遺伝多型を持つ薬物代謝酵素のリガンド認識機構についての計算機的研究

2008 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 19850019
• 研究種目: 若手研究(スタートアップ)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 物理化学
• 研究機関: 東北薬科大学
• 研究代表者: 小田 彰史 東北薬科大学, 薬学部, 助教 (50433511)
• 研究期間 (年度): 2007 – 2008
• キーワード: 薬物代謝酵素 / 分子シミュレーション / ドラッグデザイン

研究概要

遺伝多型を持つ薬物代謝酵素N-アセチルトランスフェラーゼ2とUDP-グルクロン酸転移酵素1A1についてその立体構造を予測・精密化し、立体構造形成上重要な要素に関する知見や、リガンド認識機構についての知見などを得た。また、それらの計算に必要なプログラムおよびパラメータの開発・評価についても行った。

研究成果

• [雑誌論文] Brownian dynamics simulations of a wild type and mutants of bovine pancreatic trypsin inhibitors (2008)
  • 著者名/発表者名: Akifumi Oda, Noriyuki Yamaotsu, Shuichi Hirono, Ohgi Takahashi
  • 雑誌名: Biological & Pharmaceutical Bulletin 31 ページ: 2182-2186
  • 査読あり
• [雑誌論文] ウリジン二リン酸グルクロン酸転移酵素1A1の立体構造予測 (2008)
  • 著者名/発表者名: 小田彰史, 小林佳奈, 高橋央宜
  • 雑誌名: 東北薬科大学研究誌 55 ページ: 85-90
  • 査読あり
• [学会発表] チオエステル基周辺の構造変化に伴ったエネルギーの変化に関する量子化学的研究 (2008)
  • 著者名/発表者名: 小田彰史, 高橋央宜, 鷹野優
  • 学会等名: 第46回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2008-12-04
• [学会発表] Computational Studies for Ligand Recognition Mechanisms of DrugMetabolizing Enzymes by Using Molecular Simulations (2008)
  • 著者名/発表者名: Akifumi Oda, Kana Kobayashi, Ohgi Takahashi
  • 学会等名: Simulations, The 2nd Taiwan-Japan Young Researchers Conference on Computational and Systems Biology
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2008-11-05
• [学会発表] NAT2の補酵素およびアミノ酸残基がイソニアジドのドッキングに果たす役割についての計算機的研究 (2008)
  • 著者名/発表者名: 小田彰史, 高橋央宜
  • 学会等名: 第36回構造活性相関シンポジウム
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-11-02
• [学会発表] Computational studies for the role of the disulfide bond in UGT1A1 by using homology modeling and molecular dynamics simulations (2008)
  • 著者名/発表者名: Akifumi Oda, Kana Kobayashi, Ohgi Takahashi
  • 学会等名: CBI Annual Meeting 2008 International Symposium
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2008-10-23
• [学会発表] N-アセチルトランスフェラーゼ2の基質認識部位に関する計算化学的検討 (2008)
  • 著者名/発表者名: 小田彰史, 高橋央宜
  • 学会等名: 日本分子生物学会第8回春季シンポジウム
  • 発表場所: 札幌
  • 年月日: 2008-05-26
• [学会発表] 計算化学手法によるスルホンアミド誘導体の立体構造解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 小田彰史、高橋央宜、松崎久夫、鷹野優
  • 学会等名: 日本化学会第88春季年会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2008-03-28
• [学会発表] N-アセチルトランスフェラーゼ2のリガンド認識機構の計算機的検討 (2008)
  • 著者名/発表者名: 小田彰史、高橋央宜、松崎久夫
  • 学会等名: 日本薬学会第128年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2008-03-28
• [学会発表] タンパク質-リガンド複合体予測構造の分子シミュレーションによる評価 (2007)
  • 著者名/発表者名: 小田彰史, 鷹野優, 中村春木, 山乙教之, 広野修一, 高橋央宜, 松崎久夫
  • 学会等名: 日本生物物理学会第45回年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2007-12-21
• [備考]
  • URL: http://www.tohoku-pharm.ac.jp/laboratory/yakuhinb/