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2019 年度 実績報告書

先端計測アプローチの統合による抗体の構造動態と機能発現の連関機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 19H01017
研究機関名古屋市立大学

研究代表者

加藤 晃一  名古屋市立大学, 大学院薬学研究科, 教授 (20211849)

研究分担者 矢木 真穂  大学共同利用機関法人自然科学研究機構(新分野創成センター、アストロバイオロジーセンター、生命創成探究, 生命創成探究センター, 助教 (40608999)
谷中 冴子  分子科学研究所, 生命・錯体分子科学研究領域, 助教 (80722777)
研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2023-03-31
キーワード抗体 / 動的立体構造 / 相互作用 / Fc受容体 / 補体
研究実績の概要

初年度は、免疫グロブリンG(IgG)のFc領域について、水中における全原子分子動力学(MD)シミュレーションを実施し、X線小角散乱と核磁気共鳴(NMR)の実験計測データと照らし合わせることにより、その結果を検証した。これにより、従来の結晶構造解析では得ることが困難であった、水溶液中におけるFcの動的な描像を得ることができた。特に、エフェクター機能の発現に重要な糖鎖の存在に着目してFcの動的構造アンサンブルを精査したところ、フコース残基の有無によってFcの局所構造ダイナミクスが変化し、Fcγ受容体(FcγR)との相互作用に影響を及ぼすことが示された。このことは、IgGの脱フコシル化によって、FcγRⅢaとの相互作用を介した細胞傷害活性の劇的な向上がもたらされる仕組みと関わっているものと考えられる。
実験的アプローチにおいては、全長IgG分子とFcγRの相互作用を質量分析による重水素交換実験を通じて探査した。また、FcγRが細胞膜上において機能していることを考慮して、C末端領域を通じて基板上に固定化されたFcγRを調製し、それらとIgGがダイナミックに相互作用する様子を高速原子間力顕微鏡(HS-AFM)を用いてリアルタイムで観察し、定量化することに成功した。その結果、IgG1のFab領域がFcγRⅢaとの相互作用に寄与していることが判明し、両者の新たな相互作用部位を見出すことができた。さらに、脂質膜上の抗原を認識したIgGがFc領域を介してリング状の6量体構造を自発形成して補体成分C1qと相互作用する様子をHS-AFMで可視化・定量化を行い、リング形成に関わる部位を絞りこみつつある。
一方、抗体が本来機能する場である血液中における分子間相互作用の実態解明に向けて、夾雑不均一環境におかれたIgGのNMR信号を選択的に観測するための安定同位体標識技術の開発に着手した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

本年度の研究成果は、既に3報の論文として国際誌に発表し、プレスリリースなども実施している。成果の一部は新聞報道され、インターネットを通じての海外のメディア配信も順調である。こうした研究の成果には産業界からも関心が持たれており、新たな共同研究へと展開されつつある。また、本研究を遂行する過程でFcとそれを認識する分子との複合体の立体構造が新規に決定されるなど、当初の計画を超えた実験データも得られた。以上に鑑みて、研究は当初の計画以上に進展していると判断した。

