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2019 年度 実績報告書

比較ゲノム解析とインビトロ吸器培養系を活用した寄生植物組織接続機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 19H00944
研究機関大阪府立大学

研究代表者

青木 考  大阪府立大学, 生命環境科学研究科, 教授 (30344021)

研究分担者 星野 敦  基礎生物学研究所, 多様性生物学研究室, 助教 (80312205)
横山 隆亮  東北大学, 生命科学研究科, 講師 (90302083)
研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2023-03-31
キーワード寄生植物 / ネナシカズラ / 探索糸 / 比較ゲノム / インビトロ吸器培養系
研究実績の概要

宿主表面で寄生植物が付着器を形成する仕組みを明らかにするために、アメリカネナシカズラ遺伝子CcJKD、CcGL2の発現抑制をするトランスサイレンシング法を行なうためのトリガーamiRNA発現宿主植物を確立した。このamiRNA発現宿主植物を利用して、期待通りCcJKDの発現を抑制することができ、その他の表皮遺伝子発現への波及効果を調べたところ表皮形態形成に関わるCcGL3、CcTTG1、CcWER等の遺伝子発現が減少しており、CcGL2も減少していることが明らかとなった。CcGL2を標的としたamiRNA発現宿主植物に対してもアメリカネナシカズラを寄生させ、同様の遺伝子発現解析を進めている。この結果からJKDという、シロイヌナズナ根では皮層で機能する遺伝子が、アメリカネナシカズラ寄生では表皮形態形成に働いていることが示唆された。このCcJKD発現抑制アメリカネナシカズラのトランスクリプトーム解析が新学術領域「先進ゲノム支援」公募に採択され、2020年度予定の発現抑制系統トランスクリプトームシークエンシングを前倒しで行うことができた。また研近縁モデル植物であるアサガオとの比較ゲノム解析については、こちらについても巻付く相手に接触した後の比較トランスクリプトームシークエンシングを新学術領域「先進ゲノム支援」公募解析として実施した。また研究分担者(星野)が、アサガオのJKD、GL2を安定に発現抑制したアサガオ遺伝子組換え系統の作成に着手し、植物体の作製が進行中である。インビトロ吸器培養系については、探索糸伸長が進まない条件ならびに探索糸分化が進まない条件を確定した。それらを用いて、宿主由来因子の探索に着手した。このため島津製作所の分取HPLCシステムを購入した。研究分担者(横山)が葉への寄生誘導系を樹立した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

当初計画にあった遺伝子発現抑制系の構築、インビトロ吸器培養系を用いた宿主因子探索に着手、トランスクリプトームシークエンシングの前倒し実施などは、計画よりも少し進んで実施することができた。一方で、サイトカイニンアンタゴニストを使用した実験を実施しなかったこと等が遅れている点となる。しかしながら、研究全体の必要性に鑑み、サイトカイニンアンタゴニストS-4893を用いた実験は割愛してよいかと考えており、その分のエフォートを新規宿主因子探索に割く予定をしている。以上のように、プラス面マイナス面を考慮し、おおむね順調に進展していると判断する。

今後の研究の推進方策

2020年度は、項目1「宿主表面への付着」に関しては2019年度に実施したトランスクリプトームシークエンシングに基づき、そのデータ解析を行なうことで付着器の形成に関わるアメリカネナシカズラ遺伝子群を更に候補化する。特にCcGL2の下流で機能する遺伝子群の候補化を目指す。2019年度に作製を始めたアサガオ遺伝子発現抑制系統を確立し、そこへアメリカネナシカズラ遺伝子を導入していく研究に着手する。項目2「吸器形成機構」に関しては、側生器官形成遺伝子群の発現プロファイルを調べるとともに、更に上流に位置すると思われる機械的刺激受容系に関する遺伝子機能解析を行なっていく予定である。項目3の「宿主因子」においては、インビトロ吸器培養系を用いたバイオアッセイによって、分画した宿主抽出物の探索糸伸長および探索糸分化に対する効果を評価し、それらの過程を促進する因子を含む画分の同定を進めたい。こちらに注力するために、サイトカイニンアンタゴニストS-4893を用いた形質評価実験は割愛する、という計画変更を行なう。項目4「宿主とつながる過程」については、インビトロ吸器培養系で伸長した探索糸細胞の内容物をサンプリングする方法を探索し、探索糸細胞のトランスクリプトーム解析に持ち込む方法を吟味する。並行して、探索糸細胞内容物サンプリングの見通しが立たない場合は、吸器領域での幹細胞マーカー遺伝子群の解析を実施し、探索糸細胞の性格付けを実施することを考える計画である。

