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2008 年度 実績報告書

分子モデリングに基づく擬似対称型酵素阻害剤の分子設計

研究課題

研究課題/領域番号 19790100
研究機関京都薬科大学

研究代表者

日高 興士  京都薬科大学, 薬学部, 助手 (30445960)

キーワード酵素阻害剤 / 擬似対称型 / 分子モデリング / 分子設計 / アスパラギン酸プロテアーゼ / HIVプロテアーゼ / プラスメプシン / ヒドロキシメチルカルボニル
研究概要

1. 基質遷移状態概念に基づいたヒドロキシルメチルカルボニル(HMC)を組み込んだHIVプロテアーゼ阻害剤とHIV-1プロテアーゼとの相互作用が、これまでX線結晶構造解析およびNMR解析により推察されていたが、今回、中性子結晶構造解析により水素結合相互作用が明らかにされ、HMCが理想的な基質遷移状態ミミックであることが証明された。そこで、HMC-ヒドラジドを組込んだ擬似対称型化合物のデザイン手法により合成した比較的強いHIVプロテアーゼ阻害活性を示す化合物をリードとして、HIV-1プロテアーゼとの複合体の分子モデリングを構築した。得られた分子間相互作用から、より良い相互作用が得られるように、両N末端部位を構造変換した擬似対称型化合物をデザインした。擬似対称型化合物の合成は、HMCの水酸基を保護する合成経路を確立した。得られた擬似対称型化合物のHIV-1プロテアーゼ阻害活性を評価したところ、nMレベルの阻害活性を示した。
2. アタザナビルのコア構造をHMC-ヒドラジドへと変換した擬似対称型化合物を合成した。HIV-1プロテアーゼ阻害活性の評価より、これらの擬似対称型化合物は有為な阻害活性をもつことが分かった。
3. HMC-ヒドラジドを組込むデザイン手法をマラリア原虫由来のプラスメプシンに応用して、擬似対称型化合物を合成し、プラスメプシンII阻害活性を評価したところ、若干活性は低いが、有為な阻害活性を示した。よって、HMC-ヒドラジドを用いたデザイン手法が、他のアスパラギン酸プロテアーゼにも応用できることが分かった。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2009 2008

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (2件)

  • [雑誌論文] Structure of HIV-1 protease in complex with potent inhibitor KNI-272 determined by high resolution X-ray and neutron crystallography2009

    • 著者名/発表者名
      Motoyasu Adachi
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA 106

      ページ: 4641-4646

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Antimalarial activity enhancement in hydroxymethylcarbonyl(HMC)isostere-based dipeptidomimetics targeting malarial aspartic protease plasmepsin2008

    • 著者名/発表者名
      Koushi Hidaka
    • 雑誌名

      Bioorg. Med. Chem 16

      ページ: 10049-10060

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Combination of Non-natural D-amino acid derivatives and allophenylnorstatine-dimethylthioproline scaffold in HIV protease inhibitors have high efficacy in mutant HIV2008

    • 著者名/発表者名
      Shingo Nakatani
    • 雑誌名

      J. Med. Chem 51

      ページ: 2992-3004

    • 査読あり
  • [学会発表] HIVプロテアーゼ周辺の水分子を標的としたアロフェニルノルスタチン型阻害剤の設計2008

    • 著者名/発表者名
      日高興士、香月紀子、木村徹、木曽良明
    • 学会等名
      第22回日本エイズ学会学術集会
    • 発表場所
      大阪国際交流センター(大阪)
    • 年月日
      20081100
  • [学会発表] プラメプシン阻害剤の抗マラリア活性向上に影響する置換基研究2008

    • 著者名/発表者名
      柏本啓介
    • 学会等名
      第13回病態と治療におけるプロテアーゼとインヒビター学会
    • 発表場所
      千里ライフサイエンスセンター(大阪)
    • 年月日
      20080822-23

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公開日: 2010-06-11   更新日: 2016-04-21  

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