今後の研究の推進方策

IgGのFc領域を対象に、その3次元構造ダイナミクスの解析を継続する。次年度は、Fc領域の4次構造ダイナミクスに糖鎖が及ぼす影響を精査するために、糖鎖非還元末端の構造が異なるFcについて、NMR法とMD計算を用いた動的構造解析に取り組む。NMR計測には糖鎖およびポリペプチド鎖に安定同位体標識を施したマウスおよびヒトのFc試料の調製を必要とする。そのため、真核生物発現系を利用した同位体標識技術と高磁場NMR計測技術の改良を行い、効率的な試料調製とスペクトル解析を実現する。このようしてFc領域全域にプローブを張り巡らせることで、NMRを用いた原子レベルでの動的構造解析の基盤を整える。
一方、抗体分子全体の巨視的構造情報を得るために、溶液散乱法とHS-AFMを利用した計測を引き続き行う。溶液散乱については、特にFc受容体と相互作用しているIgGの構造情報を得るために、重水素標識によるコントラストマッチングを活用した中性子小角散乱のデータを取得する。また、MDシミュレーションの対象を全長IgGに拡張する準備を進める。
上記のように、今年度の研究成果を通じて、膜上で抗原と特異的に結合したIgGがFc領域間の相互作用を介して自発的に6量体リング構造を形成すること、そしてIgGのFab領域の中にもFc受容体と相互作用する部位が存在することが明らかとなっている。次年度は高機能化抗体の創成に向けて、これらの新規相互作用を担う部位に改変を施して、HS-AFM等による性状評価を行う。抗体依存性細胞介在性細胞傷害活性を指標とした機能評価の準備も進める。
抗体の分子間相互作用をin situにおいてキャラクタライズするために、血清中におかれたヒトIgGのNMR信号の観測を行う。得られた成果に基づいて、抗体と血清成分の相互作用の実態解明を進める。

  • 研究成果

    (33件)

すべて 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (6件) 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 2件、 査読あり 7件、 オープンアクセス 6件) 学会発表 (16件) (うち国際学会 5件、 招待講演 8件) 図書 (2件) 備考 (2件)

  • [国際共同研究] NIST/Boston University School of Medicine/University of Georgia(米国)

    • 国名
      米国
    • 外国機関名
      NIST/Boston University School of Medicine/University of Georgia
    • 他の機関数
      46
  • [国際共同研究] Max Planck Institute/University of Hamburg/University of Tuebingen(ドイツ)

    • 国名
      ドイツ
    • 外国機関名
      Max Planck Institute/University of Hamburg/University of Tuebingen
    • 他の機関数
      6
  • [国際共同研究] NIBSC/Ludger Limited/AstraZeneca(英国)

    • 国名
      英国
    • 外国機関名
      NIBSC/Ludger Limited/AstraZeneca
    • 他の機関数
      2
  • [国際共同研究] Centre d'Immunologie Pierre Fabre/Proteodynamics/University of Strasbo(フランス)

    • 国名
      フランス
    • 外国機関名
      Centre d'Immunologie Pierre Fabre/Proteodynamics/University of Strasbo
  • [国際共同研究] Institute of Computing Technology/Institute of Biophysics(中国)

    • 国名
      中国
    • 外国機関名
      Institute of Computing Technology/Institute of Biophysics
  • [国際共同研究]

    • 他の国数
      17
  • [雑誌論文] 抗体に秘められた結合部位の発見 ― 免疫分子の働く姿をリアルタイムで観測!2020

    • 著者名/発表者名
      加藤晃一, 與語理那
    • 雑誌名

      academist Journal

      巻: - ページ: -

    • 査読あり
  • [雑誌論文] On-Membrane Dynamic Interplay between Anti-GM1 IgG Antibodies and Complement Component C1q2019

    • 著者名/発表者名
      Yanaka Saeko、Yogo Rina、Watanabe Hiroki、Taniguchi Yuki、Satoh Tadashi、Komura Naoko、Ando Hiromune、Yagi Hirokazu、Yuki Nobuhiro、Uchihashi Takayuki、Kato Koichi
    • 雑誌名

      International Journal of Molecular Sciences

      巻: 21 ページ: 147~147

    • DOI

      10.3390/ijms21010147

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Enabling adoption of 2D-NMR for the higher order structure assessment of monoclonal antibody therapeutics2019

    • 著者名/発表者名
      Brinson Robert G et al.
    • 雑誌名

      mAbs

      巻: 11 ページ: 94~105

    • DOI

      10.1080/19420862.2018.1544454

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Dynamic Views of the Fc Region of Immunoglobulin G Provided by Experimental and Computational Observations2019