備考

2020年1月30日放送のNHK Eテレ「植物に学ぶ生存戦略3 話す人・山田孝之」に取材協力(青木考)資料提供(横山隆亮)を行なった。2月1日と2月13日に再放送。

  • 研究成果

    (26件)

すべて 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (9件) (うち査読あり 5件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (13件) (うち国際学会 3件、 招待講演 3件) 備考 (3件)

  • [国際共同研究] Virginia Tech(米国)

    • 国名
      米国
    • 外国機関名
      Virginia Tech
  • [雑誌論文] A conserved strategy of chalcone isomerase-like protein to rectify promiscuous chalcone synthase specificity.2020

    • 著者名/発表者名
      Toshiiyuki Waki, Ryo Mameda, Takuya Nakano, Sayumi Yamada, Miho Terashita, Keisuke Ito, Natsuki Tenma, Yanbing Li, Naoto Fujino, Kaichi Uno et al.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 11 ページ: 870

    • DOI

      10.1038/s41467-020-14558-9

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Interspecific Signaling Between the Parasitic Plant and the Host Plants Regulate Xylem Vessel Cell Differentiation in Haustoria of Cuscuta campestris.2020

    • 著者名/発表者名
      Takashi Ishida, Reira Suzuki, Satoru Nakagami, Takeshi Kuroha, Shingo Sakamoto, Miyuki T. Nakata, Ryusuke Yokoyama, Seisuke Kimura, Nobutaka Mitsuda, Kazuhiko Nishitani & Shinichiro Sawa
    • 雑誌名

      Frontiers in Plant Science

      巻: 11 ページ: 193

    • DOI

      10.3389/fpls.2020.00193

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] つながる「つる」-茎寄生植物ネナシカズラがつくる植物-植物コネクション2019

    • 著者名/発表者名
      青木考、藤原大輝、清水皇稀
    • 雑誌名

      日本生態学会誌

      巻: 69 ページ: 99-107

    • DOI

      doi.org/10.18960/seitai.69.2_99

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Development of Parasitic Organs of a Stem Holoparasitic Plant in Genus Cuscuta.2019

    • 著者名/発表者名
      Kohki Shimizu, Koh Aoki
    • 雑誌名

      Frontiers in Plant Science

      巻: 10 ページ: 1435

    • DOI

      doi: 10.3389/fpls.2019.01435

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Generation of yellow flowers of the Japanese morning glory by engineering its flavonoid biosynthetic pathway toward aurones.2019

    • 著者名/発表者名
      Atsushi Hoshino, Takayuki Mizuno, Keiichi Shimizu, Shoko Mori, Sachiko Fukada-Tanaka, Kazuhiko Furukawa, Kanako Ishiguro, Yoshikazu Tanaka, Shigeru Iida
    • 雑誌名

      Plant and Cell Physiology

      巻: 60 ページ: 1871-1879

    • DOI

      10.1093/pcp/pcz101

    • 査読あり
  • [雑誌論文] バイオテクノロジーで幻の黄色いアサガオを再現する2019

    • 著者名/発表者名
      星野敦
    • 雑誌名

      バイオサイエンスとインダストリー

      巻: 77 ページ: 464-465

  • [雑誌論文] アサガオの多様な変異体リソースと高精度ゲノム情報2019

    • 著者名/発表者名
      仁田坂英二,星野敦
    • 雑誌名

      BSJ-Review(植物科学の最前線)

      巻: 10 ページ: 169-178

    • DOI

      10.24480/bsj-review.10c8.00168

    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] 植物細胞壁の機能的構造とダイナミクス2019

    • 著者名/発表者名
      横山隆亮
    • 雑誌名

      アグリバイオ

      巻: 3 ページ: 476-480

  • [雑誌論文] 茎寄生植物ネナシカズラの寄生分子機構2019

    • 著者名/発表者名
      横山隆亮
    • 雑誌名

      アグリバイオ

      巻: 3 ページ: 963-966

  • [学会発表] Differential regulation of RNA unloading from phloem2020

    • 著者名/発表者名
      Koh Aoki, Subhankar Bera, Kohki Shimizu
    • 学会等名
      第61回日本植物生理学会年会
    • 招待講演
  • [学会発表] Mechanosensitive channel genes of a stem parasitic plant, Cuscuta campestris , and their expression during haustorium initiation2020

