地図が作成されている。また、ネギとシャロットの種間雑種に由来する単一染色体添加/欠失系統(以下添加/欠失系統)が山口大学で育成されている。本研究では、タマネギとネギのシンテニーを利用して、マーカーの座乗染色体を明らかにするとともに、抽苔時期に関する遺伝子座領域を連鎖地図から明らかにした。

研究成果

• [雑誌論文] olecular and biochemical identification of alien chromosome additions in shallot (Allium cepa L. Aggregatum group) carrying extra chromosome(s) of bunching onion (A. fistulosum L.) (2009)
  • 著者名/発表者名: Yaguchi, S., T.T.M. Hang, H. Tsukazaki, H ( 他8 名)
  • 雑誌名: Genes Genet. Syst. 84 ページ: 43-55
  • 査読あり
• [雑誌論文] onstruction of SSR-based chromosome map in bunching onion (Allium fistulosum) (2008)
  • 著者名/発表者名: Tsukazaki H., K. Yamashita, S. Yaguchi, 他9 名
  • 雑誌名: Theor. Appl. Genet. 117 ページ: 1213-1223
  • 査読あり
• [雑誌論文] Applications of DNA marker technology in Japanese bunching onion. (2008)
  • 著者名/発表者名: Tsukazaki, H., T. Nunome, H. Fukuoka, 他7 名
  • 雑誌名: Acta Hort. 770 ページ: 153-158
• [雑誌論文] Isolation of 1,796 SSR clones from SSR-enriched DNA libraries of bunching onion (Allium fistulosum) (2007)
  • 著者名/発表者名: Tsukazaki, H., T. Nunome, H. Fukuoka, 他5 名
  • 雑誌名: Euphytica 157 ページ: 83-94
  • 査読あり
• [学会発表] Determination of the chromosomal location of bunching onion SSRs and bulb onion EST markers using a complete set of bunching onion-shallot monosomic addition lines and allotriploid-bunching onion single-alien deletion lines (2009)
  • 著者名/発表者名: Tsukazaki, H., K. Yamashita, S. Yaguchi, 他4名
  • 学会等名: Plant and Animal Genome XVII Conference
  • 発表場所: San Diego, CA, USA
  • 年月日: 20090110-14
• [学会発表] Determination of the Chromosomal Location of Bunching Onion SSRs and Bulb Onion EST Markers using a Complete Set of Bunching Onion-Shallot Monosomic Addition Lines and Allotriploid-Bunching Onion Single-Alien Deletion Lines (2009)
  • 著者名/発表者名: McCallum, J., Y. Deng, 他6 名(7 番目)
  • 学会等名: Plant and Animal Genome XVII Conference
  • 発表場所: San Diego, CA, USA
  • 年月日: 20090110-14
• [学会発表] ネギ-シャロット単一染色体添加/欠失系統を利用したネギSSR およびタマネギEST の座乗染色体特定.園芸学研究 7(別2): 204. (2008)
  • 著者名/発表者名: 塚崎光, 山下謙一郎, 谷口成紀, 他6 名
  • 学会等名: 園芸学会
  • 発表場所: 三重大学
  • 年月日: 20080927-29
• [学会発表] Construction of SSR-based chromosome map of bunching onion (Allium fistulosum). Isolation of 1,796 SSR clones from SSRenriched DNA libraries of bunching onion (Allium fistulosum) (2007)
  • 著者名/発表者名: Tsukazaki, H., K. Yamashita, N. Matsubara, 他8 名
  • 学会等名: V International ISHS Symposium on Edible Alliaceas (ASEA)
  • 発表場所: Dronten, The Netherlands
  • 年月日: 20071029-31
• [学会発表] Isolation of 1,796 SSR clones from SSR-enriched DNA libraries of bunching onion (Allium fistulosum) (2007)
  • 著者名/発表者名: Tsukazaki H., T. Nunome, H. Fukuoka, 他5 名
  • 学会等名: V International ISHS Symposium on Edible Alliaceas (ASEA)
  • 発表場所: Dronten, The Netherlands
  • 年月日: 20071029-31
• [備考] ホームページ等
  • URL: http://vegmarks.nivot.affrc.go.jp/VegMarks/jsp/index.jsp
• [備考] 野菜DNA データベース(VegMarks)