    • 著者名/発表者名
      Yanaka Saeko、Yogo Rina、Inoue Rintaro、Sugiyama Masaaki、Itoh Satoru G.、Okumura Hisashi、Miyanoiri Yohei、Yagi Hirokazu、Satoh Tadashi、Yamaguchi Takumi、Kato Koichi
    • 雑誌名

      Antibodies

      巻: 8 ページ: 39~39

    • DOI

      10.3390/antib8030039

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The Fab portion of immunoglobulin G contributes to its binding to Fcγ receptor Ⅲ2019

    • 著者名/発表者名
      Yogo Rina、Yamaguchi Yuki、Watanabe Hiroki、Yagi Hirokazu、Satoh Tadashi、Nakanishi Mahito、Onitsuka Masayoshi、Omasa Takeshi、Shimada Mari、Maruno Takahiro、Torisu Tetsuo、Watanabe Shio、Higo Daisuke、Uchihashi Takayuki、Yanaka Saeko、Uchiyama Susumu、Kato Koichi
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 9 ページ: 11957

    • DOI

      10.1038/s41598-019-48323-w

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Newly developed Laboratory-based Size exclusion chromatography Small-angle x-ray scattering System (La-SSS)2019

    • 著者名/発表者名
      Inoue Rintaro、Nakagawa Tatsuo、Morishima Ken、Sato Nobuhiro、Okuda Aya、Urade Reiko、Yogo Rina、Yanaka Saeko、Yagi-Utsumi Maho、Kato Koichi、Omoto Kazuki、Ito Kazuki、Sugiyama Masaaki
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 9 ページ: 12610

    • DOI

      10.1038/s41598-019-48911-w

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] NIST Interlaboratory Study on Glycosylation Analysis of Monoclonal Antibodies: Comparison of Results from Diverse Analytical Methods2019

    • 著者名/発表者名
      De Leoz Maria Lorna A. et al.
    • 雑誌名

      Molecular & Cellular Proteomics

      巻: 19 ページ: 11~30

    • DOI

      10.1074/mcp.RA119.001677

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] IgG のフコシル化による Fc のタイナミクスの変化か Fcγ受容体との相互 作用に及ほす影響2019

    • 著者名/発表者名
      谷中冴子,與語理那,矢木宏和,伊藤 暁,奥村久士,山口拓実,加藤晃一
    • 学会等名
      第19回日本蛋白質科学会年会、第71回日本細胞生物学会大会 合同年次大会
  • [学会発表] Experimental and Computational Approaches for Elucidating Glycofunctional Mechanisms2019

    • 著者名/発表者名
      Koichi Kato
    • 学会等名
      The 23rd International Annual Symposium on Computational Science and Engineering: Expanding Your Mind
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] NMR characterization of dynamic conformations and interactions of functional oligosaccharides and antibody glycoproteins2019

    • 著者名/発表者名
      Koichi Kato, Tatsuya Suzuki, Rina Yogo, Maho Yagi-Utsumi, Hirokazu Yagi, Tadashi Satoh, Takumi Yamaguchi, and Saeko Yanaka
    • 学会等名
      8th Asia-Pacific NMR Symposium
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Dynamic Views of the Fc Portion of Immunoglobulin G Provided by Experimental and Computational Observations2019

    • 著者名/発表者名
      Saeko Yanaka, Rina Yogo, Rintaro Inoue, Masaaki Sugiyama, Satoru G. Itoh, Hisashi Okumura, Yohei Miyanoiri, Hirokazu Yagi, Tadashi Satoh, Takumi Yamaguchi and Koichi Kato
    • 学会等名
      Frontier Bioorganization Forum 2019
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 安定同位体標識を利用したNMRによる抗体の動的構造解析2019

    • 著者名/発表者名
      與語理那,谷中冴子,矢木宏和,加藤晃一
    • 学会等名
      第20回 若手NMR研究会
  • [学会発表] 令和初めての夏に想う、抗体のNMRから学んだこと2019