    • 著者名/発表者名
      Jihwan Park, Koh Aoki
    • 学会等名
      第61回日本植物生理学会年会
  • [学会発表] 寄生時に起こる寄生部位での宿主植物の細胞分裂関連と維管束関連遺伝子の発現増加は宿主の組織 癒合に起因しない2020

    • 著者名/発表者名
      山本祥太,青木考
    • 学会等名
      第61回日本植物生理学会年会
  • [学会発表] トマト野生近縁種Solanum pennelliiを用いた根寄生植物Phelipanche aegyptiacaへの発芽後抵抗性 を示す遺伝子の候補化2020

    • 著者名/発表者名
      斉藤純奈,青木考
    • 学会等名
      第61回日本植物生理学会年会
  • [学会発表] 茎寄生植物ネナシカズラにおける宿主由来GUS:tRNA-like sequences mRNAの長距離移行と翻訳2020

    • 著者名/発表者名
      清水皇稀,青木考
    • 学会等名
      第61回日本植物生理学会年会
  • [学会発表] Epidermal cell-patterning genes are involved in the holdfast formation of a stem parasitic plant, Cuscuta campestris2020

    • 著者名/発表者名
      Sabrina Sultana, Daiki Fujiwara, Koh Aoki
    • 学会等名
      第61回日本植物生理学会年会
  • [学会発表] 茎寄生植物アメリカネナシカズラ探索糸のsemi-in vitro生育方法の確立2020

    • 著者名/発表者名
      高垣友祐,青木考
    • 学会等名
      第61回日本植物生理学会年会
  • [学会発表] Bi-directional movement of mobile small RNA influence common physiological changes in different host-parasitic plant complexes2020

    • 著者名/発表者名
      Subhankar Bera, Kohki Shimizu, Keisuke Tanaka, Shunsuke Yajima, Katsushi Yamaguchi, Shuji Shigenobu, Koh Aoki
    • 学会等名
      第61回日本植物生理学会年会
  • [学会発表] Differentiation of vascular conducting cells in haustoria of parasitic plants2019

    • 著者名/発表者名
      Koh Aoki
    • 学会等名
      Plant Vascular Biology 2019
    • 国際学会
  • [学会発表] Implication of mobile small RNAs to control the common physiology of different host-parasitic plant complexes2019

    • 著者名/発表者名
      Subhankar Bera, Kohki Shimizu, Keisuke Tanaka, Shunsuke Yajima, Katsushi Yamaguchi, Shuji Shigenobu, Koh Aoki
    • 学会等名
      Plant Vascular Biology 2019
    • 国際学会
  • [学会発表] Interspecific long-distance movement of Cuscuta small RNAs control biological processes in host-parasitic plant complex2019

    • 著者名/発表者名
      Subhankar Bera, Kohki Shimizu, Keisuke Tanaka, Shunsuke Yajima, Katsushi Yamaguchi, Shuji Shigenobu, Koh Aoki
    • 学会等名
      15th World Congress on Parasitic Plants
    • 国際学会
  • [学会発表] アサガオのエピジェネティクスによる模様形成と経世代伝達2019

    • 著者名/発表者名
      星野敦
    • 学会等名
      日本進化学会第21回大会
    • 招待講演
  • [学会発表] 炭素イオンビームによる寄生植物アメリカネナシカズラの変異体ライブラリ作製と吸器形成に関連する変異体スクリーニング法の開発2019

    • 著者名/発表者名
      横山隆亮,加賀悠樹,篠原直貴,西谷和彦,佐藤勝也,大野 豊
    • 学会等名
      QST高崎サイエンスフェスタ2019
    • 招待講演
  • [備考] 大阪府立大学機能ゲノム科学研究グループ

    • URL

      https://www.kohaokilab.com/

  • [備考] 基礎生物学研究所多様性生物学研究室星野グループ

    • URL

      http://www.nibb.ac.jp/hoshino/

  • [備考] 進化ゲノミクス分野牧野研究室

    • URL

      https://www.lifesci.tohoku.ac.jp/evolgenomics/

URL: 

公開日: 2021-01-27  

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