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2008 年度 実績報告書

計算科学的手法を用いたインフルエンザウイルスヘマグルチニンの構造変化解析

研究課題

研究課題/領域番号 19780223
研究機関北海道大学

研究代表者

五十嵐 学  北海道大学, 人獣共通感染症リサーチセンター, 博士研究負 (10374240)

キーワードインフルエンザ / ウイルス / 感染症 / 生体生命情報学 / 分子シミュレーション / 蛋白質
研究概要

本研究では、計算科学的手法を用いて、インフルエンザウイルスの抗原変異に伴う抗原構造の変遷をアミノ酸変化と立体構造の変化から明らかにするため、以下の研究を遂行した。
(1) 抗原変異に伴う糖鎖付加パターンの抽出
(1) 配列解析による糖鎖付加部位の変遷履歴の作成
抗原変異に伴って、N-結合型糖鎖付加モチーフ(Asn-X-Ser/Thr)がどのように変遷して来たのかを塩基配列から抽出し、糖鎖付加部位の変遷を時系列で解析した。
(2) 配列解析による糖鎖付加部位の候補となるモチーフの抽出
遺伝子の1塩基変異でN-結合型糖鎖付加モチーフとなる部位を配列から抽出し、糖鎖付加部位の予測方法を開発した。
(3) 配列から抽出した糖鎖付加候補部位の3次構造上での評価
PDBのDB探索研究の結果から出の3次構造上どの様な場所に糖鎖が付加しやすいかを評価した。
(2) 抗原抗体反応の分子シミュレーション
(1) 抗原抗体反応の結合シミュレーション
HAと抗体が結合した結晶構造(PDBコード : IEO8やIQFU)を用いて、蛋白質問結合シミュレーションのテスト計算を行った。
(3) 新型インフルエンザウイルスが人の間で流行した場合の抗原変異の予測モデルを検討
得られた過去の抗原変異パターンを、現在新型インフルエンザとして、人の間での流行が懸念されている鳥インフルエンザウイルスに当てはめ、抗原変異の予測モデルを検討した。

  • 研究成果

    (8件)

すべて 2009 2008

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (2件)

  • [雑誌論文] Cross-Protective Potential of a Novel Monoclonal Antibody Directed against Antigenic Site B of the Hernagglutinin of Influenza A Viruses2009

    • 著者名/発表者名
      Reiko Yoshida
    • 雑誌名

      PLoS Pathog 5(3)

      ページ: 1000350

    • 査読あり
  • [雑誌論文] バイオインフォマティクスを用いたインフルエンザウイルスヘマグルチニンの糖鎖付加ポテンシャルの予測2009

    • 著者名/発表者名
      五十嵐学
    • 雑誌名

      Glycomicrobiology Jan. 31

      ページ: 04

  • [雑誌論文] Genetically destined potentials for N-linked glycosylation of influenza virus hemagglutinin2008

    • 著者名/発表者名
      Manabu Igarashi
    • 雑誌名

      Virology 376

      ページ: 323-329

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Heterosubtyoic Cross-Neutralization of Influenza A Viruses by a Novel Hemagglutination-Inhibiting Monoclonal Antibody2008

    • 著者名/発表者名
      Reiko Yoshida
    • 雑誌名

      Options for the control of influenza VI 1

      ページ: 255-256

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genetically destined potentials for N-linked glycosylation associated with antigenic changes of influenza virus hemagglutinin2008

    • 著者名/発表者名
      Manabu Igarashi
    • 雑誌名

      Options for the control of influenza VI 1

      ページ: 405-407

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of the Molecular Determinants Required for Duck H9N2 Influenza Virus Replication in Chickens2008

    • 著者名/発表者名
      Noriko Kishida
    • 雑誌名

      Options for the control of influenza VI 1

      ページ: 549-550

    • 査読あり
  • [学会発表] インフルエンザウイルスHA遺伝子の塩基配列上に潜在する糖鎖付加ポテンシャルの解析2008

    • 著者名/発表者名
      五十嵐学, 他
    • 学会等名
      第56回日本ウイルス学術集会
    • 発表場所
      岡山(岡山コンベンションセンター)
    • 年月日
      2008-10-26
  • [学会発表] Genetically destined potentials for N-linked glycosylation of influenza virus hemagglutinin2008

    • 著者名/発表者名
      Manabu Igarashi
    • 学会等名
      Taiwan-Japan AI Prevention and Control Conference
    • 発表場所
      Taiwan(行政院膿業委員会家畜衛生試験所)
    • 年月日
      2008-05-02

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公開日: 2010-06-11   更新日: 2016-04-21  

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