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2019 年度 実績報告書

ユビキチン関連経路を介した選択的ミトコンドリア分解の制御機構

研究課題

研究課題/領域番号 19F19816
研究機関大阪大学

研究代表者

岡本 浩二  大阪大学, 生命機能研究科, 准教授 (40455217)

研究分担者 SCHUSTER RAMONA  大阪大学, 生命機能研究科, 外国人特別研究員
研究期間 (年度) 2019-11-08 – 2022-03-31
キーワードミトコンドリア / オートファジー / 翻訳後修飾 / ユビキチン / 出芽酵母
研究実績の概要

余剰または不良ミトコンドリアを丸ごと隔離・除去する仕組みは、単細胞から多細胞の真核生物まで保存された基本的な仕組みであり、細胞の自食作用「オートファジー」を利用していることから、「マイトファジー」と呼ばれている。マイトファジーはミトコンドリアの量や品質の管理に寄与していると示唆されており、ヒトの様々な疾患とも関連していると考えられているが、それらの病態を理解するのに不可欠な分子機構は未だ多くの謎に包まれている。本研究の目的は、出芽酵母のマイトファジーの制御において、ユビキチン関連経路がどのように機能しているかを解明することである。この目的を達成するため、マイトファジーの必須タンパク質Atg32のユビキチン化とその分子基盤を同定し、マイトファジー制御の分子機構を明らかにしてゆく。これまでの研究で、Atg32の一部は小胞体へ局在し、小胞体の膜貫通型ユビキチンE3リガーゼDoa10によってユビキチン化され、プロテアソーム系で分解されることで、タンパク質レベルを負に制御されていることが示唆されている。

そこで本年度では、小胞体への局在がDoa10によるAtg32のユビキチン化に必要であるかどうかについて解析を進めた。その結果、(1)ペルオキシソーム膜へ強制的にアンカーさせたAtg32の変異体(Atg32-pex)はDoa10と相互作用しないこと、(2)Atg32-pexのタンパク質レベルはDoa10欠損で変動しないこと、(3)Atg32-pex変異体によるペルオキシソームの分解はDoa10欠損による影響を受けないことがわかった。これらの知見は、Atg32は小胞体膜上という限られた場において、Doa10によりユビキチン化される可能性を提起している。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

これまでのデータから、Atg32は主にミトコンドリア外膜へ標的化されるが、一部は小胞体へと運ばれ、Doa10によるユビキチン化を受けて分解されると考えられる。この場合、Atg32が小胞体へ局在することが、ユビキチン化の前提条件となる。この仮説を検証するため、異種オルガネラのペルオキシソームへAtg32を人為的にアンカーさせることで(Atg32-pex)、Doa10によるユビキチン化を回避できるかどうかを調べることとした。なお、先行研究で、Atg32-pex変異体がオートファジーによるペルオキシソームの分解(ぺキソファジー)を促進することがわかっている。

上記のAtg32-pex変異体について、マイトファジー誘導条件下でATG32遺伝子のプロモーターにより発現させ、ウェスタン解析により調べた結果、Doa10の有る無しでAtg32のタンパク質レベルに有意な差はないことが明らかとなった。加えて、Atg32-pex変異体が駆動するぺキソファジーの効率は、Doa10の有る無しでほとんど変わらないこともわかった。さらに、同変異体の局在パターンを可視化するため、3コピーのGFPをタギングしたAtg32-3xGFP-pexを構築し、酵母細胞で発現させて、蛍光顕微鏡観察を行なった。その結果、Doa10欠損細胞の野生型Atg32-3xGFPで見られる部分的な小胞体局在は、Atg32-3xGFP-pexについては検出されず、ペルオキシソーム局在のみが観察された。

このように、実験系を工夫することにより、タンパク質の発現レベルや細胞内局在の多角的な解析が可能となっただけでなく、ミトコンドリア外膜タンパク質が小胞体へも局在し、ユビキチン化されるという予想外かつ興味深い発見が裏付けられたことから、本研究計画はおおむね順調に進展していると考えている。

