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2008 年度 実績報告書

安定同位体標識技術を利用した糖鎖の精密構造解析法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 19790039
研究機関独立行政法人理化学研究所

研究代表者

山口 芳樹  独立行政法人理化学研究所, 糖鎖構造生物学研究チーム, チームリーダー (90323451)

キーワード生物分子構造学 / 安定同位体標識
研究概要

これまで糖鎖水酸基の関与する水素結合の情報を抽出するために、13C-NMRを用いて糖鎖ヒドロキシルプロトンの溶媒との交換速度の算出方法を開発し、Lewis x糖鎖のヒドロキシルプロトンの水素結合形成にともなう交換速度の低下を観測することに成功してきた。今年度は、オリゴ糖鎖のみならずアミロースやべータグルカンなどの多糖に本方法を適用した。その結果、アミローズでは鎖長に依存せずにO3や水素結合形成が観測されたのに対して、ベータグルカンの場合では鎖長に依存してO2で水素結合の形成が観測されるようになった。これらの知見は多糖のヘリックス形成の構造基盤を明らかにする上で基礎的な知見となる。
また、前年度に引き続き13C標識を施した高分子量糖タンパク質糖鎖のNMRシグナルの帰属法として13C検出型のNMR測定を検討した。その結果、分子量5万程度の糖タンパク質に関しては、13C-TOCSYに比べて13C-NOESY計測の方が高感度にシグナルを検出できることが判明した。13C直接検出を利用した本帰属法はHCCH-COSY/TOCSYなどの1H検出型の帰属法と相補的であり、両方法を併用することにより高分子量糖タンパク質糖鎖のシグナルを効率的に帰属することが可能になると考えられる。

  • 研究成果

    (13件)

すべて 2009 2008

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 6件) 学会発表 (5件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] A ^<13>C-detection NMR approach for large glycoproteins2009

    • 著者名/発表者名
      Y. Yamaguchi
    • 雑誌名

      Carbohydr. Res. (in press)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure of the putative 32 kDa myrosinase-binding protein from Arabidopsis (At3g16450.1) determined by SAIL-NMR2008

    • 著者名/発表者名
      M. Takeda
    • 雑誌名

      FEBS J. 275

      ページ: 5873-5884

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Development and application of stable-isotope-labeling methods orientied to structural glycobiology2008

    • 著者名/発表者名
      Y. Yamaguchi
    • 雑誌名

      Trends Glycosci. Glycotechnol. 20

      ページ: 117-130

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Development and application of high performance liquid chromatography map of glucuronyl N-glycans2008

    • 著者名/発表者名
      H. Yagi
    • 雑誌名

      Open Glycoscience 1

      ページ: 8-18

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural and molecular basis for hyperspecificity of RNA aptamer to human immunoglobulin G2008

    • 著者名/発表者名
      S. Miyakawa
    • 雑誌名

      RNA 14

      ページ: 1154-1163

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 920 MHz ultra-high, field NMR approaches to structural glycobiology2008

    • 著者名/発表者名
      K. Kato
    • 雑誌名

      Biochim Biophys Acta. 1780

      ページ: 619-625

    • 査読あり
  • [学会発表] 13C-NMRの同位体シフト効果を用いた糖類の水素結合観測への試み2009

    • 著者名/発表者名
      花島慎弥
    • 学会等名
      日本農芸化学会2009年度大会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      20090327-29
  • [学会発表] StruGutural glycobiology for elucidating the function of glycoprpteins-a multifaceted approach2008

    • 著者名/発表者名
      Yoshiki Yamaguchi
    • 学会等名
      International Symposium on Systems Glycobiology -A Bridge between Functional Glycomics and Chemical Biology-
    • 発表場所
      品川
    • 年月日
      2008-12-05
  • [学会発表] 糖鎖の機能解明を目指した糖鎖構造生物学2008

    • 著者名/発表者名
      山口芳樹
    • 学会等名
      第6回糖鎖科学コンソーシアムシンポジウム-糖鎖研究と他領域との統合-
    • 発表場所
      品川
    • 年月日
      2008-12-04
  • [学会発表] Development of an NMR Method for Structural Analysis of Oligosaccharides2008

    • 著者名/発表者名
      Yoshiki Yamaguchi
    • 学会等名
      2008 Annual Meeting of the Society for Glycobiology
    • 発表場所
      テキサス
    • 年月日
      2008-11-13
  • [学会発表] 糖鎖ヒドロキシルプロトンの交換速度を算出するためのNMR法の開発2008

    • 著者名/発表者名
      山口芳樹
    • 学会等名
      第28回日本糖質学会年会
    • 発表場所
      つくば
    • 年月日
      2008-08-19
  • [図書] Experimental Glycoscience Glycochemistry2008

    • 著者名/発表者名
      Y. Yamaguchi
    • 総ページ数
      3
    • 出版者
      Springer Japan
  • [図書] Experimental Glycoscience Glycochemistry2008

    • 著者名/発表者名
      K. Kato
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      Springer Japan

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公開日: 2010-06-11   更新日: 2016-04-21  

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