    • 著者名/発表者名
      加藤晃一
    • 学会等名
      第20回若手NMR研究会
    • 招待講演
  • [学会発表] 構造学的なアプローチによる 細胞外O-GlcNAc 修飾の分子機能解析2019

    • 著者名/発表者名
      小川光貴,矢木宏和,田嶌優子,妹尾勇弥,池田和貴,加藤晃一,竹内英之,岡島徹也
    • 学会等名
      第38回 日本糖質学会年会
  • [学会発表] 抗体の構造研究から学ぶ、研究者ってどんな職業?2019

    • 著者名/発表者名
      谷中冴子
    • 学会等名
      中高生のための未来教室‐ホンネで語るライフサイエンスの道!
    • 招待講演
  • [学会発表] Dynamic Views of Structures and Interactions of Antibodies2019

    • 著者名/発表者名
      Koichi Kato, Rina Yogo, Hirokazu Yagi, and Saeko Yanaka
    • 学会等名
      The 10th Toyota RIKEN International Workshop on Science of Life Phenomena Woven by Water and Biomolecules
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Experimental and computational observations of the dynamics of the Fc region of immunoglobulin G2019

    • 著者名/発表者名
      Saeko Yanaka
    • 学会等名
      Satellite meeting for PF Workshop“Marriage of Computational and Experimental Techniques for Solution Small-angle Scattering”
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] IgGとFc受容体の相互作用におけるFab領域の新規結合部位の同定2019

    • 著者名/発表者名
      與語理那
    • 学会等名
      第92回 日本生化学会大会
  • [学会発表] Dynamic structures and interactions of antibodies under physiologically relevant conditions2019

    • 著者名/発表者名
      Saeko Yanaka, Rina Yogo, Hirokazu Yagi, and Koichi Kato
    • 学会等名
      第57回 日本生物物理学会年会
  • [学会発表] Lessons Learned from Antibody NMR2019

    • 著者名/発表者名
      Koichi Kato
    • 学会等名
      The 58th Annual Meeting of the Nuclear Magnetic Resonance Society of Japan
    • 招待講演
  • [学会発表] Observation of dynamical orchestration of antibodies2019

    • 著者名/発表者名
      Saeko Yanaka, Rina Yogo, Hiroki Watanabe, Satoru G. Itoh, Hirokazu Yagi, Susumu Uchiyama, Hisashi Okumura, Takayuki Uchihashi, Koichi Kato
    • 学会等名
      The 2nd ExCELLS symposium
  • [学会発表] 安定同位体標識を利用したNMRによる抗体の「品質」の解析2019

    • 著者名/発表者名
      谷中冴子,與語理那,矢木宏和,加藤晃一
    • 学会等名
      第42回 日本分子生物学会年会
  • [学会発表] HDX-MSによる抗体とFc受容体の相互作用解析2019

    • 著者名/発表者名
      山口祐希,與語理那,矢木宏和,佐藤匡史,中西真人,嶋田麻里,丸野孝浩,鳥巣哲生,渡邊史生, 肥後大輔,谷中冴子,加藤晃一,内山 進
    • 学会等名
      第42回 日本分子物学会年会
  • [図書] 糖鎖生物学2020

    • 著者名/発表者名
      北島 健、佐藤 ちひろ、門松 健治、加藤 晃一
    • 総ページ数
      306
    • 出版者
      名古屋大学出版会
    • ISBN
      978-4-8158-0981-2
  • [図書] 医薬品開発における創薬スクリーニング関連技術開発2019

    • 著者名/発表者名
      浅井章良 他
    • 総ページ数
      278
    • 出版者
      情報機構
    • ISBN
      978-4-86502-180-6
  • [備考] EurekAlert!

    • URL

      https://www.eurekalert.org/pub_releases/2020-01/nion-aga010620.php

  • [備考] 免疫学の常識を覆す!抗体と受容体の新たな結合部位の発見

    • URL

      http://www.excells.orion.ac.jp/pr/20190816pr.html

URL: 

公開日: 2021-01-27  

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