今後の研究の推進方策

真核細胞において、タンパク質へ付加されたユビキチンを切断し、遊離ユビキチンの細胞内プールを一定に保つためのユビキチンプロテアーゼ(DUB)が、細胞の恒常性に重要であることが示唆されている。しかしながら、Atg32に対して、DUBが作用しているのかどうかは、まだ調べられていない。

そこで今後は、酵母マイトファジーにおけるDUBの関与を明らかにしてゆく。具体的な研究計画として、(1)22種類のDUBをコードする遺伝子の破壊株(市販)に対し、マイトファジープローブの発現プラスミドを導入する。同プローブは、マイトファジーによってミトコンドリアが液胞(酵母のリソソーム様オルガネラ)に運ばれると、分解に耐性な赤色蛍光タンパク質(mCherry)が遊離・蓄積するため、マイトファジーを定量解析できる。(2)前述の形質転換体をマイトファジー誘導条件で培養し、細胞抽出液を調製、タンパク質をSDS-ポリアクリルアミドゲル電気泳動で分離した後にウェスタンブロッティングを行い、mCherry抗体を用いて遊離mCherryを検出する。(3)野生株と比較して遊離mCherryの蓄積が抑制されている遺伝子破壊株について、他のオートファジー関連経路に影響があるかどうか調べ、マイトファジー関連DUBを同定する。(4)同DUB欠損株におけるAtg32の発現プロファイルを調べるとともに、局在やタンパク質間相互作用を解析してゆく。

  • 研究成果

    (8件)

すべて 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 2件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (3件) (うち国際学会 2件、 招待講演 3件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] ジョンンズホプキンス大学(米国)

    • 国名
      米国
    • 外国機関名
      ジョンンズホプキンス大学
  • [雑誌論文] Detection of mitophagy in mammalian cells, mice, and yeast2020

    • 著者名/発表者名
      Calvelli Hannah、Krigman Judith、Onishi Mashun、Narendra Derek P.、Sun Nuo、Okamoto Koji
    • 雑誌名

      Methods in Cell Biology

      巻: 155 ページ: 557~579

    • DOI

      10.1016/bs.mcb.2019.10.006

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Repression of mitochondrial metabolism for cytosolic pyruvate-derived chemical production in Saccharomyces cerevisiae2019

    • 著者名/発表者名
      Morita Keisuke、Matsuda Fumio、Okamoto Koji、Ishii Jun、Kondo Akihiko、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Microbial Cell Factories

      巻: 18 ページ: 177

    • DOI

      10.1186/s12934-019-1226-6

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The Paf1 complex transcriptionally regulates the mitochondrial-anchored protein Atg32 leading to activation of mitophagy2019

    • 著者名/発表者名
      Zheng Liangde、Shu Wen-Jie、Li Yu-Min、Mari Muriel、Yan Chaojun、Wang Dehe、Yin Zhao-Hong、Jiang Wei、Zhou Yu、Okamoto Koji、Reggiori Fulvio、Klionsky Daniel J.、Song Zhiyin、Du Hai-Ning
    • 雑誌名

      Autophagy

      巻: 19 ページ: 1~14

    • DOI

      10.1080/15548627.2019.1668228

    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] Regulation of mitophagy via endoplasmic reticulum membrane-bound factors2019

    • 著者名/発表者名
      Okamoto Koji
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Asia Conference on Mitochondria & Metabolism in Health and Disease
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Regulation of mitochondrial clearance via factors on the endoplasmic reticulum2019

    • 著者名/発表者名
      Okamoto Koji
    • 学会等名
      The 16th Conference of Asian Society for Mitochondrial Research and Medicine
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] The TORC1 signaling pathway regulates respiration-induced mitophagy in yeast2019

    • 著者名/発表者名
      Okamoto Koji
    • 学会等名
      第19回日本蛋白質科学会年会 第71回日本細胞生物学会大会 合同年次大会
    • 招待講演
  • [備考] 研究室ホームページ

    • URL

      http://www.fbs.osaka-u.ac.jp/labs/okamoto/Okamoto_Lab/

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公開日: 2021-01-27  

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