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2007 年度 実績報告書

安定同位体標識技術を利用した糖鎖の精密構造解析法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 19790039
研究機関独立行政法人理化学研究所

研究代表者

山口 芳樹  理化学研究所, 糖鎖構造生物学研究チーム, チームリーダー (90323451)

キーワード生物分子構造学 / 安定同位体標識
研究概要

1.高感度^<13>C検出法による高分子量糖タンパク質糖鎖の帰属法の開発
動物細胞を利用した糖鎖修飾つきの糖タンパク質の大量発現系を利用して、安定同位体(13C)標識糖タンパク質を調製した。得られた標識糖タンパク質を対象として^<13>C検出に適したNMR低温プローブを用いて^<13>C検出型のNOESY/TOCSYを測定した。その結果、良好な感度の^<13>C-^<13>Cの2次元相関スペクトルを得ることに成功した。これらの^<13>C検出型のスペクトルは従来の1H検出型のスペクトルと組み合わせて解析することにより、高分子量糖タンパク質の糖鎖シグナルの帰属に有効であることが判明した。この計測技術を利用すれば、糖タンパク質の構造解析・機能解析のブレイクスルーとなることが期待される。
2.ヒドロキシルプロトンに着目した糖鎖の構造解析
一般に糖鎖〓タンパク質、糖鎖〓糖鎖相互作用には水素結合が重要な役割を担っているが、その検出は通常困難である。今年度は、糖鎖の水素結合の情報を抽出するために、NMRを用いて糖鎖ヒドロキシルプロトンの溶媒との交換速度の交換速度のpHや温度の依存性を明らかとした。さらにその基礎データに基づき、Lewis x糖鎖のヒドロキシルプロトンの水素結合形成にともなう交換速度の低下を観測することに成功した。さらにLewis xとCa^<2+>の微弱な相互作用にともなうヒドロキシルプロトンの交換速度の低下を観測することにも成功した。次年度は、これらの研究成果を糖鎖-糖鎖、糖鎖-タンパク質の相互作用解析に応用する予定である。

  • 研究成果

    (11件)

すべて 2008 2007

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (6件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] 920 MHz ultra-high field NMR approaches to structural glycobiology2008

    • 著者名/発表者名
      K. Kato
    • 雑誌名

      Biochim Biophys Acta. (in press)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Fbsl protects the malfolded glycoproteins from the attack of peptide: N-glycanase2007

    • 著者名/発表者名
      Y. Yamaguchi
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Commun. 362

      ページ: 712-716

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural comparison of fucosylated and nonfucosylated Fc fragments of human immunoglobulin G12007

    • 著者名/発表者名
      S. Matsumiya
    • 雑誌名

      J. Mol. Biol. 368

      ページ: 767-779

    • 査読あり
  • [学会発表] 920MHz超高磁場NMR装置を利用した生体高分子・超分子の構造解析2008

    • 著者名/発表者名
      山口芳樹
    • 学会等名
      中部地区ナノテクノロジー・ネットワーク総合支援成果報告会
    • 発表場所
      岡崎
    • 年月日
      2008-03-18
  • [学会発表] 糖タンパク質糖鎖の立体構造解析の現状と今後の課題2008

    • 著者名/発表者名
      山口芳樹
    • 学会等名
      理研シンポジウム「第11回生体分子の化学」
    • 発表場所
      和光
    • 年月日
      2008-01-25
  • [学会発表] Detailed Substrate specificities of sulfotransferases and glycosyltransferases as revealed by multi-dimensional HPLC mapping method2007

    • 著者名/発表者名
      Hirokazu Yagi
    • 学会等名
      第3回国際糖類分子免疫学学術会議
    • 発表場所
      台湾
    • 年月日
      20070708-11
  • [学会発表] 糖タンパク質の輸送を司るカーゴレセプターによる糖鎖認識の特異性の解析2007

    • 著者名/発表者名
      神谷由紀子
    • 学会等名
      第27回日本糖質学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2007-08-02
  • [学会発表] 糖鎖構造生物学のための安定同位体標識技術の開発と応用2007

    • 著者名/発表者名
      山口芳樹
    • 学会等名
      第27回日本糖質学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2007-08-01
  • [学会発表] フコース結合型および欠失型ヒト免疫グロブリンG1のFcフラグメントの構造比較2007

    • 著者名/発表者名
      松宮茂樹
    • 学会等名
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2007-05-25
  • [図書] 抗体医薬の最前線2007

    • 著者名/発表者名
      山口芳樹
    • 総ページ数
      11
    • 出版者
      CMC出版
  • [図書] Comprehensive Glycoscience2007

    • 著者名/発表者名
      Y. Yamaguchi
    • 総ページ数
      19
    • 出版者
      Elsevier Science Ltd

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公開日: 2010-02-04   更新日: 2016-04-21  

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